(NmA) Neisseria meningitidis Z2491
generin.cgi	Functional categories
	Fun	All	J	A	K	L	B	D	Y	V	T	M	N	Z	W	U	O	C	G	E	F	H	I	P	Q	R	S
	COGs	1,260	132	1	50	91	1	22	-	15	26	99	20	-	1	47	58	95	47	120	47	81	36	66	14	134	151
	proteins	1,607	154	1	74	164	1	25	-	17	31	133	31	-	1	66	76	120	67	158	50	89	44	97	27	194	168
	Distribution of COGs by number of proteins
	proteins	1	2	3	4	5	6	8	9	10	15	18
	COGs	1050	156	28	13	4	2	2	2	1	1	1

Co-ocurrences in sister taxa	0	1
order Neisseriales	34	1226

+    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    ++    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +
---|----------------------------------------------|--||----------- 18    [L]    COG3676 Transposase and inactivated derivatives
--||||---------------------||-------------|-----|----|||---||-|--- 15    [L]    COG3039 Transposase and inactivated derivatives, IS5 family
----------------|-------------------------|||||-||||||||---------- 10    [N    U]    COG4969 Tfp pilus assembly protein, major pilin PilA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  9    [G    E    P    R]    COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  9    [O    C]    COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  8    [Q    R]    COG0500 SAM-dependent methyltransferases
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||--  8    [P]    COG1629 Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport
||------||------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  6    [K]    COG0583 Transcriptional regulator
--------------------------|||--|-|---|-|--|||--------|||---||--|--  6    [L]    COG2826 Transposase and inactivated derivatives, IS30 family
||||||||||||||||||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  5    [M]    COG0438 Glycosyltransferase
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  5    [L    R]    COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
|-|-------|-----||-|||--|-|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||||  5    [K]    COG1396 Predicted transcriptional regulators
--|--------|-------||-----||||--||---|-------|---|---||----||-||--  5    [L]    COG3547 Transposase and inactivated derivatives
||----||-||||-|---||------|---|-||--||||--|||-|-|-|-||||||--|-||--  4    [L]    COG0270 Site-specific DNA methylase
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  4    [K    R]    COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4    [J]    COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  4    [E]    COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  4    [G    E    R]    COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
-------------|||||||||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  4    [O]    COG0760 Parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  4    [L]    COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----------------||||||--|||---|-||||||----|||||-||||||||||||||||||  4    [M]    COG0845 Membrane-fusion protein
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  4    [M]    COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
--|--------------|||||----|||-||||||||----|||||-||||||||--|-------  4    [L]    COG1555 DNA uptake protein and related DNA-binding proteins
----------------|-||-------------------------|--||--||||---||-||--  4    [Q]    COG2931 RTX toxins and related Ca2+-binding proteins
------------------------------------|-----------|---|||-----------  4    [L]    COG2946 Putative phage replication protein RstA
------------------------------------------|||||---||-||----||||---  4    [M    U]    COG3468 Type V secretory pathway, adhesin AidA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [J]    COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
-|||||||||-||||-|-||||----|||-||||---|----|||||-|-||-|||---|-|||--  3    [P]    COG0038 Chloride channel protein EriC
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3    [J]    COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
--||||--|-|||||-|-||||----|||||-----||----|||||-||||||||||||||||--  3    [C]    COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenases
||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  3    [M]    COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  3    [R]    COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
|-||--|||----|--|-||-|--|||||-|||||||||---|||||-||||||||||||||||--  3    [R]    COG0546 Predicted phosphatases
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  3    [T]    COG0642 Signal transduction histidine kinase
---|----|-|-|----|||||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  3    [E]    COG0687 Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein
|||||||||||||---||||||----|--|||--||||----|||||-||||||||||||||||--  3    [R]    COG0730 Predicted permeases
----------------||||----||----||||-|||----||||||||||||||||||||||||  3    [M]    COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM/invasin domains)
-------------|||-----|--------------------|||||-||||-|||||||||||--  3    [R]    COG0790 FOG: TPR repeat, SEL1 subfamily
||||||---||||||-|-||||----|||||||||||||---|||||-||-|-|||||||||||-|  3    [C]    COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases
--|||||||--||||--|-|-|-----||-||||||||--|-|||||-|||-||||---||-||--  3    [E    R]    COG1063 Threonine dehydrogenase and related Zn-dependent dehydrogenases
--|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||----  3    [E]    COG1115 Na+/alanine symporter
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  3    [J]    COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  3    [C]    COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
--||||-----|-----|-|||------|-|--|---|----|||||-|||--|||||----||--  3    [L]    COG1943 Transposase and inactivated derivatives
-----------------||||-----|||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||--  3    [K]    COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins
--|-||--|----||---||||----|||--|||||-|||--|||||-|||--|||---|||||--  3    [L]    COG2801 Transposase and inactivated derivatives
---|----------------|----------|||||||----|||||-||---||-----||||--  3    [L]    COG2827 Predicted endonuclease containing a URI domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [J]    COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  3    [U]    COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion
|-|----------------------------------------------|---|||--|-------  3    [R]    COG3271 Predicted double-glycine peptidase
-----------------------------------||-----|-||----|-|-|-----------  3    [S]    COG3299 Uncharacterized homolog of phage Mu protein gp47
--||----|-|-|----|||||--|||---||||||-||||||||||-||||-|||--||||||--  3    [E]    COG3842 ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components
--------------------------------------------|-----|--||-----------  3    [S]    COG4382 Mu-like prophage protein gp16
------------------------------------------|||||--|---||-----------  3    [P]    COG4773 Outer membrane receptor for ferric coprogen and ferric-rhodotorulic acid
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  2    [J]    COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [D]    COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0050 GTPases - translation elongation factors
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  2    [G]    COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [R]    COG0073 EMAP domain
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0084 Mg-dependent DNase
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  2    [R]    COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
||||----|||--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [E    H]    COG0115 Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase
|||----||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  2    [E    G]    COG0129 Dihydroxyacid dehydratase/phosphogluconate dehydratase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [H]    COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2    [J]    COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [E    H]    COG0147 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  2    [G]    COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
-||||-||-||||||---||||----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  2    [E    H]    COG0175 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase and related enzymes
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
||||||--|||||---|-||||----||||-|----||----|||||-||||-||||||||||---  2    [C]    COG0247 Fe-S oxidoreductase
---|--||--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [J]    COG0251 Putative translation initiation inhibitor, yjgF family
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0254 Ribosomal protein L31
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  2    [J]    COG0257 Ribosomal protein L36
--|--------------|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||-|||-|||-||  2    [C]    COG0282 Acetate kinase
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [I    Q]    COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
|||-|||||||||---||||-|-----||-|------|----||||||||||||||---|||||--  2    [R]    COG0312 Predicted Zn-dependent proteases and their inactivated homologs
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [R]    COG0313 Predicted methyltransferases
--|----------||-|-||-|----||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  2    [S]    COG0316 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||---||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||-|  2    [T    K]    COG0317 Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  2    [I    Q]    COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  2    [E]    COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
|-||--|||--||||---||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  2    [E]    COG0346 Lactoylglutathione lyase and related lyases
|-||||--|-|||||-||||-|----||||-|--||||----|||||-||-|||||||||||||||  2    [C]    COG0372 Citrate synthase
--|----------|--|-||------|--|----|-||----|||||--|---|||---|||||--  2    [R]    COG0385 Predicted Na+-dependent transporter
-|--|||||||||||-||---|----|---|--|--||----||||||-|--||||||----|---  2    [E]    COG0421 Spermidine synthase
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  2    [D]    COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [E]    COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [O]    COG0443 Molecular chaperone
||||||||||||-||-||||||---|||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  2    [M    G]    COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  2    [P]    COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
||||--||||||||--||||-|---|||||-|||||||----|-||||||||||||--||||||||  2    [G]    COG0483 Archaeal fructose-1,6-bisphosphatase and related enzymes of inositol monophosphatase family
||||||||||||||||||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [R]    COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases
|||||||||||||||||-||||----|||||-||-|||----||||||||||||||||||||||--  2    [O]    COG0501 Zn-dependent protease with chaperone function
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  2    [C]    COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
|||-||--|--|-||||-||||--|-||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||  2    [L    K    J]    COG0513 Superfamily II DNA and RNA helicases
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [F]    COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0517 FOG: CBS domain
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [F    G    R]    COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  2    [O]    COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
-------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|--  2    [O]    COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||-|  2    [E]    COG0548 Acetylglutamate kinase
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  2    [K]    COG0557 Exoribonuclease R
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  2    [E]    COG0560 Phosphoserine phosphatase
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [J]    COG0566 rRNA methylases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [K]    COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
----||-----|------||-|--||||||||--||||----|||||||||||||||||--|||--  2    [S]    COG0586 Uncharacterized membrane-associated protein
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
--||||--|-|||||||-||||---|||||||-||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0596 Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) 
|-||||--|-||-||||-||||---|||||||||||||----|||||||||||||||||||-||||  2    [P]    COG0607 Rhodanese-related sulfurtransferase
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  2    [O    U]    COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
--||||||--|||||--|--||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2    [E]    COG0626 Cystathionine beta-lyases/cystathionine gamma-synthases
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  2    [C]    COG0633 Ferredoxin
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  2    [H]    COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  2    [R]    COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
|-||---------|||--||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2    [O]    COG0652 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family
|||---||||------|||||------||-------||----|||||-||--||||||-|||||--  2    [G]    COG0662 Mannose-6-phosphate isomerase
|||||||||||||-||||||||--|||||-||||||||----||||||||--||||||||||||||  2    [M]    COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
|-||----|----|||-|||-|----|||||||||||-----|||||-||||||||---|||||||  2    [O]    COG0695 Glutaredoxin and related proteins
|-|-||--|--|-|||--||||--|||||-||||-||-----|||||-||||||||||||||||||  2    [L]    COG0708 Exonuclease III
-|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||-------  2    [R]    COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family
--|-||--|-|||---||||||---||||||||-||||--|||||||-||||||||||||||||--  2    [P]    COG0735 Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins
----------------||||||--||||||||--||||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0739 Membrane proteins related to metalloendopeptidases
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  2    [E]    COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
|||||--||||||---||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  2    [C]    COG0778 Nitroreductase
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [K]    COG0782 Transcription elongation factor
------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||--  2    [M]    COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins)
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0795 Predicted permeases
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  2    [H]    COG0807 GTP cyclohydrolase II
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  2    [E    T]    COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
----------------|-|||---------------------|||||-|||||||||||---||--  2    [M]    COG0859 ADP-heptose:LPS heptosyltransferase
------------------||-|----|||-|---||||----||||||||||||||||||||||||  2    [P]    COG0861 Membrane protein TerC, possibly involved in tellurium resistance
---|---------||-----||----|||-----|-||----||||||||--||||---|||||--  2    [C]    COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [I    Q    R]    COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
----------------||||||--||-||-||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  2    [R]    COG1040 Predicted amidophosphoribosyltransferases
----||||--|||||-|-|||---|-----|-|-||||----|||||-||||-|||||||||||--  2    [C    H    R]    COG1052 Lactate dehydrogenase and related dehydrogenases
