(Fnu) Fusobacterium nucleatum
generin.cgi	Functional categories
	Fun	All	J	A	K	L	B	D	Y	V	T	M	N	Z	W	U	O	C	G	E	F	H	I	P	Q	R	S
	COGs	1,143	130	-	53	88	1	16	-	12	21	77	6	-	1	27	44	76	72	105	45	84	44	51	8	148	111
	proteins	1,619	142	-	91	136	1	23	-	35	33	109	6	-	3	40	60	120	112	178	48	98	59	105	19	233	151
	Distribution of COGs by number of proteins
	proteins	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	12	27
	COGs	909	145	42	16	11	6	5	2	3	1	2	1

Co-ocurrences in sister taxa	No sister genomes in order Fusobacterales

+    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    ++    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +
--------------------|-||------------|--------||--|---||---|------- 27    [S]    COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----|||||||||||||||||||||||| 12    [G    E    R]    COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
--|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||-- 12    [L]    COG2801 Transposase and inactivated derivatives
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-||||||||||||||| 10    [R]    COG0457 FOG: TPR repeat
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  9    [K    R]    COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  9    [V]    COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||-------  9    [C]    COG1757 Na+/H+ antiporter
|||-----||---||---|||---|-----||||-||-----|||||||||||--||||-------  8    [C]    COG0716 Flavodoxins
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  8    [E]    COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  7    [Q    R]    COG0500 SAM-dependent methyltransferases
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  7    [E    P]    COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  7    [V]    COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  7    [E    P]    COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
--|----------------||---------|-|||--|-----------|---------||--|--  7    [L]    COG3666 Transposase and inactivated derivatives
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  6    [O    C]    COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
--|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||----  6    [E]    COG1115 Na+/alanine symporter
-||||||||--||----|||||----|---|-|||||||-|||||||-||||---|||||||||--  6    [P    H]    COG1120 ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components
|-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  6    [K]    COG1309 Transcriptional regulator
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  6    [M]    COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
-----|--------------||----|||--|||||-|----|||||-|||----|---|||||--  6    [L]    COG2963 Transposase and inactivated derivatives
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  5    [E    P]    COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5    [L    R]    COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
-||||||||-|||----|||||----|---|||||||||---|||||-||||---|||||||||--  5    [P]    COG0609 ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component
-||||||||-|||----|||||----||||||||||||----|||||-||||---|||||||||--  5    [P]    COG0614 ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component
----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||--  5    [M]    COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  5    [V]    COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
--------------------|----|------|||-||----|||-|---|------------|--  5    [S]    COG1288 Predicted membrane protein
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  5    [K]    COG1396 Predicted transcriptional regulators
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||--  5    [P]    COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport
--|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||--  5    [L]    COG3547 Transposase and inactivated derivatives
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  5    [E]    COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  4    [M    G]    COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  4    [M]    COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4    [R]    COG0517 FOG: CBS domain
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||--  4    [V]    COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  4    [R]    COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  4    [T]    COG0642 Signal transduction histidine kinase
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  4    [C]    COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit
--|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||--  4    [G]    COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  4    [P]    COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
|||||||||||||||-|||||---|--||-||--||-|----|||||-|-------|||-------  4    [C]    COG1013 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, beta subunit
-||-|-||--||-----|--|------||----|-|--------------|-----|||---|--|  4    [R]    COG1373 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
--||||||---|-----|||||----|||-||-|||||----|||----|||---|--||||||--  4    [R]    COG1473 Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase
--|-----------------||---|----||||||||----|||||-|-||------|-|--|--  4    [E]    COG2195 Di- and tripeptidases
-|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|--  4    [R]    COG2252 Permeases
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  4    [U]    COG2831 Hemolysin activation/secretion protein
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  4    [U]    COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [D]    COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  3    [E]    COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3    [M]    COG0438 Glycosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--|||||-||||||-|-||||||||-||-|---|---|||||--  3    [R]    COG0446 Uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenases
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [J]    COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  3    [R]    COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  3    [K    L]    COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [J]    COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  3    [L]    COG0582 Integrase
---|||-|--|-||||-|-|||--|-||||||||||||-||||||||-||||---|---|||||--  3    [C]    COG0584 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3    [E]    COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  3    [H]    COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  3    [R]    COG0666 FOG: Ankyrin repeat
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3    [T    K]    COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  3    [C]    COG0778 Nitroreductase
------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||--------  3    [E]    COG0786 Na+/glutamate symporter
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  3    [V]    COG0841 Cation/multidrug efflux pump
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  3    [M]    COG0845 Membrane-fusion protein
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3    [I    Q    R]    COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  3    [C    H    R]    COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
-|----||---|-------||-----------------------------------||--------  3    [R]    COG1106 Predicted ATPases
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  3    [P]    COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
----||||--|||||--|-|||----|||||-||||||----|||||-||-|---|---|||||--  3    [K    E]    COG1167 Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  3    [C]    COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  3    [O]    COG1404 Subtilisin-like serine proteases
-----------------|--|---|-|----------|----|--||-||||-------||--|--  3    [G]    COG1593 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component
||||||--|--||-----||||----|||-||--||||----|||||-||-||--|--|||-||--  3    [K]    COG1733 Predicted transcriptional regulators
--------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||--  3    [G    T]    COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type)
--------|--|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  3    [I]    COG1788 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  3    [P]    COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
---|||--|-|-|---||||||---|||||||||||||-|--|||||-|-||-------|||||--  3    [K    G]    COG1940 Transcriptional regulator/sugar kinase
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  3    [K]    COG1959 Predicted transcriptional regulator
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  3    [I]    COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  3    [C]    COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
-||---|-|---|-----|||------||----|--------|--||-|------|---||-----  3    [J    D]    COG2026 Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system
-----------|--------||----|||-|-|---||----|------||----|||-|||||-|  3    [I]    COG2057 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  3    [P]    COG2217 Cation transport ATPase
--|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||----------  3    [G    E]    COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases
--|----|------------||----|-----------|-------------------|-------  3    [K]    COG2865 Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  3    [S]    COG3177 Uncharacterized conserved protein
--|--|-------------||-----|||----||--|-----------------|---||-|---  3    [L]    COG3464 Transposase and inactivated derivatives
--|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||---  3    [U    W]    COG5295 Autotransporter adhesin
||-|||-|-||-|||-|-|||------|||-----|-|----------------------------  2    [P]    COG0003 Oxyanion-translocating ATPase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [E]    COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  2    [E]    COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [E]    COG0031 Cysteine synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [R]    COG0073 EMAP domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [H]    COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||----  2    [P]    COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
|-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||--  2    [O]    COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase
|-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||--  2    [O]    COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [J]    COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2    [H]    COG0352 Thiamine monophosphate synthase
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  2    [E]    COG0405 Gamma-glutamyltransferase
--|-||-----|-||-||||||----||||||||||||----|||||-||-||--|---|||||--  2    [G]    COG0406 Fructose-2,6-bisphosphatase
||||||||||||||||||||||--||----||--|||-----|||||-||----------------  2    [L]    COG0419 ATPase involved in DNA repair
|||---|||-------|||||---------|-----------|||-|--|-----|----------  2    [C]    COG0426 Uncharacterized flavoproteins
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [E]    COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [D]    COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
-----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|---  2    [G]    COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [M]    COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  2    [R]    COG0456 Acetyltransferases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  2    [G    E    P    R]    COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2    [R]    COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0492 Thioredoxin reductase
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  2    [F]    COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
-------------||-----|---|------|||||||-||||||||-|-|-----------|---  2    [M]    COG0510 Predicted choline kinase involved in LPS biosynthesis
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [F]    COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  2    [R]    COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [F]    COG0563 Adenylate kinase and related kinases
