(Rpr) Rickettsia prowazekii
generin.cgi	Functional categories
	Fun	All	J	A	K	L	B	D	Y	V	T	M	N	Z	W	U	O	C	G	E	F	H	I	P	Q	R	S
	COGs	647	122	-	22	53	-	12	-	6	11	64	2	-	-	29	42	65	15	27	17	26	28	26	10	63	47
	proteins	743	127	-	25	59	-	14	-	9	15	76	2	-	-	37	52	77	28	43	17	26	31	41	16	92	48
	Distribution of COGs by number of proteins
	proteins	1	2	3	4	5	6	14
	COGs	583	52	6	2	2	1	1

Co-ocurrences in sister taxa	0	1
order Rickettsiales	5	642

+    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    ++    +
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||| 14    [G    E    P    R]    COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  6    [Q    R]    COG0500 SAM-dependent methyltransferases
---------------|------||----------------------------|-----------||  5    [C]    COG3202 ATP/ADP translocase
----------------------------------------------------|------|||||||  5    [U]    COG3704 Type IV secretory pathway, VirB6 components
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4    [M]    COG0438 Glycosyltransferase
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4    [V]    COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3    [O]    COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  3    [O]    COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  3    [M]    COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3    [T]    COG0642 Signal transduction histidine kinase
||||-||||-|||----|||-|----|||-----||||----|||-|-||---------|||--||  3    [C    P]    COG0651 Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [L]    COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  2    [J]    COG0130 Pseudouridine synthase
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
---|---------||---||----------------------||||||||||||||---|||||||  2    [T]    COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown)
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  2    [C]    COG0280 Phosphotransacetylase
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  2    [S]    COG0316 Uncharacterized conserved protein
-------------|----||------|||||-----------|||||-|||||------|||||||  2    [J]    COG0349 Ribonuclease D
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0443 Molecular chaperone
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  2    [M]    COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0492 Thioredoxin reductase
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2    [C]    COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [O    C]    COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  2    [E]    COG0531 Amino acid transporters
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [K]    COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  2    [E    R]    COG0591 Na+/proline symporter
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  2    [O    U]    COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0621 2-methylthioadenine synthetase
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  2    [R]    COG0661 Predicted unusual protein kinase
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  2    [R]    COG0666 FOG: Ankyrin repeat
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  2    [R]    COG0679 Predicted permeases
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  2    [L]    COG0708 Exonuclease III
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [C]    COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [T    K]    COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [D]    COG0772 Bacterial cell division membrane protein
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0795 Predicted permeases
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [M]    COG0845 Membrane-fusion protein
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [I    Q    R]    COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  2    [E]    COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  2    [D]    COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2    [C]    COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  2    [K]    COG1396 Predicted transcriptional regulators
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  2    [O]    COG1651 Protein-disulfide isomerase
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  2    [R]    COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
--------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------||||||||  2    [R]    COG2071 Predicted glutamine amidotransferases
-----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-||||  2    [R]    COG2373 Large extracellular alpha-helical protein
--------|---------|--------|||------------------||-----|---||-||||  2    [I]    COG3243 Poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase
------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---|||||||  2    [C]    COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit
---|--------------------------|--------|------|-----|--|||-|||||||  2    [U]    COG3451 Type IV secretory pathway, VirB4 components
--------------------|----------|-|----------------|-------------||  2    [M]    COG3475 LPS biosynthesis protein
----------------------------------------------------|--|||-|||||||  2    [U]    COG3504 Type IV secretory pathway, VirB9 components
------------------------------------------|||||---||-||----|||||||  2    [M]    COG3637 Opacity protein and related surface antigens
----------------------------------------------------|---||-||||-||  2    [U]    COG3736 Type IV secretory pathway, component VirB8
--------------------|------------------------------|-||---------||  2    [R]    COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1    [C]    COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0024 Methionine aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1    [C]    COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [J]    COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1    [H]    COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0049 Ribosomal protein S7
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0050 GTPases - translation elongation factors
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0052 Ribosomal protein S2
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  1    [P]    COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [G]    COG0061 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
|||||||||||||||-||||-|-----||||---|-||----||||||||--|--|---|||||||  1    [O]    COG0071 Molecular chaperone (small heat shock protein)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0073 EMAP domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0081 Ribosomal protein L1