|------------||-|-||||----|---||-|-|||--|||||||-||||-|||||||||||--  2    [M]    COG1087 UDP-glucose 4-epimerase
|-|--||||--||-|---||||----|||||||---||----|||||--|||||||---||-||--  2    [M]    COG1088 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2    [G]    COG1109 Phosphomannomutase
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  2    [E]    COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [V]    COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [V]    COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
---|--||--|-|-----||||--|-|------|---|----|||||-||||-|||--|||||---  2    [P]    COG1178 ABC-type Fe3+ transport system, permease component
|-|||||||--||----|||-|----|||||||---||----|||||--|--||||---||-||--  2    [M]    COG1209 dTDP-glucose pyrophosphorylase
------------------|--|------------|||-----|||||-||||||||--|||||---  2    [S]    COG1289 Predicted membrane protein
|-||---||--|----||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  2    [K]    COG1309 Transcriptional regulator
-----------------|------------|||-|||-----|||-|-||||-||-|||||-|---  2    [M]    COG1368 Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily
-------------------|||----|--||||||||||-|||||||-||||||||--||||||--  2    [P]    COG1393 Arsenate reductase and related proteins, glutaredoxin family
-------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|---  2    [E]    COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
||||--|||-------|---||----|---|-------||--|||||-||--||||||||||||-|  2    [R]    COG1451 Predicted metal-dependent hydrolase
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  2    [H]    COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
|||||||||||||--------|----|||-|-----||----|||||-||||-|||---|||||--  2    [K]    COG1522 Transcriptional regulators
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  2    [J]    COG1530 Ribonucleases G and E
----------------|-|||---------------------|||||-||||||||||||||||||  2    [M    U]    COG1538 Outer membrane protein
------|------|-----|-------|||||---||--|--|||--------||-----------  2    [G]    COG1554 Trehalose and maltose hydrolases (possible phosphorylases)
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  2    [M]    COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
|--|-------|-||---||-|----|||-----|-|---------------||||---|||||--  2    [I]    COG1562 Phytoene/squalene synthetase
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  2    [I]    COG1607 Acyl-CoA hydrolase
---|----||-|---------|---|--------|-||----|||-|-||||-||||||--|----  2    [C]    COG1620 L-lactate permease
-------------|||-----|--|||---------------|||||-||||||||---|||||--  2    [L]    COG1643 HrpA-like helicases
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  2    [D]    COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  2    [M]    COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
|--------|--------||-------||||----|||----------|||--|||||||||||||  2    [S]    COG1714 Predicted membrane protein/domain
---|--||----|-------|----|----|---|-||-------||-|-||-||-|||-------  2    [C]    COG1757 Na+/H+ antiporter
--||||--|||||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  2    [U]    COG1826 Sec-independent protein secretion pathway components
--|----------------|||----||||-||||||------||-|--||-||||---|||||-|  2    [I]    COG1835 Predicted acyltransferases
|||||||||||||----|-|||----||||||||||||----|||||-||--||||---|||||--  2    [K]    COG1846 Transcriptional regulators
|-|--||||--||-----||||----|||||||||-||----|---|--|-|||||--||||||--  2    [M]    COG1898 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzymes
----||-----|-||----|||----||||||-|||||----|||||--|||||||---||||---  2    [P]    COG1914 Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
----------------||||||-----||-||-|||||----|||||-||||||||--||||||||  2    [K]    COG1959 Predicted transcriptional regulator
---|||--|-||||-----|||----|||||---|-||----|||||-||---|||---|||||--  2    [I]    COG1960 Acyl-CoA dehydrogenases
--|-----|---------||-|----||||------||----------||---|||||||||||--  2    [C]    COG2010 Cytochrome c, mono- and diheme variants
-----|--|-----------|-----|------|-|--||------|---|||-|-||-|--|---  2    [L]    COG2189 Adenine specific DNA methylase Mod
------------------||-------|||------------|||||-||--||||---|||||--  2    [P]    COG2193 Bacterioferritin (cytochrome b1)
------------------------------------------|||||-|||||||-||||||--||  2    [R]    COG2194 Predicted membrane-associated, metal-dependent hydrolase
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  2    [T]    COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  2    [P]    COG2217 Cation transport ATPase
-------|------|--|--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---|||----  2    [F]    COG2233 Xanthine/uracil permeases
--|-----------|-----|---------|----||||---|||||-||||-||||||-|-||--  2    [R]    COG2249 Putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)
---|-------|-||----|-|----||||----|-||----|||||-||||-|||---|||||--  2    [S]    COG2259 Predicted membrane protein
-|-------------------|-------------|--------|-----|-|||-----------  2    [S]    COG2369 Uncharacterized protein, homolog of phage Mu protein gp30
-----------|-||---||-------|||||||-|||----|||||-||-|-|||--||||||--  2    [E]    COG2755 Lysophospholipase L1 and related esterases
-------------------|-|----|||-----|||-----|||||-||-|-|||------|---  2    [P]    COG2837 Predicted iron-dependent peroxidase
-------------------|-|------------||--------|-----|--||-----------  2    [R]    COG2842 Uncharacterized ATPase, putative transposase
-|--------------|---|---------------------||||||-|||-||||||---||--  2    [M]    COG2870 ADP-heptose synthase, bifunctional sugar kinase/adenylyltransferase
------------------------------------------||||||||||||||---|||||||  2    [J]    COG2913 Small protein A (tmRNA-binding)
--------------------|----------||-|--------|--|--||||||----|||||--  2    [K]    COG2932 Predicted transcriptional regulator
------------------------------------------|||||-||||||||----------  2    [S]    COG3117 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--||------------|--||-----|-----|-||-------|||---|-|-|||||-||-|--|  2    [S]    COG3177 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||||-||-|||----------  2    [M]    COG3203 Outer membrane protein (porin)
------------------------------------------------||---|||---|||----  2    [P]    COG3213 Uncharacterized protein involved in response to NO
---------------------------------------------|----||-||-||-|-||--|  2    [M]    COG3306 Glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis
--|--|--|--|------||-|----|------|---|-----||-|-------||----|-|---  2    [L]    COG3335 Transposase and inactivated derivatives
--|---------------------------------------||||---|-|-||----|-|||--  2    [S]    COG3422 Uncharacterized conserved protein
------------------||----------------------|||---|-----|--|--------  2    [R]    COG3596 Predicted GTPase
------------------------------------------|-||----|--||-----------  2    [S]    COG3778 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------||----|--||-----------  2    [R]    COG4228 Mu-like prophage DNA circulation protein
--------------------------------------------||----|--||-----------  2    [R]    COG4379 Mu-like prophage tail protein gpP
--------------------------------------------||----|--||-----------  2    [S]    COG4381 Mu-like prophage protein gp46
--------------------------------------------|-----|--||-----------  2    [S]    COG4383 Mu-like prophage protein gp29
--------------------------------------------||----|--||-----------  2    [S]    COG4384 Mu-like prophage protein gp45
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  2    [P]    COG4607 ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component
------------------------------------------------||--||||----------  2    [N    U]    COG4968 Tfp pilus assembly protein PilE
--------------------------------------------|-----|---|-----------  2    [R]    COG5005 Mu-like prophage protein gpG
------------------------------------------------||--||||----------  2    [N    U]    COG5008 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilU
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1    [H]    COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1    [E]    COG0002 Acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase
|||-||--||-|-||-||||-|----|||-||--|||||---|||||--|--||||---|||||--  1    [P]    COG0004 Ammonia permease
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||--|||||||-|-||||----|||||---||||----||||||||--||||---|||||--  1    [H]    COG0007 Uroporphyrinogen-III methylase
|||||||||||||||---||||--------|-|-|-||----|||-|-||-|||||||-||||---  1    [E]    COG0010 Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase, arginase family
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1    [E]    COG0014 Gamma-glutamyl phosphate reductase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0015 Adenylosuccinate lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
|||-||--||---||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0019 Diaminopimelate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0021 Transketolase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0024 Methionine aminopeptidase
---|||----||-||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [F]    COG0026 Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase (NCAIR synthetase)
|||-||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E    H]    COG0028 Thiamine pyrophosphate-requiring enzymes [acetolactate synthase, pyruvate dehydrogenase (cytochrome), glyoxylate carboligase, phosphonopyruvate decarboxylase]
---|--||---|----|-|||------||||----|||----|||||-||--||||---||-||--  1    [H]    COG0029 Aspartate oxidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
--||||-|--|||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0031 Cysteine synthase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0034 Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
|--|---|--|||||-||||||--|-|||-|||||||||||||||||-||||-|||--||||||--  1    [F]    COG0035 Uracil phosphoribosyltransferase
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----|||||||||||||---||||||--  1    [E]    COG0040 ATP phosphoribosyltransferase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0041 Phosphoribosylcarboxyaminoimidazole (NCAIR) mutase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1    [H]    COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0046 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, synthetase domain
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0047 Phosphoribosylformylglycinamidine (FGAM) synthase, glutamine amidotransferase domain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0049 Ribosomal protein S7
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0052 Ribosomal protein S2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0055 F0F1-type ATP synthase, beta subunit
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0056 F0F1-type ATP synthase, alpha subunit
|||----|||||-|--||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E    H]    COG0059 Ketol-acid reductoisomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||||||||---|||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [G]    COG0061 Predicted sugar kinase
||||||||||||||||||||-|----||||||--|||-----|||||-||--||||||||||||--  1    [G]    COG0063 Predicted sugar kinase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
||||--||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0065 3-isopropylmalate dehydratase large subunit
|||---||||||-||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0066 3-isopropylmalate dehydratase small subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||--||||-||-||||-|----||||||-|||||----|||-||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0077 Prephenate dehydratase
|||||||||||||||-||||-|---|||||||||||||--|-||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0078 Ornithine carbamoyltransferase
|||||||||||||||-||||||----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0079 Histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0082 Chorismate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0103 Ribosomal protein S9
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0104 Adenylosuccinate synthase
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [F]    COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0106 Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0107 Imidazoleglycerol-phosphate synthase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0114 Fumarase
-|----|||||-|-----|-||--------||||||||----||||||||||||||----------  1    [L]    COG0116 Predicted N6-adenine-specific DNA methylase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0117 Pyrimidine deaminase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0118 Glutamine amidotransferase
|||--|||||||-||-||||-|----|||||--|||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0119 Isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1    [G]    COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
||--|-||--||-|----||-------||-------------|||||-||||-|||---||||---  1    [R]    COG0121 Predicted glutamine amidotransferase
||||--|||||||||||-||-|------------|-||----------||---|||---|||||--  1    [B    Q]    COG0123 Deacetylases, including yeast histone deacetylase and acetoin utilization protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1    [J]    COG0130 Pseudouridine synthase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0131 Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1    [H]    COG0132 Dethiobiotin synthetase
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0134 Indole-3-glycerol phosphate synthase
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0137 Argininosuccinate synthase
--||||--|----||-||||||----||||||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1    [F]    COG0138 AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase PurH (only IMP cyclohydrolase domain in Aful)
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0139 Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase
||||-----|||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0140 Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase
||||----||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0141 Histidinol dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0149 Triosephosphate isomerase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0150 Phosphoribosylaminoimidazole (AIR) synthetase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0151 Phosphoribosylamine-glycine ligase
||||||||||||-||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [F]    COG0152 Phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide (SAICAR) synthase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  1    [J]    COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
--------|-||-||-|-||-|----|||-|-----||----||||||||--||||---|||||--  1    [P]    COG0155 Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
||||--||||||-|--|||||-----|||||-||-|||----|||||-||||||||||-||-||--  1    [H]    COG0157 Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
---|---------||---||----------------------|||||-||||-||||||-||-|--  1    [G]    COG0158 Fructose-1,6-bisphosphatase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1    [H]    COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0164 Ribonuclease HII
||||||--||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0165 Argininosuccinate lyase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0167 Dihydroorotate dehydrogenase
||||--||||--|||-||||||--||------||||||-||||||||-||||-||---||||----  1    [P]    COG0168 Trk-type K+ transport systems, membrane components