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [J]    COG0566 rRNA methylases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [K]    COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  2    [P]    COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2    [K]    COG0583 Transcriptional regulator
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  2    [G]    COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  2    [E    R]    COG0591 Na+/proline symporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  2    [P]    COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [L]    COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  2    [O    U]    COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0621 2-methylthioadenine synthetase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [C]    COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
---|--|||--||||-||--|-----|||--|||||||----|||||--|--------||||||||  2    [G]    COG0647 Predicted sugar phosphatases of the HAD superfamily
|-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2    [O]    COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  2    [T]    COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
-||||||||||||||-|-||||--||-||-|--|||||-||||||||-||-||--|--||||||--  2    [R]    COG0693 Putative intracellular protease/amidase
-|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||-------  2    [R]    COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  2    [L    U]    COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [D]    COG0772 Bacterial cell division membrane protein
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
|-|---|||-|-|---||||||--|-||||--||--||------------||----||-||||---  2    [O]    COG0785 Cytochrome c biogenesis protein
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [M]    COG0787 Alanine racemase
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0795 Predicted permeases
----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||--  2    [M]    COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2    [U]    COG0811 Biopolymer transport proteins
|||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||----  2    [O]    COG0826 Collagenase and related proteases
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  2    [E    T]    COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  2    [U]    COG0848 Biopolymer transport protein
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  2    [C]    COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
|||||||||||||---|||||---|--||-||--||-|----|||||-|------||||---||--  2    [C]    COG1014 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, gamma subunit
---|----|-|-|||||-|||---||||||---------------|--||||--------------  2    [I]    COG1022 Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)
---|||--|-|||||-|--|||----|||||-|||-||----|||||-||--|--|---|||||||  2    [I]    COG1024 Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase
|||-|||||||||----|||||-----||-||-----|----|||-|-||------------|---  2    [C]    COG1032 Fe-S oxidoreductase
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  2    [P]    COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
--|||||||-||||||---|||--|-|||||-||||------|||||-|-----------------  2    [K    L]    COG1061 DNA or RNA helicases of superfamily II
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  2    [D]    COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  2    [M    G]    COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||--  2    [M]    COG1087 UDP-glucose 4-epimerase
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  2    [M]    COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2    [G]    COG1109 Phosphomannomutase
|||||-||||-|-||||||-|------||||---|---|||||||-|--|--|---|--------|  2    [L]    COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
--------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||--------------  2    [E]    COG1114 Branched-chain amino acid permeases
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2    [P]    COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
||||--|||||||----|||||--|-||||||||||||||||-||-|-|-|----|---|||----  2    [P]    COG1122 ABC-type cobalt transport system, ATPase component
-----------------|--|---|||----|----||-|--|||||-||||---|---|||||--  2    [G]    COG1129 ABC-type sugar transport system, ATPase component
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  2    [H    I]    COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  2    [C]    COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A
-||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||-----------  2    [R]    COG1161 Predicted GTPases
--||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||--  2    [E]    COG1164 Oligoendopeptidase F
-----------------|--|-----|--|-|----||----|||||-||||---|---|||||--  2    [G]    COG1172 Ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport systems, permease components
---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||---  2    [P]    COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
|-||--||--------||||||---|----||||||||------------------|||-------  2    [L]    COG1193 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|--||||-|--|-|---|--||-----||-|-|-|-||-------||-||-----|---|||||--  2    [Q]    COG1228 Imidazolonepropionase and related amidohydrolases
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  2    [M]    COG1346 Putative effector of murein hydrolase
----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||---  2    [K    G]    COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  2    [R]    COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA
||||||--||-|------||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---|||||--  2    [H]    COG1492 Cobyric acid synthase
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  2    [M    U]    COG1538 Outer membrane protein
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  2    [L]    COG1573 Uracil-DNA glycosylase
--||||||----|---||--||-----||------|||--------|--|-----|---|||||--  2    [R]    COG1574 Predicted metal-dependent hydrolase with the TIM-barrel fold
-----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||--  2    [K]    COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog
-----------------||-|---|-|---------||----|--||-||||---|---||-||--  2    [G]    COG1638 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  2    [J]    COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
-|------||----------|---------|-----------|||---------------------  2    [E]    COG1775 Benzoyl-CoA reductase/2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase subunit, BcrC/BadD/HgdB
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  2    [M]    COG1792 Cell shape-determining protein
------------------|||-----||||||||||||----------------------------  2    [S]    COG1799 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||--  2    [K]    COG1802 Transcriptional regulators
--------|--------|--||--------|----|||----|||-|-------------------  2    [R]    COG1811 Uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  2    [K]    COG1846 Transcriptional regulators
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  2    [R]    COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
|||-----||------||--|---------||---|------|||---------------------  2    [I]    COG1924 Activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase (HSP70-class ATPase domain)
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  2    [G]    COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
--||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||--  2    [L]    COG1943 Transposase and inactivated derivatives
--------------------|-------------|-||----------||||-||-|||-------  2    [R]    COG2056 Predicted permease
-|---------------|||||---||---------||-|--------||-----|---||-||--  2    [P]    COG2059 Chromate transport protein ChrA
--------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|--  2    [R]    COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase
--------------|-----|------|||||||-|------|||----|--------||||||||  2    [R]    COG2071 Predicted glutamine amidotransferases
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  2    [C]    COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  2    [T]    COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
-|-------|-------|--||---------------------------------|----------  2    [G]    COG2342 Predicted extracellular endo alpha-1,4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase
-------------||-----||---------|--||-|----||||-----|-------||||---  2    [G]    COG2376 Dihydroxyacetone kinase
----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||--  2    [S]    COG2606 Uncharacterized conserved protein
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  2    [P]    COG2608 Copper chaperone
-|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||--  2    [M]    COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase
--------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|--  2    [H]    COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter
---|||--------------||----------|-|-||-------||-||-----|---|||||--  2    [E]    COG2986 Histidine ammonia-lyase
---|||--------------||----------|-|-||-------|--||-----|---|||||--  2    [E]    COG2987 Urocanate hydratase
---|--------|-------|---------------------|||---|--|--------------  2    [E]    COG3033 Tryptophanase
--------------------|-----|----------|----|--||-||||-------||--|--  2    [G]    COG3090 TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component
--|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||--  2    [S]    COG3212 Predicted membrane protein
--------------------|---------|---|-||----|||-|-|-----------|-----  2    [S]    COG3314 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|----------------||------|||------|-----------||-|--------|-|---  2    [Q]    COG3315 O-Methyltransferase involved in polyketide biosynthesis
--------------------|----------------|------------------|||-------  2    [L]    COG3392 Adenine-specific DNA methylase
----||-----------|--||--------|-|---------------------------------  2    [E]    COG3404 Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
|-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||---  2    [R]    COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein
-----------------|--|------||---|--------------------------||-|---  2    [T]    COG3629 DNA-binding transcriptional activator of the SARP family
----||-----------|--|-----------|---------------------------------  2    [E]    COG3643 Glutamate formiminotransferase
--------------------|---------|---||||-----------|-|-------||-|---  2    [S]    COG3708 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  2    [E]    COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
|-|---------------|||------||||----|-----------------------|||||--  2    [T]    COG3920 Signal transduction histidine kinase
--------------------||----|---||||---|----------|--|----------|---  2    [R]    COG3981 Predicted acetyltransferase
----------------||--|---------||||||||||--|||||-|-||----||||||||--  2    [R]    COG4123 Predicted O-methyltransferase
-------------|------|----------|-|-|---------------|--------------  2    [S]    COG4283 Uncharacterized conserved protein
------------------|||--------------|------|||-|-------------------  2    [Q    C]    COG4577 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein
--------------------|----------------------------|--|--|---|--|---  2    [S]    COG4625 Uncharacterized protein with a C-terminal OMP (outer membrane protein) domain
--------------------|---|--------|----------------|---------------  2    [M]    COG4750 CTP:phosphocholine cytidylyltransferase involved in choline phosphorylation for cell surface LPS epitopes
-----------------|--|---------|-----------------------------------  2    [S]    COG4878 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|-----------------------------|--||------|----  2    [P]    COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1    [H]    COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1    [H]    COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||--||||--||----|||||||||||||||||||-|||-------------  1    [J]    COG0017 Aspartyl/asparaginyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0024 Methionine aminopeptidase