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0103 Ribosomal protein S9
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [F]    COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
---|||--|-|||||-|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1    [O]    COG0109 Polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0114 Fumarase
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [E    H]    COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0125 Thymidylate kinase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [F]    COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  1    [J]    COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1    [H]    COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0164 Ribonuclease HII
|||-|||||||--||||-||----||--------------------------------------||  1    [I]    COG0170 Dolichol kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0174 Glutamine synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  1    [I]    COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0186 Ribosomal protein S17
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1    [H]    COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0195 Transcription elongation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0203 Ribosomal protein L17
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0206 Cell division GTPase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1    [F]    COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0218 Predicted GTPase
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0228 Ribosomal protein S16
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
------------------|--|----||||-----|------|||||-||||---|---|||||||  1    [F]    COG0232 dGTP triphosphohydrolase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  1    [G]    COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0238 Ribosomal protein S18
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0244 Ribosomal protein L10
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1    [F    P]    COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0250 Transcription antiterminator
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1    [E]    COG0260 Leucyl aminopeptidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0261 Ribosomal protein L21
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0264 Translation elongation factor Ts
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0268 Ribosomal protein S20
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---|||||||  1    [O]    COG0278 Glutaredoxin-related protein
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0281 Malic enzyme
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  1    [C]    COG0282 Acetate kinase
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1    [F]    COG0283 Cytidylate kinase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0285 Folylpolyglutamate synthase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0292 Ribosomal protein L20
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG0293 23S rRNA methylase
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1    [H]    COG0302 GTP cyclohydrolase I
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0305 Replicative DNA helicase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0313 Predicted methyltransferases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [I    Q]    COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1    [H]    COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1    [H]    COG0321 Lipoate-protein ligase B
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
-------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-||  1    [O]    COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0328 Ribonuclease HI
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E    M]    COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0333 Ribosomal protein L32
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1    [R]    COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [C]    COG0372 Citrate synthase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----||  1    [M]    COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
-------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-||  1    [R]    COG0400 Predicted esterase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
-------------||---||----------------------|||||-||--|--|---|||||||  1    [H]    COG0408 Coproporphyrinogen III oxidase
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [D]    COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1    [O]    COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [R]    COG0457 FOG: TPR repeat
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0468 RecA/RadA recombinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0470 ATPase involved in DNA replication
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  1    [C    E]    COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1    [P]    COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  1    [G]    COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0486 Predicted GTPase
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [D]    COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
--|-||||--|-|||||||--|--|-||||||--||||----|||||-||--|--|--||||||||  1    [E    R]    COG0493 NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L    R]    COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0497 ATPase involved in DNA repair
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  1    [L    K    J]    COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0517 FOG: CBS domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0536 Predicted GTPase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F    G    R]    COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0539 Ribosomal protein S1
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0541 Signal recognition particle GTPase
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  1    [H    C]    COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0550 Topoisomerase IA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0552 Signal recognition particle GTPase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0563 Adenylate kinase and related kinases
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [J]    COG0566 rRNA methylases
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1    [C]    COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  1    [G]    COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0582 Integrase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  1    [T]    COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1    [F    J]    COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0594 RNase P protein component