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1    [H]    COG0171 NAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
|||||||||||||||-||||-|----||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0174 Glutamine synthetase
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  1    [G]    COG0176 Transaldolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0178 Excinuclease ATPase subunit
|||||||||||||||---||-|----||||----||||----|||||-||-|-|||--||||||--  1    [Q]    COG0179 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0186 Ribosomal protein S17
-|||--|||-|||-----||-|---------------|--||||||||||||||||---|||||--  1    [H    J]    COG0189 Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1    [H]    COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||-|--||||||||||||||||||||||||||||-||||||-||||--  1    [G]    COG0191 Fructose/tagatose bisphosphate aldolase
-------------||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0192 S-adenosylmethionine synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0203 Ribosomal protein L17
||||||||||------||||||--||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0206 Cell division GTPase
|||-----||---|||----||----||||||||||||-|||||||||||||||||---|||||--  1    [F]    COG0207 Thymidylate synthase
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1    [F]    COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0217 Uncharacterized conserved protein
-|||--||||---|--||--|---------||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0218 Predicted GTPase
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0224 F0F1-type ATP synthase, gamma subunit
|-||-------|-||---||||--|-|||||||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1    [O]    COG0225 Peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0228 Ribosomal protein S16
|-||---------||---||||--|-|||-||||||||-||||||||-||||||||||||||||--  1    [O]    COG0229 Conserved domain frequently associated with peptide methionine sulfoxide reductase
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0230 Ribosomal protein L34
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0238 Ribosomal protein S18
-|||--||-|---||-||||-|----|||-|--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [D]    COG0239 Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
-|--||-------|||--|-|------||-|-----------|||||||||||||||||---||--  1    [E]    COG0241 Histidinol phosphatase and related phosphatases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
--|--------|-|--||||||----|||||------|----|||||-||||||||||||||||||  1    [F    P]    COG0248 Exopolyphosphatase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0250 Transcription antiterminator
|||||||||||||||-----||----||||||||||||----|||||-|||-||||||||-|----  1    [E    J]    COG0252 L-asparaginase/archaeal Glu-tRNAGln amidotransferase subunit D
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0253 Diaminopimelate epimerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0256 Ribosomal protein L18
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
-------------||---||-|-----|||------------|||||-|||-||||---|||||--  1    [H]    COG0259 Pyridoxamine-phosphate oxidase
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1    [E]    COG0260 Leucyl aminopeptidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  1    [H]    COG0262 Dihydrofolate reductase
--|----------||-||||-|--|-||||||||-|||----|||||-||||||||--||||||--  1    [E]    COG0263 Glutamate 5-kinase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0264 Translation elongation factor Ts
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
------------------||-|----||||-||||||||||||||||-||||||||---|||||-|  1    [L]    COG0266 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0268 Ribosomal protein S20
---|---------||---||----------------------||||||||||||||---|||||||  1    [T]    COG0271 Stress-induced morphogen (activity unknown)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
---|---------|||--||----------------------||||||||||||||---|||||||  1    [O]    COG0278 Glutaredoxin-related protein
-|--||----------|-|-|------||-|-----------||||||||||-||-|||---|---  1    [G]    COG0279 Phosphoheptose isomerase
--||-------------||-||--|||||-||||||||||||||||||||||||||-|||||||||  1    [C]    COG0280 Phosphotransacetylase
--|||||||-|||||--|||-|----|||-|||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0281 Malic enzyme
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1    [F]    COG0283 Cytidylate kinase
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0284 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
---|||-------||-||||||--|-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0285 Folylpolyglutamate synthase
||||---||----------|-------||--|||||--|||-|||-|-|||||||||||-||-|-|  1    [V]    COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
||||||--|||||||-||||-|----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [E]    COG0287 Prephenate dehydrogenase
|--|------||-||---||-|----|||||-||--||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG0288 Carbonic anhydrase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0292 Ribosomal protein L20
||||||--||---|||--------||----------------||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG0293 23S rRNA methylase
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [H]    COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--||||----|--||-||||||----||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0299 Folate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase PurN
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0305 Replicative DNA helicase
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  1    [P]    COG0306 Phosphate/sulphate permeases
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
--|-||----||-|||--||-|----||||-|||--------|||||-||||||||---|||||--  1    [E]    COG0308 Aminopeptidase N
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1    [H]    COG0320 Lipoate synthase
----------|--||---||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1    [H]    COG0321 Lipoate-protein ligase B
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
--|----------||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [R]    COG0325 Predicted enzyme with a TIM-barrel fold
||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||-------  1    [S]    COG0327 Uncharacterized conserved protein
---|------|--||---||-|--|-||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0328 Ribonuclease HI
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E    M]    COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||---|-|--||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0330 Membrane protease subunits, stomatin/prohibitin homologs
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0333 Ribosomal protein L32
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0337 3-dehydroquinate synthetase
-------------||---||-|----|---------------|||||-||||||||---|||||--  1    [E]    COG0339 Zn-dependent oligopeptidases
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
----------------||||||--------|||||||||||||||||-||||-|||||||||||--  1    [S]    COG0344 Predicted membrane protein
|-|-||----|||||-||||-|--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [E]    COG0345 Pyrroline-5-carboxylate reductase
|||-----||------||||-|----|||-||---||-----|||||-||||||||---|||||--  1    [E]    COG0347 Nitrogen regulatory protein PII
-||-||--||-|------||----------|-----------|||-|-||||-|||||||||||--  1    [C]    COG0348 Polyferredoxin
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1    [L]    COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
|||||||||||||||-||-|||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0351 Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase
--|-|||||----||-|-||||----||||||-|||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0352 Thiamine monophosphate synthase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
-------------||-|-||-|----||||------------||||||||||||||---|||||||  1    [R]    COG0354 Predicted aminomethyltransferase related to GcvT
--|----------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0355 F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit (mitochondrial delta subunit)
--|----------|--|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0356 F0F1-type ATP synthase, subunit a
----------------||||||--|||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0357 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||---  1    [G]    COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  1    [G]    COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
-------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||--  1    [G]    COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase
-------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|--  1    [P]    COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1    [H]    COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0377 NADH:ubiquinone oxidoreductase 20 kD subunit and related Fe-S oxidoreductases
||||--||||||----|||||-----|||||----|||----|||||-||--||||||-||-||--  1    [H]    COG0379 Quinolinate synthase
||-|--||---------|||-|--------||-||||-----|||||-||-|-|||--|-----||  1    [M]    COG0381 UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
-------------|||--|-|-----|---|||||||||---|||||--|--||||-------|--  1    [O]    COG0386 Glutathione peroxidase
|-|||||||-|||||-||||-|--|-|||||--|||||----|||||-||--||||||||||||--  1    [R]    COG0388 Predicted amidohydrolase
--||-------|-||---|||-----|||-|||||||||||||||||-||-|-|||---|||||--  1    [L]    COG0389 Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair
|-||----|----||-|-||-|----|||-||||||||----|||-|-||-|||||--||||||--  1    [T]    COG0394 Protein-tyrosine-phosphatase
||-----|-||-----||||----|-|||-|--|--|-----|||||-||-|-||||||-||||--  1    [M]    COG0399 Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1    [E]    COG0403 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), N-terminal domain
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--||||---|||||--  1    [E]    COG0404 Glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)
----||----||||||--||||----|||-----|-||----|||-|-||--||||||-||-||--  1    [E]    COG0405 Gamma-glutamyltransferase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
---|--||--|||||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1    [H]    COG0413 Ketopantoate hydroxymethyltransferase
-------------||-||||-|----|||||---||||----||||||||--||||||||||||--  1    [H]    COG0414 Panthothenate synthetase
|-||-------|-|----||------|-----|-||------||||||||----|----|--||--  1    [L]    COG0415 Deoxyribodipyrimidine photolyase
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  1    [I]    COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
-------------||---|-----------------------||||||||---||||||||-----  1    [F]    COG0418 Dihydroorotase
||||---|||||----||||||----|||||-----||----|||||-||--||||--|||-||--  1    [H]    COG0422 Thiamine biosynthesis protein ThiC
||||||--||||----|||||-------------|-|-----||||||||||-|||--||||||--  1    [O]    COG0425 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
||||--||--||||||||-|-|---||||------|------|||-|--|---|||--|-|-----  1    [P]    COG0428 Predicted divalent heavy-metal cations transporter
-------------|-|--||----------------------|||||-||---|||----------  1    [R]    COG0429 Predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold
---|---------||---||-|----|||--|||||||--|||||||-||-|-|||---||-||--  1    [R]    COG0431 Predicted flavoprotein
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0439 Biotin carboxylase
|||---||||--|||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||-|||--||||||--  1    [E]    COG0440 Acetolactate synthase, small (regulatory) subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [M]    COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||||||||||||||-||||||---|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0452 Phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase
||||||||||||||||||||||----|||||||||||||---|||||-||||||||--||||||--  1    [R]    COG0456 Acetyltransferases
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [R]    COG0457 FOG: TPR repeat
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1    [E    F]    COG0458 Carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0460 Homoserine dehydrogenase
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
|||||||||||||||-||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  1    [F    E]    COG0462 Phosphoribosylpyrophosphate synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1    [G]    COG0469 Pyruvate kinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0470 ATPase involved in DNA replication
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  1    [M]    COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
|||---||||||-||-||||-|----||||||--||||----||||||||||||||--||||||||  1    [C    E]    COG0473 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
|||-|||||-|||||-|-||-|---|-|||||--||||----|||||-|||-||||||||||||||  1    [P]    COG0475 Kef-type K+ transport systems, membrane components
|-|||||||-|||||||-||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG0476 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 2
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0486 Predicted GTPase
||||||||||||||||||||||----|||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [D]    COG0489 ATPases involved in chromosome partitioning
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0492 Thioredoxin reductase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  1    [R]    COG0496 Predicted acid phosphatase
----------------|-||||--|-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0497 ATPase involved in DNA repair
|||||||||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0498 Threonine synthase
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1    [H]    COG0502 Biotin synthase and related enzymes
||||--||-||||||--|||||--|||||-||||||||||||||||||||||-||||||||||---  1    [F]    COG0503 Adenine/guanine phosphoribosyltransferases and related PRPP-binding proteins
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
||||||--||||-||-||||||----||||||||||||----||||||||-|||||||||||||--  1    [E    F]    COG0505 Carbamoylphosphate synthase small subunit
---|---------||---||-|----|||-----|-||----|||||--|-|-|||||||||||--  1    [E]    COG0506 Proline dehydrogenase
-|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||---  1    [L]    COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member
---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||--  1    [E]    COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding)
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
||||||-||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E    H]    COG0512 Anthranilate/para-aminobenzoate synthases component II
--|---------||||--||||--|-|---||--||||----|||||-||||||||---||-||--  1    [L]    COG0514 Superfamily II DNA helicase
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
--|----------||-|-||||----|||-----|-||----|||||-||--||||||-|||||--  1    [R]    COG0523 Putative GTPases (G3E family)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
||||--|||---|||-|||-||--|||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||--  1    [V]    COG0534 Na+-driven multidrug efflux pump
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0536 Predicted GTPase
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0539 Ribosomal protein S1
|||||||||||||||-||||||----||||||||||||----||||||||--||||||||||||--  1    [F]    COG0540 Aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0541 Signal recognition particle GTPase
|||-||||||-|-||-||--|---|-|||-||-|-|||----|||||-||---|||---|----||  1    [H    C]    COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