---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||--  1    [H]    COG0029 Aspartate oxidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1    [F]    COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  1    [P]    COG0038 Chloride channel protein EriC
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1    [C]    COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [J]    COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----|||-|--|--|--|||||||||--  1    [F]    COG0044 Dihydroorotase and related cyclic amidohydrolases
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0049 Ribosomal protein S7
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0050 GTPases - translation elongation factors
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0052 Ribosomal protein S2
||||---||||||||-||||||---||||-||||||||----|||||-||-|---|--||||||||  1    [P]    COG0053 Predicted Co/Zn/Cd cation transporters
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
-||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|---  1    [G]    COG0058 Glucan phosphorylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [G]    COG0061 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0082 Chorismate synthase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0104 Adenylosuccinate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [E    H]    COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1    [L]    COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0117 Pyrimidine deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1    [J]    COG0130 Pseudouridine synthase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1    [H]    COG0132 Dethiobiotin synthetase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0133 Tryptophan synthase beta chain
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1    [F]    COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E    H]    COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [F]    COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
------|---|--||--|--|---|-|||-||-|--||----|||||-|-||--------------  1    [G]    COG0153 Galactokinase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  1    [J]    COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1    [H]    COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0164 Ribonuclease HII
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1    [H]    COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1    [E    H]    COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0181 Porphobilinogen deaminase
|||-|||||||||||-|||||---------------|------------|--|-------|-|---  1    [J]    COG0182 Predicted translation initiation factor 2B subunit, eIF-2B alpha/beta/delta family
||||||||||||||||--|-||---||||||||-||||----|||||-|||----|||-|||||||  1    [I]    COG0183 Acetyl-CoA acetyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0186 Ribosomal protein S17
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1    [H]    COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0203 Ribosomal protein L17
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|---  1    [G]    COG0205 6-phosphofructokinase
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0206 Cell division GTPase
|||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||--  1    [F]    COG0207 Thymidylate synthase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1    [F]    COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
|||||||||||||||--|--||----|||||--|||||------------||--------------  1    [H]    COG0214 Pyridoxine biosynthesis enzyme
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0218 Predicted GTPase
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0228 Ribosomal protein S16
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
||||-||||||-|||-||-||------||||-||-|||-||-|||||-|||||--|||--||||||  1    [G]    COG0235 Ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerases and aldolases
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0238 Ribosomal protein S18
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  1    [E]    COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  1    [C]    COG0247 Fe-S oxidoreductase
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1    [F    P]    COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0250 Transcription antiterminator
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1    [E    J]    COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0256 Ribosomal protein L18
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1    [E]    COG0260 Leucyl aminopeptidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  1    [H]    COG0262 Dihydrofolate reductase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0264 Translation elongation factor Ts
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0268 Ribosomal protein S20
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  1    [C]    COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  1    [G]    COG0279 Phosphoheptose isomerase
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  1    [C]    COG0280 Phosphotransacetylase
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  1    [C]    COG0282 Acetate kinase
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1    [F]    COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0285 Folylpolyglutamate synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0292 Ribosomal protein L20
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [H]    COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|---  1    [G]    COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme
-|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|---  1    [G]    COG0297 Glycogen synthase
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
--|----|---|-|||---||-----||||||||||||-----------|-|---|---||-||--  1    [R]    COG0300 Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities
----------||-||-|-||||----||||||||-|||----|||||-|||||--|||||||||||  1    [H]    COG0302 GTP cyclohydrolase I
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0305 Replicative DNA helicase
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0313 Predicted methyltransferases
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  1    [T    K]    COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [R]    COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
-------------|||--|||---|||||||----|||----|||||||||||--||||-|-|-||  1    [O]    COG0326 Molecular chaperone, HSP90 family
||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||-------  1    [S]    COG0327 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E    M]    COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0333 Ribosomal protein L32
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  1    [E]    COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0337 3-dehydroquinate synthetase
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  1    [L]    COG0338 Site-specific DNA methylase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||--  1    [S]    COG0344 Predicted membrane protein
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1    [L]    COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  1    [G]    COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
|||||||||||||-----||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1    [H]    COG0368 Cobalamin-5-phosphate synthase
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1    [H]    COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
|||-----||----|-|-||||----|||-----|--||---|||||--||----||||||||---  1    [O    K]    COG0378 Ni2+-binding GTPase involved in regulation of expression and maturation of urease and hydrogenase
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  1    [H]    COG0379 Quinolinate synthase
--||---------||---||||----|||-|----|||----|||-|-||-|---|---|||||--  1    [R]    COG0384 Predicted epimerase, PhzC/PhzF homolog
-------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|--  1    [O]    COG0386 Glutathione peroxidase
--||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||--  1    [L]    COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  1    [E]    COG0410 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
-|------|-|||----|||||-----------|--------|||||--|-----|--|||||---  1    [E]    COG0411 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  1    [I]    COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
||||||||||||||||||||||--||||||||--||||----|||||-||----------|-----  1    [L]    COG0420 DNA repair exonuclease
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  1    [H]    COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [D]    COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  1    [O]    COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
---|----|----||---|-|-----|---------------|||||--|---------|-|-|--  1    [C]    COG0427 Acetyl-CoA hydrolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0443 Molecular chaperone
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1    [O]    COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1    [E    F]    COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1    [F    E]    COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1    [G]    COG0469 Pyruvate kinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0470 ATPase involved in DNA replication
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  1    [M]    COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
|||-|--------||||-|||-----||||||||-||||||||||||--|----------|||---  1    [P]    COG0474 Cation transport ATPase
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [D]    COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  1    [O]    COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1    [H]    COG0502 Biotin synthase and related enzymes
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1    [E    F]    COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E    H]    COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  1    [L    K    J]    COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  1    [L]    COG0514 Superfamily II DNA helicase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||--  1    [E]    COG0520 Selenocysteine lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
--|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||--  1    [R]    COG0523 Putative GTPases (G3E family)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0528 Uridylate kinase
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  1    [E]    COG0531 Amino acid transporters
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0536 Predicted GTPase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F    G    R]    COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0539 Ribosomal protein S1
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1    [F]    COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0541 Signal recognition particle GTPase
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  1    [H    C]    COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0550 Topoisomerase IA
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  1    [L]    COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0552 Signal recognition particle GTPase
---|||-||--|||--||||||---|||||||||||||-||||||||-|||||--|---|||||--  1    [C]    COG0554 Glycerol kinase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [K]    COG0557 Exoribonuclease R
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  1    [E]    COG0559 Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease components
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  1    [E]    COG0560 Phosphoserine phosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  1    [G]    COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  1    [R]    COG0579 Predicted dehydrogenase
|-------|--|-|||-||-||---|----||||||||-|||||||||-||||--|---|||||--  1    [G]    COG0580 Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0594 RNase P protein component