||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------||||||||||  1    [R]    COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M    U]    COG0597 Lipoprotein signal peptidase
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [P]    COG0605 Superoxide dismutase
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  1    [P]    COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  1    [R]    COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  1    [I]    COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-------------||---||------------||--------|||||-||||||||---|||||||  1    [O]    COG0625 Glutathione S-transferase
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-||||||||-|||---------------------------------------|---||-|||||||  1    [N    U]    COG0630 Type IV secretory pathway, VirB11 components, and related ATPases involved in archaeal flagella biosynthesis
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  1    [C]    COG0633 Ferredoxin
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------||||||||  1    [G]    COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
-------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---|||||||  1    [H    C]    COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  1    [R]    COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  1    [M]    COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  1    [R]    COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  1    [I]    COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  1    [P]    COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  1    [I]    COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1    [J]    COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0691 tmRNA-binding protein
---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---||||||||||  1    [O]    COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  1    [O]    COG0695 Glutaredoxin and related proteins
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [G    E    R]    COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-||  1    [G]    COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1    [F]    COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  1    [C]    COG0723 Rieske Fe-S protein
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  1    [I]    COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O    U]    COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0742 N6-adenine-specific methylase
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1    [F]    COG0756 dUTPase
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1    [S]    COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1    [E]    COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [Q]    COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0781 Transcription termination factor
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0782 Transcription elongation factor
---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-|||  1    [P]    COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0787 Alanine racemase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [K]    COG0789 Predicted transcriptional regulators
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0797 Lipoproteins
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0802 Predicted ATPase or kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  1    [P]    COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0811 Biopolymer transport proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  1    [M]    COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  1    [C]    COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
--|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--|||||||||||  1    [U]    COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0828 Ribosomal protein S21
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  1    [E    T]    COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [V]    COG0841 Cation/multidrug efflux pump
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1    [C]    COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0848 Biopolymer transport protein
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0858 Ribosome-binding factor A
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [P]    COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
-|||---||--|----|-||------|||---|---||----|||||-||-||--|--||||||||  1    [M]    COG1004 Predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--||  1    [P]    COG1006 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  1    [C    P]    COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  1    [I]    COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1    [C]    COG1048 Aconitase A
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---|||||||  1    [R]    COG1054 Predicted sulfurtransferase
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  1    [C]    COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
-------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--||||||||  1    [O]    COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  1    [D]    COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  1    [M    G]    COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  1    [M]    COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
--------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG1101 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1    [P]    COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [G]    COG1109 Phosphomannomutase
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1    [P]    COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1    [E]    COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [Q]    COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1    [G    M]    COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [V]    COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
--|-----|-|-|--------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1    [O]    COG1138 Cytochrome c biogenesis factor
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
||||||-|||||-----|||-|----|||||-----------|||-|-||--|--|||||||||||  1    [C]    COG1146 Ferredoxin
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1160 Predicted GTPases
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [E]    COG1171 Threonine dehydratase
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  1    [I]    COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1186 Protein chain release factor B
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