||||||-||||||||-||||-|----||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0547 Anthranilate phosphoribosyltransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0550 Topoisomerase IA
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  1    [L]    COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0552 Signal recognition particle GTPase
||||||||||||------||-|-----||-|------|----|||||-||||||||---|||||--  1    [O]    COG0555 ABC-type sulfate transport system, permease component
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  1    [R]    COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0563 Adenylate kinase and related kinases
||||||--||-||-----||-|--------------------|||||-||||||||---|||||-|  1    [J]    COG0565 rRNA methylase
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1    [C]    COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
||||--|||||-|---||||||--||-||---||||||-||||||||-||||-||---||||----  1    [P]    COG0569 K+ transport systems, NAD-binding component
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
|||||||||||||---||||||--|-|||||--|-||-----|||||-||--||||||||||||||  1    [G]    COG0574 Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||--  1    [V]    COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
----|--||---|----||||-----|||-|---|--|-||||||-|-||--||||||||||||--  1    [R]    COG0579 Predicted dehydrogenase
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0582 Integrase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  1    [G]    COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
|||||||||||||-|-|-||-|----||||-|||||||----|||||-||||-|||---|||||||  1    [T]    COG0589 Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding proteins
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1    [F    J]    COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  1    [E    R]    COG0591 Na+/proline symporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0594 RNase P protein component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M    U]    COG0597 Lipoprotein signal peptidase
|||-||--||-|-||--||--|----|||--|---|||-------|---||-||||---|||||--  1    [S]    COG0599 Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit
||||||||||||----|-|||---------||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0602 Organic radical activating enzymes
|||||||||||||---|-||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0603 Predicted PP-loop superfamily ATPase
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [P]    COG0605 Superoxide dismutase
|--------|------||||||---||||-|-----------|||||-||||||||||||||||-|  1    [O]    COG0606 Predicted ATPase with chaperone activity
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
|||||||||||||---|-||------||||------||----||||||||||||||--|----|--  1    [H]    COG0611 Thiamine monophosphate kinase
||||----|--||---||||-|--------|------|----|||||-||||-|||----------  1    [R]    COG0613 Predicted metal-dependent phosphoesterases (PHP family)
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  1    [E]    COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0621 2-methylthioadenine synthetase
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  1    [I]    COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-------------||---||------------||--------|||||-||||||||---|||||||  1    [O]    COG0625 Glutathione S-transferase
-------------|----||------||||-|||||------|||||--|||-|||---|||||--  1    [R]    COG0627 Predicted esterase
||||--|||-------||||||--|||||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0628 Predicted permease
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
----------------||--||----||||||-|||||||||||||||||||||||---|||||--  1    [F]    COG0634 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
-|||||||||||||||-|||||--------||-|-|||----||||||||||||||--|||-||--  1    [T]    COG0639 Diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatases
|||||||||||||---||||||----|||||||-||||----|||||-||-|||||--||||||--  1    [K]    COG0640 Predicted transcriptional regulators
|||||||||||||||-|||||-----|||||-----------|||-|--|--||||---|||||--  1    [C]    COG0644 Dehydrogenases (flavoproteins)
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0649 NADH:ubiquinone oxidoreductase 49 kD subunit 7
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
-------------||---||-|----|||-----|-||----|||||-||-|||||---|||||||  1    [H    C]    COG0654 2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1    [R]    COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
|-||||-----|-||---||-------||||------|----|||||-||-|||||---|||||||  1    [R]    COG0661 Predicted unusual protein kinase
|||-||||-|-|----|-||-|----|||-|-----||----|||-|-||--||||--||||||||  1    [R]    COG0663 Carbonic anhydrases/acetyltransferases, isoleucine patch superfamily
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [T]    COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
----||----|--|||--||||--|||---|-----------||||--||-|||||--|||-||||  1    [R]    COG0666 FOG: Ankyrin repeat
----------------||||||--||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0669 Phosphopantetheine adenylyltransferase
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  1    [R]    COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
--------|---|||--||||---|---------|||-----||||---|-|-||---|--|--||  1    [P]    COG0672 High-affinity Fe2+/Pb2+ permease
-------------||---||-------------------------|--|-||-|||---|||||--  1    [O]    COG0678 Peroxiredoxin
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
--|-||||--|||||-||||-|----|---||-|||||----||||||||||||||--||||||--  1    [E]    COG0685 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  1    [I]    COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
|---|||||||||||||--|||----||||-----|||----|||||-||||||||---|||||||  1    [J]    COG0689 RNase PH
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0691 tmRNA-binding protein
-------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||-----  1    [L]    COG0692 Uracil DNA glycosylase
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0703 Shikimate kinase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||-----------  1    [E]    COG0710 3-dehydroquinate dehydratase
--|-------------|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0711 F0F1-type ATP synthase, subunit b
-------------||-|||||-----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0712 F0F1-type ATP synthase, delta subunit (mitochondrial oligomycin sensitivity protein)
--||||------|---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0713 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1    [F]    COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||----||||----------|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0720 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
-------------||----|-|----|----|-|--------||||||||||||||------||--  1    [E]    COG0722 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
--||||----|||||-|-||-|----|||||-----||----------||--||||||||||||||  1    [C]    COG0723 Rieske Fe-S protein
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
----------------|---|---------------------|||||-||||||||---|||||--  1    [M]    COG0729 Outer membrane protein
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  1    [I]    COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
-------------|----------------------|-----|||-|---|-|||-|||--|-|--  1    [G]    COG0738 Fucose permease
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O    U]    COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1    [I]    COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
-----------------|||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [M]    COG0744 Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [T    K]    COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
|||||||||||||---|-||-|----|||-----||||----|||||-||||--||||||||||--  1    [H]    COG0746 Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
-------------||------|----|-------||||----|||||-||||-||||||||||---  1    [P]    COG0753 Catalase
--|-----|-|-|---|-||-|----||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1    [F]    COG0756 dUTPase
----------------||||||--|||||-|-||||||||--|||||-||||||||||||||||-|  1    [L    U]    COG0758 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1    [S]    COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1    [I    M]    COG0761 Penicillin tolerance protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [Q]    COG0767 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0772 Bacterial cell division membrane protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
--|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||--  1    [F]    COG0775 Nucleoside phosphorylase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
----------------||||||--|||||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------|-|---||||-------------||-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0780 Enzyme related to GTP cyclohydrolase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0781 Transcription termination factor
------------------|-|-----|-------|-------|||||-|||--||-||--------  1    [E]    COG0786 Na+/glutamate symporter
--------------|-|-||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0787 Alanine racemase
--|-----|-------|-||||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [K]    COG0789 Predicted transcriptional regulators
----------------||||||--|-|||||-----------|||||-||||||||||||||||--  1    [L]    COG0792 Predicted endonuclease distantly related to archaeal Holliday junction resolvase
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------|-||||--||||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1    [M]    COG0796 Glutamate racemase
----------------|-||----||----|-----------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0797 Lipoproteins
|-|---|-|----|---|||------|||-|----||--------------|--|----|------  1    [P]    COG0798 Arsenite efflux pump ACR3 and related permeases
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-----------------|||----|-----||||--||----|||||-||||||||||-|||||--  1    [G]    COG0800 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [H]    COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0802 Predicted ATPase or kinase
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  1    [P]    COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
--||||--|-|||---|-||-|----||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0805 Sec-independent protein secretion pathway component TatC
----------------||||||--||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0806 RimM protein, required for 16S rRNA processing
----------------||||||---|----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0809 S-adenosylmethionine:tRNA-ribosyltransferase-isomerase (queuine synthetase)
----------------|--||---------------------|||||-||||||||||||||||--  1    [M]    COG0810 Periplasmic protein TonB, links inner and outer membranes
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0811 Biopolymer transport proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
-------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||-------  1    [E]    COG0814 Amino acid permeases
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  1    [M]    COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
-----------------|||-|--------||||||||----|||||-|||||||||||||||---  1    [M]    COG0818 Diacylglycerol kinase
----------------||||||--|-|||-|||||||||---||||||||||||||||||||||--  1    [R]    COG0820 Predicted Fe-S-cluster redox enzyme
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  1    [C]    COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
|-||||----|||---|-||||--|-|||-|---||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [R]    COG0824 Predicted thioesterase
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
|||------|-|----|--|||--------||||||||----|||||-||||-|||||||||----  1    [O]    COG0826 Collagenase and related proteases
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0828 Ribosomal protein S21
------------------||----------------------|||||--|--||||||-|||||--  1    [G]    COG0837 Glucokinase
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0838 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 3 (chain A)
--||||--|--||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0839 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 6 (chain J)
--|-------------||||||---|----|---|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [V]    COG0841 Cation/multidrug efflux pump
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0848 Biopolymer transport protein
---------|------||--||--||----||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0849 Actin-like ATPase involved in cell division
----------------||||||--------|----|||----||||||||-|||||||-||||---  1    [D]    COG0850 Septum formation inhibitor
------------------||||--------------------||||||||--||||||-||||---  1    [D]    COG0851 Septum formation topological specificity factor
--|||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG0852 NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit
----------------||||-|----|||||---||||----|||||--|--||||||||--||--  1    [H]    COG0853 Aspartate 1-decarboxylase
----------------|-||----------------------|||||-||--||||||||||||--  1    [H]    COG0854 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
--|---------------||-|-----||||------|----|||||-||--||||||||||||--  1    [P]    COG0855 Polyphosphate kinase
---|----|---------||-|-----||-------------||||||||||-||-|||-------  1    [R]    COG0857 BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0858 Ribosome-binding factor A
-|||||----|----------|---||---|-----|-|----||-|---|---|-|||----|--  1    [V]    COG1002 Type II restriction enzyme, methylase subunits
---|||||---||||-||||-|-----|||----||||----|||||--|--|-||---|||||--  1    [E]    COG1003 Glycine cleavage system protein P (pyridoxal-binding), C-terminal domain
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1005 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)
--||||--|-|||---|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1007 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
--||||----------|-||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1008 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)
--||||-||-|||---|-||-|----|||-----||||----||||||||--||||||||||||||  1    [C    P]    COG1009 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
||||--||-|||-|||-|-|-|--|||||-||||||||----|||||-||-|-|||---|||||--  1    [R]    COG1011 Predicted hydrolase (HAD superfamily)
----||-----------|-|------|---|-----||----|||||-||||-||-||||-|----  1    [E]    COG1027 Aspartate ammonia-lyase
----------------||||-|-----||-|-----------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1034 NADH dehydrogenase/NADH:ubiquinone oxidoreductase 75 kD subunit (chain G)
-|||||||||||-------|----------------------|||||-||---||-----|-|---  1    [C]    COG1042 Acyl-CoA synthetase (NDP forming)
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
--||----------|--|||------||||||||||||----||||||||||-|||||||||||--  1    [E]    COG1045 Serine acetyltransferase
|||||||||||||-------||--|-----------------|||||-|||||||||||-------  1    [O]    COG1047 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2
--||||----|||||-|----|----||||||--|||-----|||||-||--||||---|||||||  1    [C]    COG1048 Aconitase A
------------------||----------------------|||||-||-|||||||||------  1    [C]    COG1049 Aconitase B
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  1    [P]    COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
-------------||-|||||---||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||--  1    [H]    COG1057 Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase
---||||||-||||---|||||-----||||-||||||----|||||-|----|||---|||||--  1    [R]    COG1058 Predicted nucleotide-utilizing enzyme related to molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA
-----------|-||---||------||||-------|----|||||--||--|||---|||||--  1    [C]    COG1062 Zn-dependent alcohol dehydrogenases, class III
--|-||----|||||---||------||||-||||-||----|||-|--|--|||||||||||---  1    [R]    COG1064 Zn-dependent alcohol dehydrogenases
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
-------------|||--|-----------------------||||||||||-|||--||||||||  1    [O]    COG1076 DnaJ-domain-containing proteins 1
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  1    [G]    COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
-|---------------|--|---|-|---|--||-||----------||-||||||||-||||||  1    [M    G]    COG1086 Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerases
|-||-||||--||---|-||||----|||||||---||----|---|--|--||||---||-||||  1    [M]    COG1091 dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  1    [R]    COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  1    [E]    COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1    [P]    COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
------------------||-------||--------|----|||||-||--||||||||||||--  1    [P]    COG1118 ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  1    [P]    COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [Q]    COG1127 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component
|-||||||||||||||-|||-|---||||||||||||||||-|||||-||-|||||||-|||||--  1    [V]    COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1    [G    M]    COG1134 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
|--|||--|-|||-------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1    [C]    COG1139 Uncharacterized conserved protein containing a ferredoxin-like domain
|||||||||-|||---||||-|-----||-------------||||||-|--||||||||||||||  1    [C]    COG1143 Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)
|||-|||||||||----|||||--------|-----|-----|||||-|||||||||||||-|---  1    [C]    COG1145 Ferredoxin
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  1    [H    I]    COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1159 GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1160 Predicted GTPases
-||---||-|||||||-||||----|----||||||||||||------|----||-----------  1    [R]    COG1161 Predicted GTPases
--|-------------|||||----||||||||||||||||||||||-||||||||------|---  1    [R]    COG1162 Predicted GTPases
------------------||-|--------------------|||||-||-||||-|||-------  1    [E]    COG1166 Arginine decarboxylase (spermidine biosynthesis)
---|||----|||||--|||||----||||-|-|||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [E]    COG1171 Threonine dehydratase
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||---|||||--  1    [E]    COG1176 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I
---|----|-|-|----|-|||--||----||||||--|||||||||-||||-|||--||||||--  1    [E]    COG1177 ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II
-------------||-----|---------|---|-||----|||||-|||||||||||-------  1    [H]    COG1179 Dinucleotide-utilizing enzymes involved in molybdopterin and thiamine biosynthesis family 1
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  1    [I]    COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1186 Protein chain release factor B
-----------------|--|-----|---||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1    [J]    COG1188 Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog)
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1    [J]    COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  1    [D]    COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [L]    COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
-||||||||----|||||||||--||||||||||||||||||-------|--|||----|||||--  1    [D]    COG1196 Chromosome segregation ATPases
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
||||||||--|||||||-|||-----|||-||||||||----|||||-||||||||-------|--  1    [K    L]    COG1199 Rad3-related DNA helicases
----------------||||||--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1200 RecG-like helicase
----------------||||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG1207 N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase (contains nucleotidyltransferase and I-patch acetyltransferase domains)
|||||||||||||||||-||-|----|||||-----||-------||--|--||||--||||||--  1    [M    J]    COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
|||----|---|----|--||----|||||||||||||--|||||||-||||||||||||||||--  1    [M]    COG1210 UDP-glucose pyrophosphorylase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
------------------||||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [T]    COG1217 Predicted membrane GTPase involved in stress response
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
--||||----|||||-||||-|----|||||---|-||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [O]    COG1225 Peroxiredoxin
||||||||||-|||--||||-|----|||-||---|||||--|||||-|||-||||||||||||||  1    [P]    COG1226 Kef-type K+ transport systems, predicted NAD-binding component
--|---|---||-|||||-|-|----|--||||||||-----|||||--|-|||||--||||||--  1    [P]    COG1230 Co/Zn/Cd efflux system component
-||------|------|-------------------------|||||-||||||||--||||||||  1    [S]    COG1238 Predicted membrane protein
--||------------|----|-----|||------||----||||||||-|-|||----------  1    [E]    COG1246 N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferases
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
--|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||--  1    [S]    COG1262 Uncharacterized conserved protein
|||---||-||-|---|---|-----------|--|||----|||||-||||-||||||-----||  1    [I]    COG1267 Phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins
-------------|||----||--|||||-||||||||----|||||-||--|||----|||||--  1    [R]    COG1272 Predicted membrane protein, hemolysin III homolog
---|------------||--||----|||||||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [K]    COG1278 Cold shock proteins
----------------||||||--------||||||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1    [O]    COG1281 Disulfide bond chaperones of the HSP33 family
------------------||-------|||------------|||||-||||-|||---|||||||  1    [C]    COG1282 NAD/NADP transhydrogenase beta subunit
------------------------||-----|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1286 Uncharacterized membrane protein, required for colicin V production
---|||----||||--|-||-|----||||------||----------||--||||||||||||||  1    [C]    COG1290 Cytochrome b subunit of the bc complex
---|--------------------|-|||-----||||----|||||-||||-||-----|-----  1    [M]    COG1292 Choline-glycine betaine transporter
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG1295 Predicted membrane protein
--|-----|-----------||----|----|-|||||----|||||-||||-|||||-||||---  1    [E]    COG1296 Predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)
---|--|------|-------------||--------------------||-||||--|----|--  1    [S]    COG1297 Predicted membrane protein
|||||||||||||||---||-|--||||||-||||||-----|||||-||||-||----|||||||  1    [C]    COG1304 L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [K]    COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
----------------------||-|-||-------------|||||||||||||-----------  1    [L]    COG1330 Exonuclease V gamma subunit
----------------|-||------||||------||---------------|||----------  1    [O]    COG1333 ResB protein required for cytochrome c biosynthesis
--|||||||||||||-||-|-|--|||||-||||||||----|||||-||--||||--||||||--  1    [Q]    COG1335 Amidases related to nicotinamidase
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  1    [M]    COG1346 Putative effector of murein hydrolase
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD
----------------||--||----|---||||||||----|||||-||||-|||---||||---  1    [K    G]    COG1349 Transcriptional regulators of sugar metabolism
-||||||||-------||||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1    [S]    COG1354 Uncharacterized conserved protein
--||--------------|-||----|||-||-|-||-----|||||-||-|-|||---||-||--  1    [S]    COG1359 Uncharacterized conserved protein
|||-----||---||-||||-|----||||||--||||-----------|---|||---|||||--  1    [E]    COG1364 N-acetylglutamate synthase (N-acetylornithine aminotransferase)
-----------------|||------|||||-----||----|||-|-||---|||---||||---  1    [S]    COG1376 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|---||------------||--------||--|-||----|||||-||||-|||-----|----  1    [R]    COG1380 Putative effector of murein hydrolase LrgA
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
----------------||||||--||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG1385 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-|||||--------|||||--|-||||||||||||||||-------|--||||---|||||--  1    [K]    COG1386 Predicted transcriptional regulator containing the HTH domain
----------------|---------||||------------|||||-||||-|||---|||||--  1    [O    T]    COG1391 Glutamine synthetase adenylyltransferase
----------------||||-|----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1    [R]    COG1399 Predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein
--||----|-|-|||||-||||----|||||-||--||||------|-||--||||--|||-|---  1    [O]    COG1404 Subtilisin-like serine proteases
||||--||||------|-||-|--|-|---------------------||----|-||||||||--  1    [S]    COG1432 Uncharacterized conserved protein
----------------||||-|----|---||--||------|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG1434 Uncharacterized conserved protein
----------------|-------||----------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1452 Organic solvent tolerance protein OstA
----||||---|-|---------------------|||----|||-|--|-|-||-----------  1    [F]    COG1457 Purine-cytosine permease and related proteins
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  1    [N    U]    COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
----------------|-||-|--------------------|||||--|---|||-------|--  1    [M]    COG1462 Uncharacterized protein involved in formation of curli polymers
----------------|-||-------|||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [Q]    COG1463 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, periplasmic component
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
||||||||||--|----|----------------|-||-----------|--||||----------  1    [S]    COG1469 Uncharacterized conserved protein
-----------|--|--|||-|---|||||||---|||----|||||-||||||||---|||||||  1    [G]    COG1472 Beta-glucosidase-related glycosidases
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  1    [K]    COG1475 Predicted transcriptional regulators
-|||--|----------|-||-----|---|----|--||---|||--|--|--|-|||-------  1    [S]    COG1479 Uncharacterized conserved protein
-------------||------|-----||-------------|||||-||--||||---|||||||  1    [R]    COG1485 Predicted ATPase
--|||||||||||||-||||||--|||||-||||||||||||||||||||-|||||--|||||---  1    [H]    COG1488 Nicotinic acid phosphoribosyltransferase
-------------||-||--||----|||-||||||||----|||||-||||-|||----------  1    [J]    COG1490 D-Tyr-tRNAtyr deacylase
---------|----------|---|-----||||||||||||----------||||---|||||--  1    [T]    COG1493 Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [S]    COG1496 Uncharacterized conserved protein
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  1    [I]    COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
------||-----------|-|----|||------------------------||-------||||  1    [E]    COG1505 Serine proteases of the peptidase family S9A
----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||--  1    [K]    COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog
|||-|||-|||||---||-||------||---|--|-|----|||||----|--|---|-------  1    [L]    COG1518 Uncharacterized protein predicted to be involved in DNA repair
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
----------------||||||--||-||||----|||-|---------|--|||||||----|--  1    [K]    COG1521 Putative transcriptional regulator, homolog of Bvg accessory factor
||-|--||-|---||-|--|------|-------|-|--|||-------|||-||---|||||---  1    [L]    COG1525 Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs
||||--||||-||-------|---------||||||||----|||||-||||||||----------  1    [J]    COG1534 Predicted RNA-binding protein containing KH domain, possibly ribosomal protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG1539 Dihydroneopterin aldolase
------||------------||----|--|----|-||----|||||-|||--|||--||------  1    [R]    COG1540 Uncharacterized proteins, homologs of lactam utilization protein B
---|------------||||||----|||||-||-||||||||||||-||--||||||||||||--  1    [R]    COG1546 Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced)
---|----|-----------||---------|----||----|||------|-||||||-------  1    [S]    COG1556 Uncharacterized conserved protein
----------------|---||--||||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1559 Predicted periplasmic solute-binding protein
----------------||--|----|----|----|||----|||||-||||||||---|||||--  1    [S]    COG1561 Uncharacterized stress-induced protein
----------------|-||--------------------------------||||||||||||||  1    [S]    COG1565 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----------------|-|-----|||||-|||--|||---|||||||  1    [V]    COG1566 Multidrug resistance efflux pump
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1570 Exonuclease VII, large subunit
--|||||||-|||---||||||--|--|||||||--------------|-|--|||||||||||||  1    [L]    COG1573 Uracil-DNA glycosylase
-----------------|--||--------||||||||||--|||||-||||||||||||||||--  1    [S]    COG1576 Uncharacterized conserved protein
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1    [H]    COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
------------------||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG1589 Cell division septal protein
-----------------|||||--|-||||||--||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [K]    COG1595 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog
----------------||||----------------------|||-|-||-|||||--||||||--  1    [M]    COG1596 Periplasmic protein involved in polysaccharide export
|-|||---|--------|||-------------|--------||||--------|--|--|-||-|  1    [S]    COG1598 Uncharacterized conserved protein
||||||--|||||||-||--||----||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG1605 Chorismate mutase
-------------|---|--------|||-|----|||----------||--||||--|||||---  1    [S]    COG1610 Uncharacterized conserved protein
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1    [R]    COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
------------------||-------|||-------|----|||||--|--||||---|||||--  1    [P]    COG1613 ABC-type sulfate transport system, periplasmic component
----||------------||||--|-----||-|-|||-|--|||-|-||---|||--------||  1    [V]    COG1619 Uncharacterized proteins, homologs of microcin C7 resistance protein MccF
----------------||--|---------|||-|---------------|||||-|||-----||  1    [S]    COG1636 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||--|||-|||-|---|------||-|---||||----||||||||--|||----|||||--  1    [H]    COG1648 Siroheme synthase (precorrin-2 oxidase/ferrochelatase domain)
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1651 Protein-disulfide isomerase
-------------------|-|--||---------||-----|||-|-||-|||||---|||||--  1    [S]    COG1652 Uncharacterized protein containing LysM domain
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||||||----------  1    [R]    COG1660 Predicted P-loop-containing kinase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
