(Cpn) Chlamydophila pneumoniae CWL029
generin.cgi	Functional categories
	Fun	All	J	A	K	L	B	D	Y	V	T	M	N	Z	W	U	O	C	G	E	F	H	I	P	Q	R	S
	COGs	603	115	-	25	52	1	7	-	3	15	39	12	-	-	32	30	37	32	46	21	39	28	25	5	56	33
	proteins	691	119	-	28	61	2	9	-	3	20	41	14	-	-	36	37	46	36	59	23	43	31	32	7	76	40
	Distribution of COGs by number of proteins
	proteins	1	2	3	6	8
	COGs	533	60	8	1	1

Co-ocurrences in sister taxa	0	1
order Chlamydiales	24	579

+    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    ++    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +    +
|||||||||--|-|||||||||||||----||||||||----|||||-||-|||||||||||||||  8    [R]    COG0457 FOG: TPR repeat
--|----------------|---|-----------------------------------|------  6    [S]    COG5563 Predicted integral membrane proteins containing uncharacterized repeats
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  3    [O]    COG0459 Chaperonin GroEL (HSP60 family)
|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  3    [Q    R]    COG0500 SAM-dependent methyltransferases
---|||----|||||---||-|||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  3    [C]    COG0508 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase (E2) component, and related enzymes
---|||----||-||||-||-|||--||||||||||||||||-|-|--|||||--||--|--|---  3    [R    T    K    L]    COG0515 Serine/threonine protein kinase
|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  3    [O    C]    COG0526 Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
|-||--|||-|-|---|||||||||-||-|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  3    [P]    COG1108 ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease components
--||---------||-|||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||||  3    [R]    COG1253 Hemolysins and related proteins containing CBS domains
-----------------|--|-|||||||-||-||||-||--|||||-||||---|||-||||---  3    [E]    COG4166 ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  2    [C]    COG0022 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [D]    COG0037 Predicted ATPase of the PP-loop superfamily implicated in cell cycle control
---|||||---||||-||||--||--|----|||||||-||||||||-||----------------  2    [H]    COG0095 Lipoate-protein ligase A
-|--||||-----||||-||||||---|||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  2    [H]    COG0156 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0187 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit
--||||--|----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0188 Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), A subunit
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0204 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
-------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||------||-|---  2    [G]    COG0205 6-phosphofructokinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0231 Translation elongation factor P (EF-P)/translation initiation factor 5A (eIF-5A)
--|||||||-|||---||--||||-||---|||||||||||||||||-||||---||||||||---  2    [E    P]    COG0444 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
-|-----------||----|-|||-|-||-||||||||-|--|||||||||||||---|||||---  2    [L]    COG0507 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member
||-|||||-|--|||-||||||-|-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  2    [F]    COG0516 IMP dehydrogenase/GMP reductase
||||||--||||||||--|||-||--|||||||||||||||||||||-|||||--|---|||||||  2    [E]    COG0531 Amino acid transporters
|------------||||||||||||||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||  2    [O]    COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit
--||-||||--|||||-|||||||--|||-||||-|||--|||||||-|||||-------|-----  2    [K    L]    COG0553 Superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family
|-|||||||-|||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  2    [I]    COG0558 Phosphatidylglycerophosphate synthase
-------------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0564 Pseudouridylate synthases, 23S RNA-specific
|||||||||--||---||||||||--||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  2    [L]    COG0582 Integrase
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0593 ATPase involved in DNA replication initiation
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||||||||---  2    [E    P]    COG0601 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
-------------|||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0617 tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase
|||||||||||||||-||-----|--||||-|-|||||----||||||||||||||--||--||--  2    [E]    COG0620 Methionine synthase II (cobalamin-independent)
|||||||||||||---||||||-||-|||||---|-||----||||||||||||||||||||||||  2    [J]    COG0621 2-methylthioadenine synthetase
----------------|||||||||||||-|||||||||---||||||||||||||||||||||||  2    [H]    COG0635 Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases
-------------||---||||||-|----|||||||--|--|||||-||||-|||||||||||||  2    [R]    COG0670 Integral membrane protein, interacts with FtsH
|-|||||||-|||||||||||||||-|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  2    [G    E    R]    COG0697 Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  2    [O]    COG0719 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [O    U]    COG0740 Protease subunit of ATP-dependent Clp proteases
--|||||||-|||---||||||||--|||||||-||||----|||||-||||---||||||||---  2    [E]    COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [M]    COG0768 Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [D]    COG0772 Bacterial cell division membrane protein