||||--||-|-------|||||----||||||||||||||||--------------||||||||||  1    [R]    COG0595 Predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M    U]    COG0597 Lipoprotein signal peptidase
-||---|-|-||-||-||||||----|||||||||||-----|||||-|||||--|||||||||-|  1    [P]    COG0598 Mg2+ and Co2+ transporters
-||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||--  1    [P]    COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0602 Organic radical activating enzymes
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  1    [O]    COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
----------|-|||-||||||---|-|||||||||||----|||||-|||||--|||||||||||  1    [R]    COG0612 Predicted Zn-dependent peptidases
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
-|||--|||||-|---||||||--|||||-||||||||||||------|-----------------  1    [R]    COG0618 Exopolyphosphatase-related proteins
||||--||||-||----|||||----||||||||||||||||-||-|---|--------|||----  1    [P]    COG0619 ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters
||||--|||||||||--|--|---|----|||||||||-||||||||-||----------------  1    [R]    COG0622 Predicted phosphoesterase
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  1    [F]    COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  1    [T]    COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  1    [K]    COG0640 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  1    [C]    COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
-----------------|||||----|||||---||||----|||||-||-----|---|||||--  1    [E]    COG0646 Methionine synthase I (cobalamin-dependent), methyltransferase domain
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
|||-----||-|-||-|---||-----||||--|||||----||-||-||--|--|---|||-|-|  1    [R]    COG0655 Multimeric flavodoxin WrbA
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1    [R]    COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
|||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||--  1    [G]    COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase
---|||----|||||-||||||---|||||-|--||||----|||||-||--|--||--||-||--  1    [C]    COG0667 Predicted oxidoreductases (related to aryl-alcohol dehydrogenases)
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  1    [M]    COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  1    [R]    COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
||||--||-|-|-||||-||||--|-||||||||||||----|||||-|||||--|||-|||||||  1    [I]    COG0671 Membrane-associated phospholipid phosphatase
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  1    [P]    COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
||-------|---||-|||||-----|---||--||||----||||--||-||--|--||||||||  1    [R]    COG0679 Predicted permeases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
-|-|----|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  1    [E]    COG0683 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1    [E]    COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  1    [I]    COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1    [J]    COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0691 tmRNA-binding protein
-------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||-----  1    [L]    COG0692 Uracil DNA glycosylase
----------------|||-|-----|||||-|||||||||||--||----|----|||-|||-||  1    [G]    COG0698 Ribose 5-phosphate isomerase RpiB
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0703 Shikimate kinase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0708 Exonuclease III
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
-||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||--  1    [P]    COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||--  1    [M]    COG0729 Outer membrane protein
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [R]    COG0730 Predicted permeases
|||||||||||||||--||||---------|-------------------------|||-------  1    [C]    COG0731 Fe-S oxidoreductases
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  1    [I]    COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O    U]    COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1    [I]    COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
-----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [M]    COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1    [F]    COG0756 dUTPase
-----------------|||||----|||||-----||-------|-||||||--|||||||||--  1    [E]    COG0757 3-dehydroquinate dehydratase II
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1    [S]    COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1    [I    M]    COG0761 Penicillin tolerance protein
-----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||--  1    [S]    COG0762 Predicted integral membrane protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1    [E]    COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
--|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||--  1    [F]    COG0775 Nucleoside phosphorylase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0781 Transcription termination factor
---|--------------||||--|||----|||||||-|--|||||-|||||--|||||-|-|||  1    [P]    COG0783 DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [K]    COG0789 Predicted transcriptional regulators
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  1    [L]    COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1    [M]    COG0796 Glutamate racemase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [H]    COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0802 Predicted ATPase or kinase
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0807 GTP cyclohydrolase II
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
-----------|--------||--|------||||||-|||||||||||-||----||----|---  1    [F]    COG0813 Purine-nucleoside phosphorylase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  1    [R]    COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  1    [C]    COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [R]    COG0824 Predicted thioesterase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
------||||||||||||--||----|||||-|-||||-|--|||||-||-|---||||----|--  1    [K]    COG0846 NAD-dependent protein deacetylases, SIR2 family
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  1    [D]    COG0850 Septum formation inhibitor
------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||---  1    [D]    COG0851 Septum formation topological specificity factor
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0858 Ribosome-binding factor A
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  1    [M]    COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
-|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||--  1    [L]    COG0863 DNA modification methylase
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG1010 Precorrin-3B methylase
---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||--  1    [C]    COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [R]    COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1    [O]    COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
-------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1    [H]    COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  1    [R]    COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
-|--||--|--|----||--|---------------------------------------------  1    [L]    COG1059 Thermostable 8-oxoguanine DNA glycosylase
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  1    [H    R]    COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
--||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||--  1    [R]    COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
|||||||||||||--|||--|----------||||||||-||------------------------  1    [R]    COG1078 HD superfamily phosphohydrolases
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  1    [G]    COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  1    [M]    COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  1    [R]    COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
--------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG1101 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  1    [E]    COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
-----------------|--||---||||-||||||||--|||||||-||||---|----------  1    [G]    COG1105 Fructose-1-phosphate kinase and related fructose-6-phosphate kinase (PfkB)
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  1    [P]    COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
|||-|----|-|------|||-----||||----|-------|||||-|------|||-||-|---  1    [R]    COG1123 ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase
--|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||---  1    [E    P]    COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
--------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|------||-||||---  1    [E]    COG1125 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1    [E]    COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1    [C]    COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  1    [C]    COG1145 Ferredoxin
|||----|||-------|--|---------|-----------|||||-------------------  1    [C]    COG1151 6Fe-6S prismane cluster-containing protein
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1160 Predicted GTPases
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  1    [R]    COG1162 Predicted GTPases
--------------------||----||||||-|-|||----|||||---|----|----------  1    [E]    COG1168 Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [E]    COG1171 Threonine dehydratase
--------|----------|||-----||-|||||||-----|||||--|-----|||-||||---  1    [E]    COG1174 ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease component
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1    [E]    COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  1    [E]    COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
-------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||-------  1    [H]    COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1
|||-|||||||||---||--|------||-||||||------|||||-||||---|----------  1    [O]    COG1180 Pyruvate-formate lyase-activating enzyme
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  1    [I]    COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1186 Protein chain release factor B
-----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1    [J]    COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog)
--|-----|-------|||||----|||||||||-|||||----------------||||||||||  1    [J]    COG1189 Predicted rRNA methylase
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1    [J]    COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  1    [L]    COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  1    [D]    COG1196 Chromosome segregation ATPases
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1    [K    L]    COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1200 RecG-like helicase
|||---|||-|||---||--|-----------|----|----|||||----|--------------  1    [R]    COG1203 Predicted helicases
----------------||||||---------|||||||---------------------|||||--  1    [J]    COG1206 NAD(FAD)-utilizing enzyme possibly involved in translation
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  1    [M]    COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
|-----|||---|---|---|----------------------------|--------|----|--  1    [M]    COG1213 Predicted sugar nucleotidyltransferases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [T]    COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
-|------|----|||-|--||--------|||||||-----------|-----------------  1    [C]    COG1227 Inorganic pyrophosphatase/exopolyphosphatase
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  1    [R]    COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
-|-------|------||--|---------|||-||||----|||||-|-----------------  1    [R]    COG1242 Predicted Fe-S oxidoreductase
||||||||||||-|||-|--|---------|-----------------------------------  1    [K    B]    COG1243 Histone acetyltransferase
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  1    [C]    COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