-|||||-|-----||--|-|||----||||||||||||--|-|||||-||-|-|||||||||||||  1    [J]    COG1670 Acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  1    [K]    COG1678 Putative transcriptional regulator
--|-----|-------|-||------|||||||-||||--------|-||-||||---|-||||||  1    [G    M]    COG1682 ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component
-------------||----||---|-----|||||||------------|---||-|-|-|-----  1    [M]    COG1696 Predicted membrane protein involved in D-alanine export
---------||-|---||||-|----||||-|||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1    [T]    COG1702 Phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase
||||--|||||||----|------------------------|||||-||||-||-------||--  1    [S]    COG1720 Uncharacterized conserved protein
-----------------|-|||----||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1722 Exonuclease VII small subunit
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA
----------------|-------------------------|||||-||--||||---|||||||  1    [S]    COG1729 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  1    [T]    COG1734 DnaK suppressor protein
-----------------|--------|---||||||||-|--|||||-||||-|||---|||||--  1    [K]    COG1737 Transcriptional regulators
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  1    [S]    COG1738 Uncharacterized conserved protein
--||---------||--|--||---||---||||||||||--|||-|-||||-|||||||||----  1    [S]    COG1739 Uncharacterized conserved protein
-------------||||||-|---|--|||-|----||----|||-|-||--||||---|||||||  1    [R]    COG1752 Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily
---------------------|-----||---|||-||------------||-||-----------  1    [S]    COG1755 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [K]    COG1758 DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
--------------------||----||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||--  1    [E]    COG1760 L-serine deaminase
--------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||--  1    [G    T]    COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type)
-||-||||-|-||---||---|----|||-|----|-|--|||||||-||---|||---||-||--  1    [O]    COG1765 Predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation
||-----||--------||||---|--||-|-----------|||-|--|--||||-------|--  1    [C]    COG1773 Rubredoxin
--|-------------|---|---------------------|||||-|||||||||||-------  1    [R]    COG1778 Low specificity phosphatase (HAD superfamily)
|||||||||||||----|------------|-----------|||||||----||-----------  1    [F]    COG1781 Aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit
|||||||||||||||||----------||-------||----------|||--||---|||-||--  1    [L]    COG1793 ATP-dependent DNA ligase
----|------|-----|--||----|||-|||-||||----|||||-||---|||---|||||--  1    [K]    COG1802 Transcriptional regulators
------------------||--||---------------------|--||||-||-------|---  1    [C]    COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB
---------------------|------------||||----|||||-||--||||---|||||||  1    [S]    COG1806 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------|||-------|-|||---------|-----|-----|||||--|--||||---|||||--  1    [M]    COG1807 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1    [C]    COG1838 Tartrate dehydratase beta subunit/Fumarate hydratase class I, C-terminal domain
--||------|-|-----|||-----|-----|||--|-----||||-||||||||--|||||---  1    [P]    COG1840 ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component
||||||||||||||||||--||--||||||||||||||----||||||||||||||----||||||  1    [J]    COG1841 Ribosomal protein L30/L7E
|-|-|-|||-|||-|-||||||----||||||-|||||----|||||--|-|-|||---|||||||  1    [R]    COG1853 Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenases, DIM6/NTAB family
---------------------|---|----||||||||----|||||-|-||-||-|||-------  1    [T]    COG1854 LuxS protein involved in autoinducer AI2 synthesis
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1    [R]    COG1881 Phospholipid-binding protein
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1    [C]    COG1894 NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit
|-------------|-||||-|-----||-------------||||||-|--||||---|||||||  1    [C]    COG1905 NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit
-|--------------||------------|---||||----|||||-||||||||----||||--  1    [R]    COG1923 Uncharacterized host factor I protein
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  1    [G]    COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
------------------|-------|||-||||||||----|||||-||||-||-----------  1    [G]    COG1929 Glycerate kinase
--|----------||----|------||||-|---|||----||||||||||||||--||||||--  1    [H    E]    COG1932 Phosphoserine aminotransferase
----------------|-||----------------------|||||-||||||||||||||||--  1    [S]    COG1934 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-------|----------|------|----|||||||----||||------|||||||||-||--  1    [R]    COG1942 Uncharacterized protein, 4-oxalocrotonate tautomerase homolog
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
-------------||-----------||||------------||||||||||||||----------  1    [A]    COG1949 Oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)
|||---|||||-----||------------|------|----|||||-||--||||-----||---  1    [C]    COG1951 Tartrate dehydratase alpha subunit/Fumarate hydratase class I, N-terminal domain
-|----------------------------------------||||||||||||||---|||||||  1    [U]    COG1952 Preprotein translocase subunit SecB
---|||-------|---|------------||||||||----|||||-||-||||-------||--  1    [T]    COG1956 GAF domain-containing protein
-------------|||--------------------------||||||||||-|||--------||  1    [P]    COG1965 Protein implicated in iron transport, frataxin homolog
--|----|--|-|---|---|-----|||-||----||----|||||-||||-||||||-------  1    [T]    COG1966 Carbon starvation protein, predicted membrane protein
|--------|||----||||||---||||||||||-||----||||||||--||||--||||||--  1    [V]    COG1968 Uncharacterized bacitracin resistance protein
|-|-----------------|-----|---|-----||----|||||--|--|||---|-------  1    [S]    COG1971 Predicted membrane protein
------------------||-----------------------------|--||||||||||||||  1    [S]    COG1981 Predicted membrane protein
------||-----|------||----||||----|-||----|||||-|||--|||--||---|--  1    [E]    COG1984 Allophanate hydrolase subunit 2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
||||--||||------||||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1    [N    O    U]    COG1989 Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO and related peptidases
||||||-||||||---||||-|-----||-|----|||----------|----|||||--|-||--  1    [R]    COG1994 Zn-dependent proteases
----------------|-|||----------------|----|||||-||-|||||||||||||--  1    [H]    COG1995 Pyridoxal phosphate biosynthesis protein
---|------|-|||-|----|--------------||----------||--||||--||||||||  1    [R]    COG1999 Uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC, involved in biogenesis of respiratory and photosynthetic systems
---------------------|--|-|||||---|||||||||||||--|||||||----|--|||  1    [S]    COG2001 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-------------|||||---------||||||||----|||||-||||||||---||||--|  1    [L]    COG2003 DNA repair proteins
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1    [C]    COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
----||-----|-||--|||||--------||-|||||----|||-|-|-||-|||---|||||--  1    [G]    COG2017 Galactose mutarotase and related enzymes
||------||------|----|-----||------------------------||-----------  1    [R]    COG2018 Uncharacterized distant relative of homeotic protein bithoraxoid
|-||---------||------|----||||----||-------------|||||||------||--  1    [E]    COG2021 Homoserine acetyltransferase
----------------|-||||----|||||-----||----|||||-||--||||--||||||--  1    [H]    COG2022 Uncharacterized enzyme of thiazole biosynthesis
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  1    [C]    COG2025 Electron transfer flavoprotein, alpha subunit
--|---------------||-|----||||------|-----|||||-||||||||----------  1    [M]    COG2027 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein 4)
--|----------||-|----|-----||||-----|-----|||||-|--|-|||----||-|--  1    [P]    COG2032 Cu/Zn superoxide dismutase
------||-----|------||----||||----|-||----|||-|-|||--|||--||---|--  1    [E]    COG2049 Allophanate hydrolase subunit 1
--------------------|-------------|-||----------||||-||-|||-------  1    [R]    COG2056 Predicted permease
----------------|---|---------------------|||||-|||||||-||-|||||--  1    [I]    COG2067 Long-chain fatty acid transport protein
--------|----|--||-|||----|||-||||||||-----------|--||||||||||-|--  1    [R]    COG2070 Dioxygenases related to 2-nitropropane dioxygenase
--||---------------|-|-----|||||---|||----|||||-||---||---||||||--  1    [P]    COG2076 Membrane transporters of cations and cationic drugs
|-|-||----|||---|-||-|-----||-||---|||----|||||-||||-|||-|-|||||--  1    [I]    COG2084 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases
---|||--|-|||||--|--||----|||||-----||----|||-|--|--||||---|||||--  1    [C]    COG2086 Electron transfer flavoprotein, beta subunit
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  1    [U]    COG2095 Multiple antibiotic transporter
|-|||||||-------|-||||----|||||-----||----||--|-||--||||--||-|||--  1    [H]    COG2104 Sulfur transfer protein involved in thiamine biosynthesis
------------------||-|----|||||-----------|||||-||--||||||||||||--  1    [S]    COG2127 Uncharacterized conserved protein
--|-----|----------|-|----|||||--||-||----|||||--|---|||---|||||--  1    [S]    COG2128 Uncharacterized conserved protein
---|------|--||-|--|------|||-------||----|||||--|||||||--||||||--  1    [Q]    COG2132 Putative multicopper oxidases
-----------------|--||--|-||||||||||||----|||||-||||-|||---|------  1    [R]    COG2137 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----||--|---|--------|-----|||------------|||||-||--||||---|||||||  1    [C]    COG2142 Succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit
---|-------------|||||----|---|--||-||----|||-|-||||||||--||||||--  1    [M]    COG2148 Sugar transferases involved in lipopolysaccharide synthesis
---------|-------|--------||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG2171 Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase
-------------------|||----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1    [D]    COG2177 Cell division protein
-------------|||---||---|-|---|||||||||---|||||-||||||||---||||---  1    [K]    COG2183 Transcriptional accessory protein
---------------------------||----|--------|||-|--||-|||-||-||-|---  1    [D]    COG2184 Protein involved in cell division
---------------------|----|||||----|||----|||||-||||-|||---|||||--  1    [K]    COG2186 Transcriptional regulators
------------------||-|----|||-||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [T    K]    COG2197 Response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE
---|---------|||-|||-|--||----|---------|||||-|-||--|||-||||||||--  1    [O]    COG2214 DnaJ-class molecular chaperone
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
-------------||---||-|--------------------|||||-||-|||||---|||||||  1    [H]    COG2227 2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4-benzoquinol methylase
||-------|---||-|----|-----||------------------------||-----------  1    [R]    COG2229 Predicted GTPase
--|||||||-|||||----|----|||--------------------------||||||-------  1    [R]    COG2236 Predicted phosphoribosyltransferases
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  1    [P]    COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
||||||||||-|-----|-|||----|---||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [R]    COG2244 Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
-|-|--||------|--|||||--|||---||||||||-|--|||||-||||-||||||-||-|--  1    [R]    COG2252 Permeases
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-------------||--|--||----|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||--  1    [L]    COG2256 ATPase related to the helicase subunit of the Holliday junction resolvase
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1    [R]    COG2262 GTPases
----------------||||||--------||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [J]    COG2264 Ribosomal protein L11 methylase
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
------------------||----------||-|--||||||-||||-||--||||----|-||--  1    [V]    COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain
---|---------------|-|--------||||||||----|||||-||||||||----------  1    [R]    COG2333 Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)
--|---------------|-||--------------||----|||||-||---|||---|||||--  1    [R]    COG2334 Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)
-------------------|-|---------------|----|||--------|||---|------  1    [T]    COG2336 Growth regulator
-------------------|-|-----||-|---||||----|||-------|||----|||---|  1    [T]    COG2337 Growth inhibitor
------------------||||----|---|-----|-----|||||-||||-|||---|||||--  1    [S]    COG2350 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||-|----|--|--||--------|||||-||||-|||-------|--  1    [C]    COG2352 Phosphoenolpyruvate carboxylase
----||---------------|----|||-----||------|||||-||--|||||||||-||--  1    [S]    COG2353 Uncharacterized conserved protein
------------------||-|--------------------|||||-||--||||--||||||--  1    [O]    COG2360 Leu/Phe-tRNA-protein transferase
---------|--------||-|--------------------|||||-||||||||---|||||--  1    [O]    COG2377 Predicted molecular chaperone distantly related to HSP70-fold metalloproteases
--------------------||----|||||---||||----|---|-||--|-||--||||||--  1    [K]    COG2378 Predicted transcriptional regulator
------||--|||-------|---------------------|||||-|-||-||-----------  1    [S]    COG2431 Predicted membrane protein
-------------------|||----|---||||||||||--|||||-|----|||----------  1    [S]    COG2501 Uncharacterized conserved protein
||----||-|---------|-------------------------|---|---||----|-|----  1    [S]    COG2510 Predicted membrane protein
----||----|||------|------|||------|||----|||-|-||--||||----|-||--  1    [G]    COG2513 PEP phosphonomutase and related enzymes
||||--|||||||-|--|------------------------|||||-||--||||||||||||--  1    [O]    COG2518 Protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase
----------|-|------||-----||-|-||||||-----|||||-||||-|||---|||||--  1    [S]    COG2606 Uncharacterized conserved protein
----------------|-||----------|------------------|---|||--||||||--  1    [R]    COG2607 Predicted ATPase (AAA+ superfamily)
--||||--|--||||-||||||----|---|||-|||||-------|--|||-|||||-|||----  1    [P]    COG2608 Copper chaperone
---------------------|----||||------------||||||||||||||------||--  1    [C]    COG2609 Pyruvate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component
--|-----------------|-----|---|-|-|-||----|||||-||||-|||----------  1    [G    E]    COG2610 H+/gluconate symporter and related permeases
------------------------------|----|||----|||||---||-||-----------  1    [S]    COG2707 Predicted membrane protein
----||-------||--|--|---------||||||--|---------|----||-----|-|---  1    [F]    COG2759 Formyltetrahydrofolate synthetase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1    [N    U]    COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||--------|-----------|||||-||--||||----------  1    [N    U]    COG2805 Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
--------------------------||||-|||||-|----|||||-||||-|||---|||||--  1    [L]    COG2818 3-methyladenine DNA glycosylase