--|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------||||||||||  1    [J]    COG1189 Predicted rRNA methylase
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  1    [L]    COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1200 RecG-like helicase
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [T]    COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----||||||||  1    [P]    COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1    [O]    COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  1    [P]    COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  1    [R]    COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  1    [S]    COG1238 Predicted membrane protein
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  1    [I]    COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1    [I]    COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
|-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-||  1    [R]    COG1268 Uncharacterized conserved protein
--||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1    [C]    COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [K]    COG1278 Cold shock proteins
------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---|||||||  1    [C]    COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit
------------------------||-----|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  1    [C]    COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
--||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1    [C]    COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG1295 Predicted membrane protein
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  1    [C]    COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  1    [C]    COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--||  1    [P]    COG1320 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1    [P]    COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
---------------------|--||||||------||---------------------|||||||  1    [K]    COG1329 Transcriptional regulators, similar to M. xanthus CarD
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1    [F]    COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
--||--------------||-|--|-|||-||---|||----|||||--|-|-------||-||||  1    [S]    COG1357 Uncharacterized low-complexity proteins
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
||||||||||--|-----------||-----------------------------------|||||  1    [J]    COG1384 Lysyl-tRNA synthetase (class I)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||---||-----------------------------|-----|--------||  1    [I]    COG1398 Fatty-acid desaturase
-----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------||  1    [S]    COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG1434 Uncharacterized conserved protein
---------------------------------|--|-----|||-|---||----||--|---||  1    [M]    COG1442 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins, LPS:glycosyltransferases
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [Q]    COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  1    [G]    COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  1    [K]    COG1475 Predicted transcriptional regulators
-------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---|||||||  1    [R]    COG1485 Predicted ATPase
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [S]    COG1496 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  1    [I]    COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
------||-----------|-|----|||------------------------||-------||||  1    [E]    COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
||||--|||--------|---|---|-|||------|-----|||||-||--|--|-------|||  1    [S]    COG1520 FOG: WD40-like repeat
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG1530 Ribonucleases G and E
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M    U]    COG1538 Outer membrane protein
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1    [J]    COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
||----|----------|||--------------------------------------------||  1    [P]    COG1563 Predicted subunit of the Multisubunit Na+/H+ antiporter
----------------|-||--------------------------------||||||||||||||  1    [S]    COG1565 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---|||||||  1    [V]    COG1566 Multidrug resistance efflux pump
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1570 Exonuclease VII, large subunit
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  1    [L]    COG1573 Uracil-DNA glycosylase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG1589 Cell division septal protein
---|--------|||-|-||-|----||||----||||-----------|--|--|---|||||||  1    [O]    COG1612 Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  1    [V]    COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
---|----|-||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1    [C]    COG1622 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1    [S]    COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  1    [J]    COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  1    [D]    COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  1    [K]    COG1678 Putative transcriptional regulator
--|---||--|-|-----||-|----||||||||||||----|||||--|--|--|---|||||||  1    [V]    COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1    [G    M]    COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|--------|--------||-------||||----|||----------|||--|||||||||||||  1    [S]    COG1714 Predicted membrane protein/domain
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1722 Exonuclease VII small subunit
-------------|||---|--||----------------------------------------||  1    [S]    COG1723 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------------------------|||||-||--||||---|||||||  1    [S]    COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  1    [T]    COG1734 DnaK suppressor protein
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  1    [R]    COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
------------------||-|---|||||----------------------|------|||||||  1    [R]    COG1754 Uncharacterized C-terminal domain of topoisomerase IA
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [K]    COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
-------------------|------||||---|--------|||||-||--|------|||||||  1    [E]    COG1770 Protease II
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  1    [M]    COG1792 Cell shape-determining protein