---|||--|-|||-------||-----||||---|-||----|||||-||-----|---|||||||  1    [I]    COG1250 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
--------------------|----||---||||||||-|||||||||||-|---|-------|--  1    [G]    COG1263 Phosphotransferase system IIC components, glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific
--------------------|----||---||||||||||||||||||||-|---|-------|--  1    [G]    COG1264 Phosphotransferase system IIB components
|-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||--  1    [R]    COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1    [I]    COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
|-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-||  1    [R]    COG1268 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
|||||||||||||-----||||-----||-|----|-|--------|-||-----|---||||---  1    [H]    COG1270 Cobalamin biosynthesis protein CobD/CbiB
-------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||--  1    [R]    COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [K]    COG1278 Cold shock proteins
--------------------|-----|||-|---|-||----|||||-||-|---|||-|-|---|  1    [R]    COG1279 Lysine efflux permease
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1    [O]    COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
--------------------|---|-|-----||||||-|--|||-|-||--------|||||---  1    [P]    COG1283 Na+/phosphate symporter
---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||----  1    [S]    COG1284 Uncharacterized conserved protein
----------------|-||||--|--||-||-|-|||----|||||--|||---|---|||----  1    [S]    COG1285 Uncharacterized membrane protein
||||||||||||||||-|||||---|----||||||||------------------|||-------  1    [K]    COG1293 Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG1295 Predicted membrane protein
--|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||---  1    [E]    COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)
--------------------||---||---||||||||-||||||||-|||----|----------  1    [G]    COG1299 Phosphotransferase system, fructose-specific IIC component
-----------------|--||||------||||||||----------------------------  1    [S]    COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---||----------------------------------------  1    [S]    COG1306 Uncharacterized conserved protein
-----------------|--||----|||-||||||||||||-------|----------------  1    [S]    COG1307 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
||-------|-------|--|---------||||||||-|--------------------------  1    [R]    COG1323 Predicted nucleotidyltransferase
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [K]    COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
|||---||-|-------|--|---------||||||------|||||-||||---|----------  1    [F]    COG1328 Oxygen-sensitive ribonucleoside-triphosphate reductase
|||--|--||||-----|-||------||---|----|----------------------------  1    [L]    COG1343 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
|||------|--------|||---------|-----------------------------|-|---  1    [P]    COG1348 Nitrogenase subunit NifH (ATPase)
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1    [S]    COG1354 Uncharacterized conserved protein
||||||||||||||||-|--|---------||||||||----------------------------  1    [J]    COG1358 Ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)
--||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||--  1    [S]    COG1359 Uncharacterized conserved protein
-------------||--|--|----||||||------------------|----------------  1    [E]    COG1362 Aspartyl aminopeptidase
||||--|||||-|----|-|||--------||||||||||--|||-|--|----------|-----  1    [G]    COG1363 Cellulase M and related proteins
-----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|--  1    [T]    COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1    [K]    COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain
|||-||||||---||-||--||-----||-||--||||----|||||-|-----------|-----  1    [E    R]    COG1387 Histidinol phosphatase and related hydrolases of the PHP family
|||||||||||-||||----||||||----------------------------------------  1    [C]    COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E
-------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||--  1    [P]    COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D
||||||||||------||--||--||----|||||||||-|||||-|---------|||||-----  1    [R]    COG1418 Predicted HD superfamily hydrolase
-----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||--  1    [K]    COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene
||||||||||||||||----||--|--------|--------------------------------  1    [C]    COG1436 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit F
--------------------||---||---||||||||-||||||||-||||---|----------  1    [G]    COG1445 Phosphotransferase system fructose-specific component IIB
-------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|---  1    [E]    COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||--  1    [N    U]    COG1450 Type II secretory pathway, component PulD
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  1    [R]    COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
|-|||||||--||||-||--|-----|---||-|||||----|||||-||-|---|---||||---  1    [C]    COG1454 Alcohol dehydrogenase, class IV
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  1    [N    U]    COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
-----------------|--||----|||-||||||||||||------------------------  1    [R]    COG1461 Predicted kinase related to dihydroxyacetone kinase
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
|||---|||-|||---||-||-----------|----|----------------------------  1    [L]    COG1468 RecB family exonuclease
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  1    [H]    COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
-|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||-------  1    [S]    COG1479 Uncharacterized conserved protein
-----------------||||--||-----|----|||----------------------------  1    [R]    COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase
-----------------|--|-----||||||||||||||||------------------------  1    [S]    COG1481 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1    [H]    COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
-------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||----------  1    [J]    COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase
---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||--  1    [T]    COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism
--|---------------||||----|||||-----||----|||-|-|-||---------|||--  1    [G]    COG1494 Fructose-1,6-bisphosphatase/sedoheptulose 1,7-bisphosphatase and related proteins
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [S]    COG1496 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  1    [I]    COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
---|||||--|||||---|-||------------|-||-----------|--|------|---|-|  1    [E]    COG1506 Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases
-||-------------||--||--|-----------||----|||||-|-|||------||-||--  1    [E]    COG1509 Lysine 2,3-aminomutase
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  1    [L]    COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|--  1    [K]    COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor
--|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|---  1    [G]    COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases
|||||||||||--|||----||----------||--------------------------------  1    [C]    COG1527 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit C
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG1530 Ribonucleases G and E
-||-|-|||||||----||-|------||-|-----||-----------|-----|---|||||-|  1    [L]    COG1533 DNA repair photolyase
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  1    [J]    COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG1539 Dihydroneopterin aldolase
------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------  1    [R]    COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B
|-|-----|--|-------|||---------------|----|--|--|---|--|----------  1    [H]    COG1541 Coenzyme F390 synthetase
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1    [J]    COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||--  1    [R]    COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced)
--|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|-------  1    [L]    COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins
---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1    [S]    COG1556 Uncharacterized conserved protein
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  1    [S]    COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
-------------||--|--||--|-----|||||||-------------------||-||||---  1    [H]    COG1564 Thiamine pyrophosphokinase
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1570 Exonuclease VII, large subunit
---|-------------||||-----||||-|--|||-----|||||-|-||--------------  1    [H]    COG1575 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase
-----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||--  1    [S]    COG1576 Uncharacterized conserved protein
||-|--||-||||----|||||----|||||-----------|||||-||-||------|||||--  1    [O    U]    COG1585 Membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1    [H]    COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
|||----|||-|-----|-||---------|-----|---------------------|-------  1    [C]    COG1592 Rubrerythrin
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG1605 Chorismate mutase
-----------------|--||----|||-||||||||-|--|||||-|||||--|---|||||--  1    [K]    COG1609 Transcriptional regulators
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1    [R]    COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  1    [V]    COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
-----------------|--|-----|||-|-----||----------------------------  1    [R]    COG1623 Predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1    [S]    COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|----------  1    [G]    COG1640 4-alpha-glucanotransferase
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1    [H]    COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
|||-|||||-------|---|----|----|||||||||-||------------------------  1    [L]    COG1658 Small primase-like proteins (Toprim domain)
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1    [R]    COG1660 Predicted P-loop-containing kinase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
|||---||--||-----||||------------------------|------------|-------  1    [R]    COG1672 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
|-|-------------||--|---------|----|||--------|-||-----|---||-|---  1    [S]    COG1683 Uncharacterized conserved protein
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
--|-----------------|-----|---------|-------------||----||--------  1    [E]    COG1687 Predicted branched-chain amino acid permeases (azaleucine resistance)
----------------|---||---|--------||||||||-----------------|||||--  1    [S]    COG1692 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1    [R]    COG1694 Predicted pyrophosphatase
|-|||||||-|||----|-|||----||||||||||||----|||||-|------|------||--  1    [K]    COG1695 Predicted transcriptional regulators
-------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|-----  1    [M]    COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export
-||--------------|--|---|-------||-|--||---|||---|-|---|---|||||--  1    [S]    COG1704 Uncharacterized conserved protein
-----------------||-||--|-----||||||||||||------------------------  1    [H]    COG1713 Predicted HD superfamily hydrolase involved in NAD metabolism
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1722 Exonuclease VII small subunit
---|----|----------|||-----||-|||||||-----|||-|--|-----|||-||||---  1    [M]    COG1732 Periplasmic glycine betaine/choline-binding (lipo)protein of an ABC-type transport system (osmoprotectant binding protein)