------------------||----------------------||||||||||-|||---|||||--  1    [M]    COG2821 Membrane-bound lytic murein transglycosylase
----------------------------------|||-----||||-------||-----------  1    [P]    COG2822 Predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport
---------------------|--------|-----------|||||-||||-|||----|---||  1    [R]    COG2823 Predicted periplasmic or secreted lipoprotein
--------------------------|----|||-|------|||||-||||-|||||||||||--  1    [P]    COG2824 Uncharacterized Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  1    [M]    COG2825 Outer membrane protein
------------------------------------|-----|||---||--||||---||-|---  1    [S]    COG2828 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||----|-||-|||-------  1    [M]    COG2829 Outer membrane phospholipase A
--------------------------------------------------||-||---|-------  1    [S]    COG2830 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------|||----------------------|||---|||||||--|----|--  1    [U]    COG2831 Hemolysin activation/secretion protein
--------------------||-----------||-------|||-|-||||-||----|||----  1    [S]    COG2832 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------------||-|||--||||----  1    [S]    COG2833 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-|||----|-------|----|--||----|-----||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG2834 Outer membrane lipoprotein-sorting protein
--||------|||-------------||||------------|||||-||-|||||----||||--  1    [S]    COG2835 Uncharacterized conserved protein
---|---------------|----------|-----------------||---||||||-------  1    [S]    COG2836 Uncharacterized conserved protein
--------------------------||||------------------||--|||---|-------  1    [C]    COG2838 Monomeric isocitrate dehydrogenase
-------------------|-|------------|-||---------------||-----------  1    [S]    COG2839 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------|-----------------||||||||||||||---|||||--  1    [S]    COG2840 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||----|-|-||-|||--|----  1    [S]    COG2841 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|------------------|-----||---||-||----------------||-----|-||--  1    [M]    COG2843 Putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)
--------------------------|||-------------|||||-||||-|||---|||||--  1    [O]    COG2844 UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase
------------------------|----------------------------||---|||||---  1    [S]    COG2845 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|---|-------|||||---|--|||----|-----  1    [D]    COG2846 Regulator of cell morphogenesis and NO signaling
----------|-----|----|----|---------------------||-|-|||--||||||||  1    [S]    COG2847 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||------||||-------------|---||-|-|-----------------||-----------  1    [S]    COG2848 Uncharacterized conserved protein
--------------------|-||------------|--------||--|---||---|-------  1    [S]    COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------|-----|||||--|||||||----------  1    [S]    COG2850 Uncharacterized conserved protein
--------------------------|-----|-|-||-----------|--|||---|-------  1    [C]    COG2851 H+/citrate symporter
-------------------|-|-------------|------|-------|--||-----|--|--  1    [S]    COG2852 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||--|----|||  1    [M]    COG2853 Surface lipoprotein
------------------------------------------|||||-||||||||--|----|||  1    [Q]    COG2854 ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, auxiliary component
--------|-----------|-----|----|||||------|||||--|||-|||--||||||--  1    [S]    COG2855 Predicted membrane protein
-------------||-|-------------------||----------||--||||||||||||||  1    [C]    COG2857 Cytochrome c1
---------------------|-----------------------|--||-|-||||||-|-----  1    [C]    COG2863 Cytochrome c553
--|----------||---|-----------------||----|||||--|---|||-------|--  1    [E]    COG2866 Predicted carboxypeptidase
-------------||---------------------------|||||-||-|||||---|||||||  1    [I]    COG2867 Oligoketide cyclase/lipid transport protein
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
--|--------------|--|---------------------||||||||||||||----------  1    [C]    COG2878 Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB
------------------------------------------|||||--|---|||--|-------  1    [S]    COG2879 Uncharacterized small protein
-------------------|-|----||||||||-|||----|||||-|||||||----|||||--  1    [D]    COG2884 Predicted ATPase involved in cell division
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
--------------------|---------||||-||-----|||||----|||||---|||||--  1    [G]    COG2893 Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA
----------------||||||--------|----|||----||||||||--||||||-||||---  1    [D]    COG2894 Septum formation inhibitor-activating ATPase
--------------------------|||-|-----------||||||||--||||---|||||--  1    [P]    COG2895 GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1
------------------------------------------|||||-|||||||----||||---  1    [S]    COG2900 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [K    L]    COG2901 Factor for inversion stimulation Fis, transcriptional activator
------------------|---------|-------------||-||-||--||||-------|--  1    [P]    COG2906 Bacterioferritin-associated ferredoxin
---------------------------||-------------------|----||----|--||--  1    [R]    COG2907 Predicted NAD/FAD-binding protein
-----------------|------------------------|||||-|||||||||||||-||--  1    [S]    COG2908 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||---|||||--  1    [S]    COG2911 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [S]    COG2914 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||-|||----||||||  1    [D]    COG2917 Intracellular septation protein A
------------------------||||||-|||||||----||||||||||||||---|||||||  1    [D]    COG2919 Septum formation initiator
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [S]    COG2921 Uncharacterized conserved protein
------------------------------------------|||||||---|||-----------  1    [S]    COG2922 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [C    O]    COG2924 Fe-S cluster protector protein
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG2927 DNA polymerase III, chi subunit
---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|---  1    [S]    COG2928 Uncharacterized conserved protein
------------------||--------------------------|-|---|||-----||-|--  1    [S]    COG2929 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||---------------------------|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG2938 Uncharacterized conserved protein
-------------------|----------------------|||-|-|---||||---||----|  1    [K]    COG2944 Predicted transcriptional regulator
---|----|----------------------------------------|--||||---|||||||  1    [R]    COG2945 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
--------------------------|||-------------|||||-||-|||||---|||||--  1    [M]    COG2951 Membrane-bound lytic murein transglycosylase B
------------------||--------------------------------|||----||-|---  1    [S]    COG2954 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  1    [G]    COG2956 Predicted N-acetylglucosaminyl transferase
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1    [H]    COG2959 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-||--||||---||||---  1    [S]    COG2960 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||---|||||-|  1    [R]    COG2961 Protein involved in catabolism of external DNA
------------------------------------------|||||-|-||-|||----------  1    [L]    COG2965 Primosomal replication protein N
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [R]    COG2969 Stringent starvation protein B
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [L]    COG2974 DNA recombination-dependent growth factor C
------------------------------------------|||||-|||--|||----------  1    [S]    COG2975 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [S]    COG2976 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|-----|-------|--|----||||--|--|-||--------|--  1    [H]    COG2978 Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter
------------------------------------------|||-|-||-|-||----||||---  1    [S]    COG2979 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [M]    COG2980 Rare lipoprotein B
------------------------------------------|||||-||---|||----|||-||  1    [M]    COG2982 Uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis
------------------------------------------|||||-|-||-||---|---|---  1    [S]    COG2990 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|--||||-||-----------  1    [S]    COG2991 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||---|||||||||||--  1    [C]    COG2993 Cbb3-type cytochrome oxidase, cytochrome c subunit
------------------------------------------|||||-|-||-|||----------  1    [S]    COG2995 Uncharacterized paraquat-inducible protein A
------------------------------------------|||-|-|--|-||-----------  1    [O]    COG2999 Glutaredoxin 2
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1    [R]    COG3008 Paraquat-inducible protein B
------------------------------------------|||||-||---|||----------  1    [S]    COG3009 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [M]    COG3017 Outer membrane lipoprotein involved in outer membrane biogenesis
----------------|---|-----|-----||--------|||||-||||-|||--|----|-|  1    [S]    COG3022 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-||||||||---|||||-|  1    [V]    COG3023 Negative regulator of beta-lactamase expression
------------------------------------------|||||-||||-|||----||||--  1    [S]    COG3024 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  1    [S]    COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [S]    COG3028 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--||----------------------||-------|||----|||||-||-|-||----||||---  1    [R]    COG3030 Protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid
------------------|-----------------------|||||-||-||-||---|||||-|  1    [C]    COG3038 Cytochrome B561
--------|---------------------------------|||||-|----|||------|---  1    [R]    COG3042 Putative hemolysin
------------------------------------------|||||-||---|||---||||---  1    [S]    COG3045 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|--||||||||----------  1    [N    U]    COG3063 Tfp pilus assembly protein PilF
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [H]    COG3071 Uncharacterized enzyme of heme biosynthesis
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [D]    COG3087 Cell division protein
------------------------------------------|||||-|-||-||-----------  1    [S]    COG3094 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------|||----------|---||--|||-----|||||-|---|||--------|--  1    [E]    COG3104 Dipeptide/tripeptide permease
------------------------------------------|||||-|-||||||----------  1    [R]    COG3113 Predicted NTP binding protein (contains STAS domain)
|||-----||-----------------|||------------|||||-||-|-|||----------  1    [H]    COG3161 4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  1    [S]    COG3165 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||----------------------|||||-||--||||------|---  1    [N    U]    COG3166 Tfp pilus assembly protein PilN
------------------------------------------------||--||||----------  1    [N    U]    COG3167 Tfp pilus assembly protein PilO
------------------------------------------------||--||||----------  1    [N    U]    COG3168 Tfp pilus assembly protein PilP
------------------------------------------------||--||||----------  1    [N    U]    COG3170 Tfp pilus assembly protein FimV
------------------------------------------|||||--|||-||-----------  1    [S]    COG3171 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|--||||---|||||--  1    [R]    COG3178 Predicted phosphotransferase related to Ser/Thr protein kinases
--------------------------|-------|--|----------||---|||---|---|--  1    [S]    COG3182 Uncharacterized iron-regulated membrane protein
-------------------------------------------------|--|||----||||---  1    [S]    COG3184 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||---||||||-|-||--  1    [P]    COG3197 Uncharacterized protein, possibly involved in nitrogen fixation
------------------------------------------------||---||-----------  1    [S]    COG3198 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--|-----------------|-----------|-||||----------||---||-------||--  1    [S]    COG3212 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|--||||----------  1    [N    U]    COG3215 Tfp pilus assembly protein PilZ
-------------------------------------------------|||-||-----------  1    [S]    COG3219 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|------------------|||-|||----|--|--  1    [S]    COG3220 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------|---------------------------|---||----|------  1    [P]    COG3230 Heme oxygenase
------------------------------------------------||---||-----------  1    [S]    COG3235 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|--|||-----------  1    [C]    COG3241 Azurin
------------------------------------------------||---|||-------|--  1    [C]    COG3245 Cytochrome c5
----------||------|------------------------------|---|||---|||----  1    [P]    COG3256 Nitric oxide reductase large subunit
-------------||----|-|----|---------------|||||-||-|-|||---||-|---  1    [G]    COG3265 Gluconate kinase
------------------------------------------------||---|||||||||||--  1    [O]    COG3278 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 1
------------------||-------|-|------------|||||-||||-|||---|||||||  1    [C]    COG3288 NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit
-----------------------------------------------------||-|||-------  1    [L]    COG3298 Predicted 3'-5' exonuclease related to the exonuclease domain of PolB
-----------------||||---------|--||-------|||||-||||||||||-|||||||  1    [M]    COG3307 Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
------------------------------------------------||---|||----------  1    [S]    COG3308 Predicted membrane protein
------------------------------------------------|---||||----------  1    [S]    COG3310 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||-||||-||-----------  1    [C]    COG3312 F0F1-type ATP synthase, subunit I
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1    [M]    COG3317 Uncharacterized lipoprotein
----------------------||------------|-----|||-|-||---||-----------  1    [R]    COG3318 Predicted metal-binding protein related to the C-terminal domain of SecA
--|----------------------------|||-|||--------|--|---||-|--|------  1    [S]    COG3326 Predicted membrane protein
-----------------------------------------------------||-|||-------  1    [S]    COG3399 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|--|-||----------  1    [N    U]    COG3419 Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1
----------|--------------------------------------|---|||----||----  1    [P]    COG3420 Nitrous oxidase accessory protein
---------------------------------------|----------|---|--|--------  1    [S]    COG3421 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|||||---||--|-----------  1    [K]    COG3423 Predicted transcriptional regulator
--||||-----|----|-------|---------------------|------||------|----  1    [S]    COG3439 Uncharacterized conserved protein
-----|-------------|-|---------------------||--------||-----------  1    [V]    COG3440 Predicted restriction endonuclease