--|--------------|--|||||||||-||||||||||--||||||||||-|||||||||||--  2    [F]    COG0775 Nucleoside phosphorylase
-----------------|||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  2    [R]    COG0795 Predicted permeases
|-||--|||-|-|---|||||||||-||||||||||||-------||--|||-||---|||-|-||  2    [P]    COG0803 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin
-------------|||------||--|---------------|||||-||||-||-|||-------  2    [E]    COG0814 Amino acid permeases
--|-----|-|-|----||||||||-||||||||||||----|||||-||||-|||||||||||||  2    [E    T]    COG0834 ABC-type amino acid transport/signal transduction systems, periplasmic component/domain
----|---|----||||||--||||-|||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  2    [L]    COG0847 DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonucleases
||||||--|||-|---||||||||---||||------|----|||||-|-------|||-------  2    [H    R]    COG1060 Thiamine biosynthesis enzyme ThiH and related uncharacterized enzymes
---|||----||||||--||-|||---||--|||||||-|||-------|-----|---|||||||  2    [C]    COG1071 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, alpha subunit
--||---||---||||-|-|||||--|||-|||--|||----|||||-||-||--|---|||||--  2    [R]    COG1073 Hydrolases of the alpha/beta superfamily
--|-----|----||||||||||||-||||||||||||----||||||||||-|||||||||||||  2    [E]    COG1104 Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  2    [G]    COG1109 Phosphomannomutase
--|---||------------|||||-|-----|||-||----|||-|-||||-||-|||-||----  2    [E]    COG1115 Na+/alanine symporter
|-||--|||-|||---|||||||||-|--|||||||||----||||||||||-||---|||||-||  2    [P]    COG1121 ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  2    [N    U]    COG1157 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase
--|||||||-|||---||||||||-||||||||||||||||||||||-||||---||-|||||---  2    [E    P]    COG1173 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components
||||||||||----|-|-|||-||||----||||||||----||||---|-----|---|||||||  2    [R]    COG1235 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily I
--||--||----|---|--||||||||||-|---|-||----|||||-||--|--|--|||-||||  2    [C]    COG1301 Na+/H+-dicarboxylate symporters
-----------------||||||||--||-|---||||----------||---------||--|--  2    [T]    COG1366 Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)
----------------|----|||-||||-||--||||-------|--||||--------------  2    [M]    COG1388 FOG: LysM repeat
|-||---------|||--||--||||--------|-||----||-----|------------|---  2    [C]    COG1413 FOG: HEAT repeat
----------------|---|-||------------------|||||-||--|--|--|---||--  2    [N    U]    COG1450 Type II secretory pathway, component PulD
----||--|-|--|||-||||-||--|---||||||||||--||||||||||||||||-|||||||  2    [I]    COG1502 Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/cardiolipin synthases and related enzymes
--||----|-|-|----|--||||-||-------|-|-----|||||-||||-||----||||---  2    [S]    COG1738 Uncharacterized conserved protein
--------------------|-|||||---||||||||-||||||||-||||-|||---|||||--  2    [G    T]    COG1762 Phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain (Ntr-type)
----------------||||||||||-|||||||-|||------------------|||-------  2    [R]    COG1837 Predicted RNA-binding protein (contains KH domain)
-||-|||||||||---|--|-||||-----------|-----||||||||-|||||--||||||--  2    [U]    COG2095 Multiple antibiotic transporter
--------------------|-||------------|--------||--|---||---|-------  2    [S]    COG2849 Uncharacterized protein conserved in bacteria
---------------|------||----------------------------|-----------||  2    [C]    COG3202 ATP/ADP translocase
-------------|||------||------------------------------------------  2    [B]    COG5531 SWIB-domain-containing proteins implicated in chromatin remodeling
||||||--|||||-|-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||--  1    [H]    COG0001 Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0006 Xaa-Pro aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0008 Glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG0009 Putative translation factor (SUA5)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0012 Predicted GTPase, probable translation factor
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0013 Alanyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0016 Phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0018 Arginyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0020 Undecaprenyl pyrophosphate synthase
-------------|||||||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0021 Transketolase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0024 Methionine aminopeptidase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0030 Dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)
-|--||-------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0036 Pentose-5-phosphate-3-epimerase
||||||--|||||||-||||||||-|||||||||||||-||||||||-|-|||--|--||||||||  1    [C]    COG0039 Malate/lactate dehydrogenases
||||----||---|||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [J]    COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1    [H]    COG0043 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase and related decarboxylases
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0045 Succinyl-CoA synthetase, beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0048 Ribosomal protein S12
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0049 Ribosomal protein S7