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  1    [S]    COG1738 Uncharacterized conserved protein
--||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||----  1    [S]    COG1739 Uncharacterized conserved protein
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  1    [R]    COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1    [E]    COG1760 L-serine deaminase
|||---||||-||-------|-----------|---------|||-|-|||---------------  1    [H]    COG1767 Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthetase
||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|--  1    [C]    COG1773 Rubredoxin
-------------|||||--||--|-----||--||||----------------------------  1    [S]    COG1774 Uncharacterized homolog of PSP1
--|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||-------  1    [R]    COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily)
||||||--||||------||||-----||-|----|-|--------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG1797 Cobyrinic acid a,c-diamide synthase
------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||--  1    [M]    COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
-----------|-----|-|||---||||-||||||||-|--|||||-|||||------|||||--  1    [G]    COG1820 N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase
|--------|-------|--|---------|-||-|||----------------------------  1    [R]    COG1827 Predicted small molecule binding protein (contains 3H domain)
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  1    [I]    COG1835 Predicted acyltransferases
----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||-------  1    [R]    COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain)
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1    [J]    COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
-----------------|||||--||-|||||||-|||----------------------------  1    [R]    COG1847 Predicted RNA-binding protein
|||----||-----------|---------------------------------------------  1    [S]    COG1852 Uncharacterized conserved protein
|||---|||-|||---|---|---------------------------------------------  1    [L]    COG1857 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
--|-|||||||-|||-----||--------------------|||----|---------|------  1    [J]    COG1859 RNA:NAD 2'-phosphotransferase
-|------------------|---|-----|-----|--------------------------|--  1    [M]    COG1861 Spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase homolog
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
--|----------||----||----|--------------------|--|-----||||----|--  1    [F]    COG1864 DNA/RNA endonuclease G, NUC1
------------||------||------------|-||----|||||-||||------|||||---  1    [C]    COG1866 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)
--|--------------|--|---|-|--|||----||----|||||-||||---|---|||||--  1    [G]    COG1879 ABC-type sugar transport system, periplasmic component
|-------|-----------|---------||||||------|||||-|-||---|----------  1    [C]    COG1882 Pyruvate-formate lyase
------|||--------|--|---|-------|-------------|-|--|--------------  1    [C]    COG1883 Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  1    [M]    COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
--||||--|--|-||--|-|||----|||-|||-||||-|--|||||-||--|--|---|||||--  1    [C]    COG1902 NADH:flavin oxidoreductases, Old Yellow Enzyme family
|||-||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---|-|----  1    [H]    COG1903 Cobalamin biosynthesis protein CbiD
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  1    [P]    COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
||||||||--||----|||||-----||--|||--|||-------||--|-----||||||||---  1    [S]    COG1917 Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain
-----------------||||---------||||||||----------------------------  1    [S]    COG1939 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
-----------------|--|---------|---||||----|||---------------------  1    [K]    COG1954 Glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1    [T]    COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  1    [V]    COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
--|---------------|-||----||||-||||||-----|||||-|||||--|---|||||--  1    [M]    COG1970 Large-conductance mechanosensitive channel
|-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|-------  1    [S]    COG1971 Predicted membrane protein
-----------------|-||---------|----|||----|||||-|--|--------------  1    [C]    COG1979 Uncharacterized oxidoreductases, Fe-dependent alcohol dehydrogenase family
------------------|||------||||--|||||----|||||-||||---|----|-----  1    [E]    COG1982 Arginine/lysine/ornithine decarboxylases
------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|--  1    [E]    COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||--  1    [H]    COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  1    [L]    COG2003 DNA repair proteins
---|---------||--|-|||--------|---||-|----|||||-||-----|---|||||--  1    [E]    COG2008 Threonine aldolase
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||--  1    [G]    COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes
----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||--  1    [H]    COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis
---|----|--|-||-----||----||||----|-|-----|--||-||-----|---|||||--  1    [I]    COG2030 Acyl dehydratase
--------|---|-------|-----|-----|----|----|------||-----||--------  1    [I]    COG2031 Short chain fatty acids transporter
|--|-------------|--|---|||-----|||--|----------|-----------------  1    [S]    COG2035 Predicted membrane protein
|||||||||||||-----||||----|||||------|----|||-|-||-----|---|||||--  1    [H]    COG2038 NaMN:DMB phosphoribosyltransferase
------||---|--------||-----||---|||-||-------|---------|----------  1    [O]    COG2039 Pyrrolidone-carboxylate peptidase (N-terminal pyroglutamyl peptidase)
------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|--  1    [E]    COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1
------------------||||----|||-||||||||-----------|||---|----------  1    [F]    COG2065 Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase
------------------|||-----|---------||----|||||-||-----|---|||||--  1    [E]    COG2066 Glutaminase
----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||--  1    [I]    COG2067 Long-chain fatty acid transport protein
||-|||--||||------|||---------|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG2073 Cobalamin biosynthesis protein CbiG
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG2082 Precorrin isomerase
------------------||||----|||-|----|-|----|||-|-||-----|---||||---  1    [H]    COG2087 Adenosyl cobinamide kinase/adenosyl cobinamide phosphate guanylyltransferase
--------|-----------|----|----|---||||----------------------------  1    [M]    COG2088 Uncharacterized protein, involved in the regulation of septum location
-||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|--  1    [M]    COG2089 Sialic acid synthase
---||||||-|||-------||----||||-----|||--------|--|-----|---|||||--  1    [S]    COG2096 Uncharacterized conserved protein
||----------------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG2099 Precorrin-6x reductase
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  1    [H]    COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
--||||||--|------|||||-----||-------------|||||-||-----|---||||---  1    [H]    COG2109 ATP:corrinoid adenosyltransferase
--|-||||||||||--||--||-----||---|-||------|||-|--|-----|------|---  1    [R]    COG2110 Predicted phosphatase homologous to the C-terminal domain of histone macroH2A1
---------|---|------|---------|||||||-----|||||-||||--------------  1    [P]    COG2116 Formate/nitrite family of transporters
----------------|---|-----------------------------------|||--|||||  1    [S]    COG2121 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-||||||---||--|--||--|-----||||||||-|--------|-----------------  1    [F]    COG2131 Deoxycytidylate deaminase
-----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------  1    [R]    COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||--  1    [M]    COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis
----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||--  1    [N    U]    COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG
-----------------|--|---------||||||||||||------------------------  1    [L]    COG2176 DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type)
-------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1    [D]    COG2177 Cell division protein
-------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||---  1    [K]    COG2183 Transcriptional accessory protein
---||||||--||-------||----||||-------|----|||----------|---|||||--  1    [I]    COG2185 Methylmalonyl-CoA mutase, C-terminal domain/subunit (cobalamin-binding)
-----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|---  1    [L]    COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod
--------------------|----||---||||||||-|||||||||||||---|-------|--  1    [G]    COG2190 Phosphotransferase system IIA components
-----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [K]    COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins
-----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|---  1    [T    K]    COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit
--||||--|-||----|---|-------------|-|-----------------------------  1    [S]    COG2210 Uncharacterized conserved protein
------------------|||---------||----|-----|||||----------------|--  1    [G]    COG2211 Na+/melibiose symporter and related transporters
-|------------------|---|-----------------|||||---||---|---||||---  1    [R]    COG2215 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
||||||||||||||---|||||----|||-|-||||||----|||||-||-||--|--|||||--|  1    [R]    COG2220 Predicted Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold
|-----||-|-------|--||--------|-||-||-----|||||--|--|------|||||--  1    [M]    COG2222 Predicted phosphosugar isomerases
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||----  1    [F]    COG2233 Xanthine/uracil permeases
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  1    [P]    COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG2241 Precorrin-6B methylase 1
||||||--||||------|||-----|||-|----|----------|--|---------||||---  1    [H]    COG2242 Precorrin-6B methylase 2
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG2243 Precorrin-2 methylase
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [R]    COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
--|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||--  1    [R]    COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1    [L]    COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1    [R]    COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [J]    COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
-------||----||--|-|||----||||||--||||----|||||-||||---|---|||||--  1    [I]    COG2267 Lysophospholipase
---|-------||-------||----|||--||---------|||||-|||----|---|||||--  1    [G]    COG2301 Citrate lyase beta subunit
------------------||||---------|||||||----------------------------  1    [S]    COG2302 Uncharacterized conserved protein, contains S4-like domain
--|-----|--||-----||||---|||||------||----|--||-||------------|---  1    [R]    COG2304 Uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain
--------------------||----|----|||-||-----|||||--|-----|---|--||--  1    [S]    COG2315 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|--||--|||-------||-------------|||-------|--|-------------|--|  1    [E]    COG2317 Zn-dependent carboxypeptidase
--|----------|||-|||||--------------------------|----------|||||--  1    [R]    COG2319 FOG: WD40 repeat
-------------------|||--------||-|--||----|||-|-------------|-----  1    [S]    COG2323 Predicted membrane protein
--|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||--  1    [R]    COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)
--------|----|-|---|||---||---|---||||-----------|---------|||||--  1    [S]    COG2340 Uncharacterized protein with SCP/PR1 domains