----------------------------------------------------|||----|||||--  1    [S]    COG3453 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|||--------------|||--------||-----|--------|------|||----|||---  1    [R]    COG3467 Predicted flavin-nucleotide-binding protein
-------------------------------------------------|-|-|||----------  1    [S]    COG3471 Predicted periplasmic/secreted protein
--------------------------------|------------------|--|---|-------  1    [S]    COG3512 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------|--|---------------|--|---|-------  1    [S]    COG3513 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------||-----|||----||-|---  1    [S]    COG3514 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  1    [M]    COG3524 Capsule polysaccharide export protein
-------------------------------------------------|---|||---||||---  1    [S]    COG3536 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------|----------------||--||-------------|---||----|-|----  1    [R]    COG3560 Predicted oxidoreductase related to nitroreductase
------------------------------|||-|--------||-----|---|-----------  1    [K]    COG3561 Phage anti-repressor protein
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  1    [M]    COG3562 Capsule polysaccharide export protein
---------------------------------------------------|-||---|-|-----  1    [M]    COG3563 Capsule polysaccharide export protein
--------------------|-------------------------|----|-||-||--------  1    [V]    COG3587 Restriction endonuclease
---------------------------------|--------|||||---||-||-----------  1    [P]    COG3615 Uncharacterized protein/domain, possibly involved in tellurite resistance
--------------------------------|---------|||||-||||-||---|-------  1    [E]    COG3633 Na+/serine symporter
------------------------------------------|||||---||-||----|||||||  1    [M]    COG3637 Opacity protein and related surface antigens
------------------------------------------------|----|||-------|--  1    [C]    COG3658 Cytochrome b
--|-----------|------|--------------------|||-|----|-|||--|----|--  1    [L]    COG3663 G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase
-----------------------------------------------------|||-------|||  1    [S]    COG3671 Predicted membrane protein
------------------||----------------------|||||-||----||----|-----  1    [U    N    T    P]    COG3678 P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc-resistance associated protein
---------------------|---------------------||--------||-----------  1    [S]    COG3680 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|-----------------------------|---|||---|-|-|--  1    [S]    COG3686 Predicted membrane protein
----------------|-||-|--------||---|||-----------|---|||---|||||--  1    [E]    COG3705 ATP phosphoribosyltransferase involved in histidine biosynthesis
------------------------------------------|||-|-------||----|--|--  1    [L]    COG3727 DNA G:T-mismatch repair endonuclease
----------------------------------------------------||||---|||||--  1    [S]    COG3737 Uncharacterized conserved protein
--------------------------|----|-|||--------------|--|||---|--|---  1    [S]    COG3759 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|||-||-----------  1    [S]    COG3767 Uncharacterized low-complexity protein
------------------------------------------|----------||-------|---  1    [S]    COG3779 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------------||---||-----------  1    [S]    COG3782 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||-----|||---------------||||||-|-|-------------|---||-----------  1    [T]    COG3830 ACT domain-containing protein
------------------------------------------|||||-||||-|||----------  1    [T]    COG3850 Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific
-------------------------------------------------|---|||----||----  1    [K]    COG3901 Regulator of nitric oxide reductase transcription
-------------------------------------------------|---||----||-|---  1    [C]    COG3909 Cytochrome c556
----------------------------------------------|------||-----|||---  1    [R]    COG3926 Putative secretion activating protein
---------------------------------------------||--|---||-----------  1    [R]    COG3943 Virulence protein
-----------|------||---------------------------------|||-------|-|  1    [R]    COG3975 Predicted protease with the C-terminal PDZ domain
-------------------|----------------------|||||-|----||-----------  1    [E]    COG3977 Alanine-alpha-ketoisovalerate (or valine-pyruvate) aminotransferase
------------------------------------------------------|---|-|-----  1    [M]    COG4092 Predicted glycosyltransferase involved in capsule biosynthesis
----------------|-------------------------||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG4105 DNA uptake lipoprotein
------------------||-|----|---||||||------||||||||||||||---|||||--  1    [J]    COG4108 Peptide chain release factor RF-3
-----------------------------------------------------||----||-||--  1    [R]    COG4111 Uncharacterized conserved protein
--||--------|-|-|-||||----||||||||||||-----------|---||-------|---  1    [R]    COG4122 Predicted O-methyltransferase
------------------------------------------|||||-||-|||||----------  1    [R]    COG4137 ABC-type uncharacterized transport system, permease component
---|--||--|----------|--|-----------------|||||-|-||-||----||||---  1    [H]    COG4143 ABC-type thiamine transport system, periplasmic component
------------------||-------||--------|----|||||-||--||||---|||||--  1    [P]    COG4208 ABC-type sulfate transport system, permease component
---|---------||---||||----|||--|-|||------|||-|-||||||||||||||----  1    [R]    COG4221 Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity
------------------------------------------|||||--|-|-|||---|||||--  1    [C]    COG4230 Delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase
----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|--  1    [O    C]    COG4232 Thiol:disulfide interchange protein
----------------------------------------------------||||----------  1    [S]    COG4255 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|---|---|||----------  1    [S]    COG4259 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|------|----||||------------------||-----------  1    [P]    COG4300 Predicted permease, cadmium resistance protein
------------------------------|--------------|-------||-----------  1    [S]    COG4304 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------------|---|||----||----  1    [C]    COG4314 Predicted lipoprotein involved in nitrous oxide reduction
--------------------------------------------------|--||-------|---  1    [S]    COG4316 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------|---|---|||----------  1    [S]    COG4380 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------||----|--||-----------  1    [R]    COG4386 Mu-like prophage tail sheath protein gpL
--------------------------------------------|-----|--||-----------  1    [S]    COG4387 Mu-like prophage protein gp36
--------------------------------------------|-----|--||-----------  1    [R]    COG4388 Mu-like prophage I protein
---------------------------------------------------|-|||----------  1    [L]    COG4389 Site-specific recombinase
---------------------------------------------------|-|||----------  1    [S]    COG4390 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------------------------------------||||---|||-|-|  1    [S]    COG4391 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|----------------------------|----||----------  1    [S]    COG4394 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------------------------|-----|---|-----------  1    [R]    COG4396 Mu-like prophage host-nuclease inhibitor protein Gam
--------------------------------------------|-----|---|-----------  1    [R]    COG4397 Mu-like prophage major head subunit gpT
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [P]    COG4535 Putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC
--|-------------|---||--||----|-----------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4591 ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  1    [P]    COG4604 ABC-type enterochelin transport system, ATPase component
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  1    [P]    COG4605 ABC-type enterochelin transport system, permease component
--------------------------|------||-||-------|--|----||---||-|----  1    [P]    COG4606 ABC-type enterochelin transport system, permease component
------------------|-------------||---------------|---||-------|---  1    [S]    COG4642 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------------------------------||---------||----------  1    [S]    COG4648 Predicted membrane protein
-------------------------------------------------|--||||----------  1    [N    U]    COG4726 Tfp pilus assembly protein PilX
------------------------------------------------|-----|||||-|-||--  1    [O]    COG4736 Cbb3-type cytochrome oxidase, subunit 3
-------------------|-----------------------||-|------|||----|-----  1    [S]    COG4737 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
----------------||||----------------------|||||-||||||||----------  1    [U]    COG4796 Type II secretory pathway, component HofQ
--------------------|------------------------------|-||---------||  1    [R]    COG4797 Predicted regulatory domain of a methyltransferase
--------------------|----------------------------|---||-----------  1    [S]    COG4859 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------------|---------------------------|--------|--  1    [S]    COG4899 Uncharacterized protein conserved in bacteria
--------------------|---------------------|||||-|||||||----|||||--  1    [D]    COG4942 Membrane-bound metallopeptidase
-------------------------------------------------|--||||----------  1    [N    U]    COG4966 Tfp pilus assembly protein PilW
------------------------------------------|||||-||--||||----------  1    [N    U]    COG4967 Tfp pilus assembly protein PilV
------------------------------------------------||--||||------|---  1    [N    U]    COG4970 Tfp pilus assembly protein FimT
------------------||-|--------------------------||--||||----------  1    [N    U]    COG4972 Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM
------------------------------------------|||||-||||||||----------  1    [L]    COG4973 Site-specific recombinase XerC
--------------------|---|-|||||---||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG4974 Site-specific recombinase XerD
|||---|||||||||-||||-|----||||||--||||----||||||||-|||||--||||||--  1    [E]    COG4992 Ornithine/acetylornithine aminotransferase
----------------|------------------------------------|||---|||||||  1    [T]    COG5000 Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation
--------------------------------------------|-----|--||-----------  1    [R]    COG5003 Mu-like prophage protein gp37
------------------------------------------||||||||||||||----------  1    [K]    COG5007 Predicted transcriptional regulator, BolA superfamily
----------------|-------||----------------|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG5009 Membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein
--|-----------------|-----------------------------|--||------|----  1    [P]    COG5266 ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component
--|-----------------|----------------|-----||||---||||||----|||---  1    [U    W]    COG5295 Autotransporter adhesin
---------------------|--------------------|||||-|-||-||-----------  1    [S]    COG5339 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-------------------|---------------------------------||---------||  1    [S]    COG5346 Predicted membrane protein
--------------------------||||-----|||---------------|||----------  1    [S]    COG5416 Uncharacterized integral membrane protein
-|--|||-----------|||---|-----|----|-|----|||||-|-||||--||-------|  0    [L]    COG0338 Site-specific DNA methylase
||||---||----------|-----------||-||--|||-------||||||--|||-||-|-|  0    [V]    COG0610 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
-|-||||----------|-|||----------|--|-|----|||||-|-|-||-|||-|||||--  0    [L]    COG0863 DNA modification methylase
--|---------------|-------------------------------||-|--|-|-------  0    [M]    COG1083 CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase
-|--|-|||----||-----------|||--||||-------|||-|-|-||-|------------  0    [P]    COG1275 Tellurite resistance protein and related permeases
-||-----|--------||--|-------------------------------|-----|---|--  0    [R]    COG1669 Predicted nucleotidyltransferases
-||-----------------|---|-----|-----|----------------|--|||----|--  0    [M]    COG2089 Sialic acid synthase
---------------------|----|||-------------|||-|-||---|-------|-|--  0    [S]    COG2354 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-||---------------|--|-------------------------------|-----|---|--  0    [S]    COG2361 Uncharacterized conserved protein
------------------------------|-----|-----|||||------|------------  0    [K]    COG2732 Barstar, RNAse (barnase) inhibitor
---------------------|--------|--|--|------||-|--|---|----||---|--  0    [R]    COG2819 Predicted hydrolase of the alpha/beta superfamily
-------------------|||---|-||-|--|||||--------------||-|-----|----  0    [E]    COG2856 Predicted Zn peptidase
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  0    [E]    COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
------------------|-----------------------------|----|-|----|-----  0    [O]    COG2994 ACP:hemolysin acyltransferase (hemolysin-activating protein)
---------------------|----|---------------|||||-||||-|-|----------  0    [S]    COG3012 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------------------|--||-||||-|------------  0    [S]    COG3036 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------------------|--|||------|||||-||||-|-|----|-||-|  0    [K]    COG3070 Regulator of competence-specific genes
---|--------------------------------------------||---|---------|--  0    [S]    COG3205 Predicted membrane protein
--------------------------------------------------|-||--||--------  0    [S]    COG3309 Uncharacterized virulence-associated protein D
--------------------|-----|---------------|||---|-|--|-|---||-||--  0    [R]    COG3550 Uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzymes
-------------------|-------------|-----|-----||-||---|-------|-|--  0    [R]    COG3654 Prophage maintenance system killer protein
------------------------------------------|||-----|--|---------|--  0    [S]    COG3692 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||-------||------------------------|-----||-----  0    [S]    COG3744 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------------------------------------------|||------------  0    [S]    COG3792 Uncharacterized protein conserved in bacteria
------------------||-------||------------------------|------|----|  0    [D]    COG4118 Antitoxin of toxin-antitoxin stability system
-------------|----||-------|||------------|||-----||-|-|---||||---  0    [R]    COG4178 ABC-type uncharacterized transport system, permease and ATPase components
-------------------------------------------||--------|-|----------  0    [I]    COG4706 Predicted 3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase
------------------------------|---||-----------------|------------  0    [L]    COG5527 Protein involved in initiation of plasmid replication
------------------------------------------|---------||------------  0    [S]    COG5532 Uncharacterized conserved protein

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