---------|---||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0050 GTPases - translation elongation factors
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0051 Ribosomal protein S10
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0052 Ribosomal protein S2
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0054 Riboflavin synthase beta-chain
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0057 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase
-||---||--||-|--|-||||||--|||-||||--||----|||||-||||-------||-|---  1    [G]    COG0058 Glucan phosphorylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0060 Isoleucyl-tRNA synthetase
||||----||-||||-||||||||||||||||||||||||||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0064 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0072 Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0073 EMAP domain
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [C]    COG0074 Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0080 Ribosomal protein L11
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0081 Ribosomal protein L1
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0082 Chorismate synthase
|||---||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0084 Mg-dependent DNase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0085 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0086 DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit/160 kD subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0087 Ribosomal protein L3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0088 Ribosomal protein L4
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0089 Ribosomal protein L23
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0090 Ribosomal protein L2
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0091 Ribosomal protein L22
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0092 Ribosomal protein S3
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0093 Ribosomal protein L14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0094 Ribosomal protein L5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0096 Ribosomal protein S8
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0097 Ribosomal protein L6P/L9E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0098 Ribosomal protein S5
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0099 Ribosomal protein S13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0100 Ribosomal protein S11
|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0101 Pseudouridylate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0102 Ribosomal protein L13
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0103 Ribosomal protein S9
|||||||||||||||||-||-||||||||||--|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [F]    COG0105 Nucleoside diphosphate kinase
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0108 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase
||||---|-||--||--|||-|||--||||||||||||----|||-|-||-|-|||--||||||-|  1    [R]    COG0110 Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0112 Glycine/serine hydroxymethyltransferase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0113 Delta-aminolevulinic acid dehydratase
--||------|||||---|--|||--||||----||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0114 Fumarase
-------------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0117 Pyrimidine deaminase
||||||||||||||||--||-|||||----||||||------||||||||||||||---|||||--  1    [G]    COG0120 Ribose 5-phosphate isomerase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0124 Histidyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0125 Thymidylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0126 3-phosphoglycerate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [F]    COG0127 Xanthosine triphosphate pyrophosphatase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0128 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--||||||||||||||--||||||||  1    [J]    COG0130 Pseudouridine synthase
-|-----------|--|-|||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1    [H]    COG0132 Dethiobiotin synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0136 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0142 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0143 Methionyl-tRNA synthetase
-|-|--||||||||||-|||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG0144 tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0148 Enolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0149 Triosephosphate isomerase
||||----|||||||-||||||||||||||||||||||||||---|---|---|||||||||||||  1    [J]    COG0154 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and related amidases
-|-----------||-|---||-|--|||||---|-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0161 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0162 Tyrosyl-tRNA synthetase
|||-||||||||||--|-||-|||------------||----|||||-||-|-|||||||||-|||  1    [H]    COG0163 3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase
||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0164 Ribonuclease HII
-|-|||----||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||--  1    [G]    COG0166 Glucose-6-phosphate isomerase
||||||-||||||||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0169 Shikimate 5-dehydrogenase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0172 Seryl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0173 Aspartyl-tRNA synthetase