------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||--  1    [S]    COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------||----|||-||||||||----------------------------  1    [S]    COG2357 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||||-----||||||||||----------------------||-----  1    [V]    COG2367 Beta-lactamase class A
-----------------|-|||--------------------|||||--|-||--|---||-||||  1    [R]    COG2373 Large extracellular alpha-helical protein
--------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||--  1    [K]    COG2378 Predicted transcriptional regulator
------------------||||--------|-----||----------------------------  1    [D]    COG2385 Sporulation protein and related proteins
--------|---|-------||----|----|--||------|||---||-|-------|||||--  1    [R]    COG2388 Predicted acetyltransferase
--||-------||-------|---------------|-------------------|||-------  1    [R]    COG2404 Predicted phosphohydrolase (DHH superfamily)
------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||-----------  1    [S]    COG2431 Predicted membrane protein
----||----|||----|--|---------------------|||-|-------------|-|---  1    [C]    COG2440 Ferredoxin-like protein
-------||--------|--|---------||-|---|----------------------------  1    [S]    COG2461 Uncharacterized conserved protein
-------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||----------  1    [S]    COG2501 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---|-------||----|---|||||---||--------------  1    [E]    COG2502 Asparagine synthetase A
--|---||||||-----||-|---------||-----|----------|--------------|--  1    [R]    COG2509 Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases
|||------|--------|||---------|-----------------------------|-|---  1    [C]    COG2710 Nitrogenase molybdenum-iron protein, alpha and beta chains
--------------------|---------|--|-----|--|||||-|-||----||--------  1    [G]    COG2731 Beta-galactosidase, beta subunit
--------------------|---------|||||||||||-------------------------  1    [S]    COG2739 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|||----||||||||||||||----------------||||||||--  1    [K]    COG2740 Predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination
----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|---  1    [F]    COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1    [N    U]    COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||----------  1    [N    U]    COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
-----------------|--||--||||||||||||||----------------------------  1    [S]    COG2815 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||--  1    [L]    COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain
--------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||----  1    [S]    COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  1    [M]    COG2853 Surface lipoprotein
--------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||--  1    [S]    COG2855 Predicted membrane protein
-------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|----  1    [E]    COG2856 Predicted Zn peptidase
--------------------|---||----|||||||||-||------------------------  1    [J]    COG2868 Predicted ribosomal protein
--|-||||--||||---|--||--------|------|----------||-----|---||||---  1    [R]    COG2872 Predicted metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase HxxxH domain
||||||--||||------|||------||-|----|----------|--|-----|---||||---  1    [H]    COG2875 Precorrin-4 methylase
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1    [E]    COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
--|--------------|--|---------------------||||||||||||||----------  1    [C]    COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
--------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||--  1    [G]    COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA
----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||---  1    [D]    COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase
--------------------|---------------------|||||||-||--------------  1    [S]    COG2926 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|---  1    [S]    COG2928 Uncharacterized conserved protein
--------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||--  1    [K]    COG2932 Predicted transcriptional regulator
--------------------|-----------|---------|||||-||||---|--|-|-----  1    [S]    COG2964 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1    [S]    COG2966 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---------|-||||||----------||--|--|----------  1    [T]    COG2972 Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain
----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
---|----------------|-----|---------------|||||-|-||--------------  1    [R]    COG2985 Predicted permease
--------------------|---------------------|||-|-|---------|-------  1    [R]    COG2992 Uncharacterized FlgJ-related protein
--------------------|---------||||||||----------||----------------  1    [S]    COG2996 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|----||----|||||---|--|||||-|-||---------|----  1    [G]    COG3010 Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  1    [S]    COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  1    [V]    COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
--------------------|---------------||----|||-|-||----------------  1    [E]    COG3048 D-serine dehydratase
--------------------|----------||---------|||-|-|-|---------------  1    [C]    COG3051 Citrate lyase, alpha subunit
--------------------|----------||---------|||-|-|-|---------------  1    [C]    COG3052 Citrate lyase, gamma subunit
--------------------|----------||---------|||-|-|-|---------------  1    [C]    COG3053 Citrate lyase synthetase
--------------------|---------------------|||||-|-||---------|----  1    [S]    COG3055 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----------||--------|||||-|-|-|------||----|  1    [L]    COG3077 DNA-damage-inducible protein J
-----------------|--|---------------------|||||-||||--------------  1    [T]    COG3086 Positive regulator of sigma E activity
-------------------||-----|---------------|||---|||-|-------|-||--  1    [R]    COG3093 Plasmid maintenance system antidote protein
--------------------|----------|||-|------|||||-|--||------||-||--  1    [P]    COG3142 Uncharacterized protein involved in copper resistance
-------------------||-----|-------|-||----|||-|-||---------||-|---  1    [R]    COG3180 Putative ammonia monooxygenase
--------------------|-----|---------||--------|-||-|---|---||-----  1    [S]    COG3181 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---------------|-||----|---------------|||||-||-----||||||||---  1    [O]    COG3187 Heat shock protein
--------------------|--------------||-----|||-|--|----------------  1    [E]    COG3192 Ethanolamine utilization protein
---|------|--------||-----|||--|--|--|----||||--||---------||-||--  1    [P]    COG3221 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component
--------|-----------||-----|---------------------|-----|---||-|---  1    [S]    COG3246 Uncharacterized conserved protein
--------------------|----------------|----|||-|-||---------|--|---  1    [P]    COG3263 NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters with a unique C-terminal domain
--------------------|-------------|-|-----|||||-|-----------|-----  1    [T]    COG3275 Putative regulator of cell autolysis
--------------------|---------||||||||----|||||-||--|--|---|||||--  1    [K    T]    COG3279 Response regulator of the LytR/AlgR family
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  1    [M]    COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
--------------------|-----||-||---||||-----------|----------------  1    [S]    COG3323 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|----------|--------|-||-|---|---||-----  1    [S]    COG3333 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|||----|--------|||----|||-|---||--------------  1    [E]    COG3340 Peptidase E
--|----------|----|||------||-|---|--|----|--||-||----------|-----  1    [L]    COG3344 Retron-type reverse transcriptase
------------------|||----------------|----|--||---||-------||||---  1    [S]    COG3395 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------||---------|-|||-|----|||-----------------|---  1    [S]    COG3412 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  1    [G]    COG3444 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB
--------------------|---|--------------------|-----|------|--|----  1    [P]    COG3470 Uncharacterized protein probably involved in high-affinity Fe2+ transport
--------------------|----------|-|----------------|-------------||  1    [M]    COG3475 LPS biosynthesis protein
-||-----------------|----------|----|-----------------------------  1    [R]    COG3478 Predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon domain
-|-------|----------|---------||||||||----------------------|-----  1    [R]    COG3481 Predicted HD-superfamily hydrolase
--------------------|----------||---||--------|-|-----------------  1    [C]    COG3493 Na+/citrate symporter
----------------|---|--------------------------------------|||||||  1    [S]    COG3494 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||--  1    [R]    COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes
|||----------------|||-----|||--|----------------|---------||-||--  1    [R]    COG3576 Predicted flavin-nucleotide-binding protein structurally related to pyridoxine 5'-phosphate oxidase
----------------||--|---------||---|------------------------------  1    [S]    COG3580 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------||--|---------||---|------------------------------  1    [S]    COG3581 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-------------------------|----|-||-||--------  1    [V]    COG3587 Restriction endonuclease
---------------|--|-|---------|---|-----------------|------||-|---  1    [G]    COG3588 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
-||---------------|-|---------------------|||||-||-|-------|--|---  1    [L]    COG3593 Predicted ATP-dependent endonuclease of the OLD family
|------------||-----|-----|||-|--|||-|----|||||-|-|||-----|-------  1    [S]    COG3610 Uncharacterized conserved protein
-------------||-----|-----|||--------------------|-----|---|||||--  1    [E]    COG3616 Predicted amino acid aldolase or racemase
--|---------------|-|------||-||||-||------------|-----|---||||---  1    [S]    COG3619 Predicted membrane protein
---|---------------||-----|----|--|--|-|--||||---|---------||-||--  1    [P]    COG3638 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component
---|------|--------||-----|----|--|--|-|||||||---|---------||-||--  1    [P]    COG3639 ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component
--------------------|---|-------|-||-|----------------------------  1    [R]    COG3641 Predicted membrane protein, putative toxin regulator
-|------------------|---------------------|||-|---|---------------  1    [S]    COG3681 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---|--------------------||---||-------||||---  1    [R]    COG3683 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
------------------||||----------||--------------------------------  1    [R]    COG3694 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
--------------------|-----------|---------|||-|-|-|---------------  1    [H    I]    COG3697 Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase)
--------------------|------||||----|-------------|-----|---||-||--  1    [T]    COG3707 Response regulator with putative antiterminator output domain
--------------------|-----|---||||||||----|||||-------------------  1    [K]    COG3711 Transcriptional antiterminator
--------------------|---------------------|||||-|--|---|---||-||--  1    [M]    COG3713 Outer membrane protein V
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  1    [G]    COG3715 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC
--------------------|---------||||-||-----|||||----|--------------  1    [G]    COG3716 Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID
--------------------|-----------|---------||||---|-----|---||||---  1    [S]    COG3758 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||-----|---------------------------|--|---|---|------  1    [M]    COG3774 Mannosyltransferase OCH1 and related enzymes
--|-------|------|--|--------------------------------------|||||--  1    [C]    COG3808 Inorganic pyrophosphatase
-------------------|||--------------------|||--------------|--|---  1    [S]    COG3831 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||---||||||--|-||||||||||||-||||||||-||-||--|--|||||---  1    [G]    COG3839 ABC-type sugar transport systems, ATPase components
--------------------|---------||--|||-----------------------------  1    [G]    COG3855 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------|---------|--|---------|-----------------------------------  1    [S]    COG3862 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs
-----------------|--|---------|----|||----------------------------  1    [R]    COG3872 Predicted metal-dependent enzyme
--------------------||--------|---|||-----------------------------  1    [S]    COG3878 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|-----|---|---|-------------|-------||--------  1    [L]    COG3886 Predicted HKD family nuclease
--------------|----||--------||-|---------------------------|-|---  1    [R]    COG3899 Predicted ATPase
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1    [G]    COG3958 Transketolase, C-terminal subunit
-|--||-|--|||----|--|------------|-----------||------------||-|---  1    [G]    COG3959 Transketolase, N-terminal subunit
--------------------|-----|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG4120 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
--||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|---  1    [R]    COG4122 Predicted O-methyltransferase
--------|-----------|----|----------------|||||---||--------------  1    [H]    COG4145 Na+/panthothenate symporter
-----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||---  1    [E]    COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component
--------------------|---------------------|||||-||-----|---||||---  1    [R]    COG4172 ABC-type uncharacterized transport system, duplicated ATPase component
-|------|-|||----|||||----|------|---|----|||||--|-----|--|||||---  1    [E]    COG4177 ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component
--------------------|---|-----------------|||||-|-||--------------  1    [G]    COG4211 ABC-type glucose/galactose transport system, permease component
---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||----  1    [R]    COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity
--------------------|---------||||||||----------------------------  1    [S]    COG4224 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------|--|---------|------------------|-----|----------  1    [S]    COG4267 Predicted membrane protein
|-------------------|---------|----------------------------|---|--  1    [R]    COG4277 Predicted DNA-binding protein with the Helix-hairpin-helix motif
--------------------|---------|----|------|||-|--|-----|----------  1    [E]    COG4302 Ethanolamine ammonia-lyase, small subunit
--------------------|---------|----|------|||-|--|-----|----------  1    [E]    COG4303 Ethanolamine ammonia-lyase, large subunit
--------------------|------------------------|-----|------|-------  1    [S]    COG4393 Predicted membrane protein
--------------------|----------------------------|----||----------  1    [S]    COG4394 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|||-------------||||----------------------------  1    [S]    COG4399 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||--|---------|------  1    [V]    COG4452 Inner membrane protein involved in colicin E2 resistance
--------------------|---------||-|--||----------------------------  1    [G]    COG4468 Galactose-1-phosphate uridyltransferase
--------------------|---------|---|-||----------------------------  1    [R]    COG4492 ACT domain-containing protein
--------------------|---|-------------------------||--------------  1    [O]    COG4545 Glutaredoxin-related protein
-------------------||------||--|-----|----------------------------  1    [R]    COG4552 Predicted acetyltransferase involved in intracellular survival and related acetyltransferases
------------------|||--------------|------|||-|-------------------  1    [Q    C]    COG4576 Carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein
-------------||---||||----------||--------------------------------  1    [R]    COG4586 ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component
------------------||||----------||--------------------------------  1    [R]    COG4587 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
--------------------|---------------------||||--||-|--------|-----  1    [R]    COG4589 Predicted CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
-------------------|||--------|---------------------------|-------  1    [R]    COG4639 Predicted kinase
--|--------------|--|---||---------|------||||||||||--------------  1    [C]    COG4656 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC
--|--------------|--|---------------------||||||||||--------------  1    [C]    COG4657 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfA
--|--------------|--|---|-----------------||||||||||--------------  1    [C]    COG4658 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfD
--|--------------|--|---------------------||||||||||--------------  1    [C]    COG4659 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfG
--|--------------|--|---------------------||||||||||--------------  1    [C]    COG4660 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfE
--------------------|-----|---|-----------|||||-|--|--------------  1    [R]    COG4667 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
---||-----|-|-------|-------------||-|----|||-|--------|----|||---  1    [I]    COG4670 Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase
----------------||--|---------------------------------------------  1    [S]    COG4752 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----------||||||----------------------------  1    [T]    COG4753 Response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain
--------------------|--------------|------|||-|------------|------  1    [E]    COG4766 Ethanolamine utilization protein
-----------------|--|---|------|---|------------------------------  1    [S]    COG4769 Predicted membrane protein
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
--------------------|------------------------------|-||---------||  1    [R]    COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase
---|--|||--|-||--|--||----||||------||-----------|-----|---|||||||  1    [I]    COG4799 Acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)
--|-----------------|---------------------|||-|--------|---------|  1    [S]    COG4804 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---------------------|||||--|----------------  1    [S]    COG4807 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|--------------|------|||-|-------------------  1    [E]    COG4810 Ethanolamine utilization protein
--------------------|--------------|------|||-|-------------------  1    [E]    COG4812 Ethanolamine utilization cobalamin adenosyltransferase
--------------------|--------------|------|||-|-------------------  1    [E]    COG4816 Ethanolamine utilization protein
--------------------|--------------|------|||-|-------------------  1    [E]    COG4819 Ethanolamine utilization protein, possible chaperonin protecting lyase from inhibition
--------------------|--------------|------|||-|-------------------  1    [E]    COG4820 Ethanolamine utilization protein, possible chaperonin
--------------------|---------|----|----------|-------------------  1    [H]    COG4822 Cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase
--------------------|--------------|---------------|--------------  1    [V]    COG4823 Abortive infection bacteriophage resistance protein
--|-----------------|----------|---|------------------------------  1    [S]    COG4832 Uncharacterized conserved protein
--------------------|---------------|-----------------------|-|---  1    [R]    COG4857 Predicted kinase
--------------------|----------------------------|---||-----------  1    [S]    COG4859 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---|----------------|----------------------||---------------------  1    [E]    COG4865 Glutamate mutase epsilon subunit
--|-----------------|-----------------|-----------------||--------  1    [S]    COG4866 Uncharacterized conserved protein
--------------------|-----|-----||--------------------------------  1    [S]    COG4868 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----|-----------|---------|---------------------|-------------  1    [O]    COG4870 Cysteine protease
--------------------|---------------------------|------|----------  1    [S]    COG4874 Uncharacterized protein conserved in bacteria containing a pentein-type domain
--------------------|--------------|------|-----------------------  1    [S]    COG4884 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||-----------------|---------------------------------------------  1    [S]    COG4907 Predicted membrane protein
--|-----------------|-----|----|---|------------------------|-|--|  1    [L]    COG4912 Predicted DNA alkylation repair enzyme
--------------------|--------------|------|||-|-------------------  1    [E]    COG4917 Ethanolamine utilization protein
--------------------|------------|---------------------|---|------  1    [S]    COG4922 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-------------|-------------------------|-----  1    [R]    COG4927 Predicted choloylglycine hydrolase
--|----------------||------------------------|-----|---------|----  1    [S]    COG4929 Uncharacterized membrane-anchored protein
--------------------|---|----------|------------------------------  1    [S]    COG4939 Major membrane immunogen, membrane-anchored lipoprotein
--------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||--  1    [D]    COG4942 Membrane-bound metallopeptidase
---|||--||-||----|||||----||||||--||||----|||||--|-----|---|||||--  1    [M    R]    COG4948 L-alanine-DL-glutamate epimerase and related enzymes of enolase superfamily
-------------------||---------------------|||-|----||------||-||-|  1    [M]    COG4953 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG4974 Site-specific recombinase XerD
--------------------|------------------------|-----|--------------  1    [S]    COG4984 Predicted membrane protein
--------------------|-----|||--||-||||----|||||-|-||-------|-|-|--  1    [C    O]    COG4988 ABC-type transport system involved in cytochrome bd biosynthesis, ATPase and permease components
--|-----------------|---------|----------------------------------|  1    [S]    COG4997 Uncharacterized conserved protein
|-|-----|-----------|---------------------------------------|-|---  1    [R]    COG5012 Predicted cobalamin binding protein
--|-----------------|---------|---------------------------|-------  1    [S]    COG5015 Uncharacterized conserved protein
|||---|-|-------||--|---|-------|-------------|-||-|------|-------  1    [C]    COG5016 Pyruvate/oxaloacetate carboxyltransferase
-------------||-----|---------------------------------------------  1    [S]    COG5324 Uncharacterized conserved protein
-----------------|--|----------|---|------------------------------  1    [S]    COG5341 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|---||--|-------------------------------  1    [S]    COG5438 Predicted multitransmembrane protein
--|--------||----|--||----|-----|---------------------------------  1    [R]    COG5496 Predicted thioesterase
-------|------------|---------------||----------------------------  1    [S]    COG5505 Predicted integral membrane protein
--------------------|---|-|---------|-----------------------------  1    [S]    COG5522 Predicted integral membrane protein
--------------------|------|||--------------------------||--------  1    [N]    COG5651 PPE-repeat proteins

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