---------------------|------------||||----|||||-||--||||---|||||||  1    [S]    COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1    [J]    COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
---|------||||--|-||-|----||||----||||----||||||-|--|--|---|||||||  1    [C]    COG1845 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1    [R]    COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
||||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--||  1    [P]    COG1863 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit
|||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--||||  1    [S]    COG1872 Uncharacterized conserved protein
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1    [C]    COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1    [C]    COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
-|----------------------------------------||||||||||||||---|||||||  1    [U]    COG1952 Preprotein translocase subunit SecB
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [K]    COG1959 Predicted transcriptional regulator
-------------|||--------------------------||||||||||-|||--------||  1    [P]    COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog
------------------||-----------------------------|--||||||||||||||  1    [S]    COG1981 Predicted membrane protein
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  1    [S]    COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1    [C]    COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-||  1    [L]    COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase
||||--||---------|||-|----|-------||||----------||---------|||--||  1    [P]    COG2111 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhB subunit
----------------|---|-----------------------------------|||--|||||  1    [S]    COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  1    [C]    COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
--|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|-  1    [S]    COG2155 Uncharacterized conserved protein
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--||  1    [R]    COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase
----------------|-||-|---||||||----|||----|||||-||--|--|---|||||||  1    [T]    COG2200 FOG: EAL domain
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  1    [T]    COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
|-||--||---------|---|----|-------||||----------||---------|||--|-  1    [P]    COG2212 Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---|||||||  1    [H]    COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  1    [P]    COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----||  1    [G]    COG2271 Sugar phosphate permease
--|------------------|--------------------|||||-|||||------|||||||  1    [O]    COG2332 Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE
---|----|---|-----|--|---------------|----------||-|--------||--||  1    [R]    COG2358 TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---||  1    [R]    COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  1    [M]    COG2825 Outer membrane protein
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  1    [S]    COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  1    [M]    COG2853 Surface lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||--|----|||  1    [Q]    COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component
-------------||-|-------------------||----------||--||||||||||||||  1    [C]    COG2857 Cytochrome c1
-------------||---------------------------|||||-||-|||||---|||||||  1    [I]    COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
--|---------|-----------|-||||-------------------------|||||||||||  1    [L]    COG2887 RecB family exonuclease
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
-------------||------------|||------------------||--|------|||||||  1    [E]    COG2902 NAD-specific glutamate dehydrogenase
------------------------------------------|||||-|||||--|--------||  1    [S]    COG2904 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG2913 Small protein A (tmRNA-binding)
------------------------------------------||||||||||-|||----||||||  1    [D]    COG2917 Intracellular septation protein A
------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---|||||||  1    [D]    COG2919 Septum formation initiator
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG2927 DNA polymerase III, chi subunit
-------------||---------------------------|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG2938 Uncharacterized conserved protein
-------------||----------------------------------|--|--|-------|||  1    [H]    COG2941 Ubiquinone biosynthesis protein COQ7
---|----|----------------------------------------|--||||---|||||||  1    [R]    COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
----------------------------------------------------|--|||-|||||||  1    [U]    COG2948 Type IV secretory pathway, VirB10 components
------------------------------------------|||||-||---|||----|||-||  1    [M]    COG2982 Uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis
----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  1    [S]    COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||-||--|---|-|||||  1    [M]    COG3047 Outer membrane protein W
-------------||----------------------------------|-----|---|||||||  1    [O]    COG3175 Cytochrome oxidase assembly factor
-------------------------------|----------|||||-|------|--------|-  1    [S]    COG3274 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  1    [M]    COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
-------------||-----------||||-------------------|-----|---|||||||  1    [S]    COG3346 Uncharacterized conserved protein
-------------||--------------------------------------------|||||||  1    [C]    COG3474 Cytochrome c2
--------------------------|------------------|---|-----|---|||||||  1    [Q]    COG3485 Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit
----------------|---|--------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3494 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|----------|---------------|-----|--|||-||-|-||  1    [U]    COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components
-------------------------------------------------|---------|||||||  1    [R]    COG3577 Predicted aspartyl protease
-------------------|----------------|-----------|---------------||  1    [R]    COG3621 Patatin
----------------------------------------------------|-------|--|||  1    [M]    COG3660 Predicted nucleoside-diphosphate-sugar epimerase
-----------------------------------------------------|||-------|||  1    [S]    COG3671 Predicted membrane protein