-|--||-------||-||||-|||--|||||-||||||----||||||||||-|||||||||||--  1    [G]    COG0176 Transaldolase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0177 Predicted EndoIII-related endonuclease
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0178 Excinuclease ATPase subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0180 Tryptophanyl-tRNA synthetase
||||||--|||||||-|-||||||--|||||---||||----||||||||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0181 Porphobilinogen deaminase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0184 Ribosomal protein S15P/S13E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0185 Ribosomal protein S19
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0186 Ribosomal protein S17
--||||----||-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||  1    [H]    COG0190 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0193 Peptidyl-tRNA hydrolase
-------------|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0194 Guanylate kinase
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0195 Transcription elongation factor
-------------||-|||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0196 FAD synthase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0197 Ribosomal protein L16/L10E
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0198 Ribosomal protein L24
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0199 Ribosomal protein S14
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0200 Ribosomal protein L15
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0201 Preprotein translocase subunit SecY
||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0202 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit/40 kD subunit
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0203 Ribosomal protein L17
---|-------|-||||-|-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||-|-|||  1    [F]    COG0208 Ribonucleotide reductase, beta subunit
|-|||||||-|||||||||-|||||-||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0209 Ribonucleotide reductase, alpha subunit
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0210 Superfamily I DNA and RNA helicases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0211 Ribosomal protein L27
|--|-----||||||-|-|||||||-||||||-|||||--|||||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0212 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0215 Cysteinyl-tRNA synthetase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0216 Protein chain release factor A
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0217 Uncharacterized conserved protein
------------------||||||--|||||||||-|||||||||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG0219 Predicted rRNA methylase (SpoU class)
-------------||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0220 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase
|-||||||-|-||||||-||||||--|||||----|-|||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0221 Inorganic pyrophosphatase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0222 Ribosomal protein L7/L12
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0223 Methionyl-tRNA formyltransferase
-------------||-|||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0227 Ribosomal protein L28
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0228 Ribosomal protein S16
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0230 Ribosomal protein L34
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0233 Ribosome recycling factor
--|----------||-||||||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0234 Co-chaperonin GroES (HSP10)
--|----------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0236 Acyl carrier protein
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [H]    COG0237 Dephospho-CoA kinase
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0238 Ribosomal protein S18
|-------|----|||||||||||||||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0240 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0242 N-formylmethionyl-tRNA deformylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0244 Ribosomal protein L10
----------------|||||||||-|||||----|||--||||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG0245 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
--||-|-------|||||||||||||----|||-||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0249 Mismatch repair ATPase (MutS family)
|||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0250 Transcription antiterminator
||------||------|||||-||--|||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0253 Diaminopimelate epimerase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0254 Ribosomal protein L31
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0255 Ribosomal protein L29
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0256 Ribosomal protein L18
-------------||-||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0257 Ribosomal protein L36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)
------------|-|||-||||||--||||----|-|||||||||||||||||-||||||||||||  1    [E]    COG0260 Leucyl aminopeptidase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0261 Ribosomal protein L21
--|----------|||-|--||||--||||||||||||||||||||||||||||||---|||||-|  1    [H]    COG0262 Dihydrofolate reductase
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0264 Translation elongation factor Ts
|-||------||-||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0265 Trypsin-like serine proteases, typically periplasmic, contain C-terminal PDZ domain