-----------------|||-----|-----------|-----------|--------||||||||  1    [T]    COG3706 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3750 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [C]    COG3761 NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3807 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3814 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3820 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3827 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------|--|---||-||||  1    [U]    COG3838 Type IV secretory pathway, VirB2 components (pilins)
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG4105 DNA uptake lipoprotein
--------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG4120 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
------------------------------------------|||||-|||||------|||||||  1    [O]    COG4133 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, ATPase component
------------------------------------------------||-----|---|||||||  1    [S]    COG4395 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------------|---||||-||  1    [M]    COG4520 Surface antigen
----------------------------------|-------|||||-||||---|----||||||  1    [P]    COG4536 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorB
-------------------------------------------------------|---||-||||  1    [I]    COG4553 Poly-beta-hydroxyalkanoate depolymerase
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
----------------|----------------------------|---|---------||-||||  1    [R]    COG4618 ABC-type protease/lipase transport system, ATPase and permease components
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG4765 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|----------------------||||-------------------|-----|---|||||||  1    [I]    COG4770 Acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---|||||||  1    [I]    COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG4974 Site-specific recombinase XerD
----------------|------------------------------------|||---|||||||  1    [T]    COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
-------------||------------------------------|---------|---|||||||  1    [O]    COG5265 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease and ATPase components
-------------|||------------------------------------------------|-  1    [R]    COG5307 SEC7 domain proteins
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG5336 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|---------------------------------||---------||  1    [S]    COG5346 Predicted membrane protein
-----------------------------------------------------------|||||||  1    [S]    COG5375 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||-------|--------||||----|||||||||||--|||||||||||  1    [O]    COG5405 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), peptidase subunit
-----------------------------------------------------------||||-||  1    [S]    COG5462 Predicted secreted (periplasmic) protein
----------------------------------------------------|-------||||||  1    [S]    COG5508 Uncharacterized conserved small protein
-------------||------------------------------------------------|||  1    [S]    COG5590 Uncharacterized conserved protein
-----------------------------------------------------------||-|-||  1    [N]    COG5622 Protein required for attachment to host cells
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  0    [R]    COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  0    [H]    COG0262 Dihydrofolate reductase
------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-|  0    [L]    COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase
||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-|  0    [V]    COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  0    [H]    COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  0    [T    K]    COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  0    [L]    COG0338 Site-specific DNA methylase
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  0    [L]    COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  0    [K    R]    COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  0    [F    E]    COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  0    [E]    COG0548 Acetylglutamate kinase
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  0    [J]    COG0565 rRNA methylase
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  0    [P]    COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  0    [O]    COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-|  0    [V]    COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
|||||||||||||||||--------------|--|||----------------------------|  0    [M    I]    COG0615 Cytidylyltransferase
|||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-|  0    [R]    COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  0    [R]    COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
||||-|-||----------|-------||--|||||--|||||||-|-|||||---|||-||-|-|  0    [V]    COG0732 Restriction endonuclease S subunits
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  0    [L    U]    COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  0    [H]    COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
--||--|||-------||||-|--------|-----------|||||-||--|---||-|||||-|  0    [M]    COG0836 Mannose-1-phosphate guanylyltransferase
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  0    [C]    COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  0    [R]    COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
|||---|||||||---|-||-|----||||||-|-|||-------|--||-----|---|||||-|  0    [F]    COG1051 ADP-ribose pyrophosphatase
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  0    [L]    COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
|-|-||||||||-||||-||------|---|||-||||----|||||--|-----|---|||||-|  0    [M]    COG1215 Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  0    [O]    COG1225 Peroxiredoxin
--------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---|  0    [R]    COG1279 Lysine efflux permease
-||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--|  0    [R]    COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  0    [R]    COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
-||---|||-||------||-|-----||-----------------|---|-|--|---||-||-|  0    [R]    COG1487 Predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  0    [E]    COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  0    [L]    COG1533 DNA repair photolyase
|-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-|  0    [S]    COG1598 Uncharacterized conserved protein
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  0    [R]    COG1694 Predicted pyrophosphatase
|||---|||||||---||------------|---|-----------|---|--------||----|  0    [R]    COG1708 Predicted nucleotidyltransferases
--------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  0    [I]    COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  0    [I]    COG1835 Predicted acyltransferases
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  0    [R]    COG1881 Phospholipid-binding protein
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  0    [L]    COG2003 DNA repair proteins
-----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  0    [I]    COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit
---|-------------|||-------||----||-------|||-|-|----------|-----|  0    [D]    COG2161 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system
---------------------------||--|---|||----|||||-||-----|---|||||-|  0    [F]    COG2169 Adenosine deaminase
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  0    [R]    COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--|  0    [E]    COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase
-------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---|  0    [T]    COG2337 Growth inhibitor
------------------||--------------|-|------------|-----|--||--|--|  0    [V]    COG2602 Beta-lactamase class D
-------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----|  0    [K]    COG2944 Predicted transcriptional regulator
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-|  0    [R]    COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA
------------------------------------------|||||-|-||----|||-||||-|  0    [P]    COG3004 Na+/H+ antiporter
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  0    [S]    COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  0    [V]    COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-|  0    [C]    COG3038 Cytochrome B561
------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-|  0    [K]    COG3070 Regulator of competence-specific genes
--------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----|  0    [L]    COG3077 DNA-damage-inducible protein J
------------------|--|--------------------|||||--|--|--|---||-|--|  0    [N    U]    COG3121 P pilus assembly protein, chaperone PapD
--||-----------------|-----||--|---|||-----------|-----|---||-||-|  0    [R]    COG3173 Predicted aminoglycoside phosphotransferase
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  0    [S]    COG3177 Uncharacterized conserved protein
------------------|-----------------------|||||--|--|--|---|--|--|  0    [N    U]    COG3188 P pilus assembly protein, porin PapC
---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--|  0    [M]    COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis
----------------------------------------------------|------|||||-|  0    [U]    COG3702 Type IV secretory pathway, VirB3 components
-------------------|----------|-----------|||||-----|--|------||-|  0    [R]    COG3772 Phage-related lysozyme (muraminidase)
-----------|------||---------------------------------|||-------|-|  0    [R]    COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain
-|-----------------|-------------|----||-------------------------|  0    [S]    COG4095 Uncharacterized conserved protein
-------------------|-------||----||------------------------|-----|  0    [S]    COG4115 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||-------||------------------------|------|----|  0    [D]    COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system
-------------------|-|---------------------||-------|--|----|----|  0    [S]    COG4226 Uncharacterized protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters
-------------||-------||-----------------------------------------|  0    [S]    COG4285 Uncharacterized conserved protein
---------------------|-----------------------------------------|-|  0    [S]    COG4374 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------||||---|||-|-|  0    [S]    COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------|-------------------------|-|  0    [G]    COG4421 Capsular polysaccharide biosynthesis protein
-------------------|----------------------|||-|------------------|  0    [R]    COG4572 Putative cation transport regulator
------------------------------------------|||||--|---------------|  0    [R]    COG4574 Serine protease inhibitor ecotin
--|-----------------|---------------------|||-|--------|---------|  0    [S]    COG4804 Uncharacterized conserved protein
--|-----------------|-----|----|---|------------------------|-|--|  0    [L]    COG4912 Predicted DNA alkylation repair enzyme
-------------------||---------------------|||-|----||------||-||-|  0    [M]    COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC
--|-----------------|---------|----------------------------------|  0    [S]    COG4997 Uncharacterized conserved protein
------------------|--------------------------------------------|-|  0    [S]    COG5304 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------------------------------------------||||--|  0    [R]    COG5342 Invasion protein B, involved in pathogenesis
--|--------------------------------|--------------------------|--|  0    [R]    COG5362 Phage-related terminase
-----------------------------------|-|--------------|------------|  0    [S]    COG5410 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----|------|----------||-------------------------|----------|----|  0    [H]    COG5424 Pyrroloquinoline quinone (Coenzyme PQQ) biosynthesis protein C
---------------------------------------------|---|-----|---|--|--|  0    [S]    COG5430 Uncharacterized secreted protein
-----------------------------------------------------------|-|-|-|  0    [S]    COG5448 Uncharacterized conserved protein
-----------------------------------------------------------|-|-|-|  0    [S]    COG5449 Uncharacterized conserved protein
------------------||----------------------|||||------------------|  0    [S]    COG5464 Uncharacterized conserved protein
-------------------------------------------|--|--------|-----|-|-|  0    [S]    COG5510 Predicted small secreted protein
------------------------------------------------|-||-------------|  0    [R]    COG5595 Zn-ribbon-containing, possibly nucleic-acid-binding protein
----------------|-------------------------------------------|----|  0    [R]    COG5611 Predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain
-------------------------------------|-------------------------|-|  0    [R]    COG5628 Predicted acetyltransferase

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