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0267 Ribosomal protein L33
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0268 Ribosomal protein S20
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0272 NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II)
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0275 Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell envelope biogenesis
----||-------||-|-||-|||--||||-|-|||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0276 Protoheme ferro-lyase (ferrochelatase)
---------------||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||---|||||||  1    [F]    COG0283 Cytidylate kinase
|||-----||------||||--||--|||-||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0289 Dihydrodipicolinate reductase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0290 Translation initiation factor 3 (IF-3)
-------------|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0291 Ribosomal protein L35
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0292 Ribosomal protein L20
|||||||||||||||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [H]    COG0294 Dihydropteroate synthase and related enzymes
--|--------|-|--|-||||||--|||----|--|-----|||||-||||---|---||-|---  1    [G]    COG0296 1,4-alpha-glucan branching enzyme
-|----||--||--|-||||||||------||-|--||----|||||-||||---|---||-|---  1    [G]    COG0297 Glycogen synthase
-------------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q]    COG0304 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0305 Replicative DNA helicase
||||||||||||-|---|-|-|||--|||||---||||----||||||||||-||||||||-|---  1    [P]    COG0306 Phosphate/sulphate permeases
---|---------||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0307 Riboflavin synthase alpha chain
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0313 Predicted methyltransferases
|-||||--|-|||||---||-|||--||||-||-||||----|||||-||||||||--||||||||  1    [I    Q]    COG0318 Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0319 Predicted metal-dependent hydrolase
---|------|||||-|-||-|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1    [H]    COG0320 Lipoate synthase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0322 Nuclease subunit of the excinuclease complex
--||---------|||||||||||||----||||||||----||||||||||||||---|||||||  1    [L]    COG0323 DNA mismatch repair enzyme (predicted ATPase)
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0324 tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
||||--||||---|||---|||||||||-|||||||||||--||||||||||-||||||-------  1    [S]    COG0327 Uncharacterized conserved protein
|||||||||||||---|||||-||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E    M]    COG0329 Dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0331 (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase
----------------|-||||||---||-||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0332 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0333 Ribosomal protein L32
--|||||||-|||||--|||||||--|---|--|||||----|||||--|||-|||||--||-|--  1    [E]    COG0334 Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0335 Ribosomal protein L19
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0336 tRNA-(guanine-N1)-methyltransferase
----||-|--|||||--|||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0337 3-dehydroquinate synthetase
||||--|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [H]    COG0340 Biotin-(acetyl-CoA carboxylase) ligase
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0341 Preprotein translocase subunit SecF
||||--||-|------|||||||||||||||---||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0342 Preprotein translocase subunit SecD
|||||||||||||-||||||||||-||---||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0343 Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase
||||||||||||||--||-||-|||-||||||-|||||-|--|||||-||||||||||||||||-|  1    [L]    COG0350 Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase
----------------|-|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0353 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0358 DNA primase (bacterial type)
--------------|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0359 Ribosomal protein L9
-------------||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0360 Ribosomal protein S6
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
-------------|||-|||--||||||||-|-||||-----|||||||-||-||----||||---  1    [G]    COG0362 6-phosphogluconate dehydrogenase
-------------|||-||||-||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||-|||||--  1    [G]    COG0363 6-phosphogluconolactonase/Glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase
-------------|||||||-||||||||--|-||||-----||||||||||||||||-|||||--  1    [G]    COG0364 Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase
-------------|||--||--||----------|-||----||||||||--|||----|-|-|--  1    [P]    COG0369 Sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)
||||||--|||||---|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||-------  1    [H]    COG0373 Glutamyl-tRNA reductase
|||||||||||||||-|-||-|||--|||||------|----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0382 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase and related prenyltransferases
|||||||||||||----|||-||||-||||||||||||----|||||-----|------|||||--  1    [O]    COG0396 ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, ATPase component
-------------||---||-|||-------|--||||----|||----|--|------||||-||  1    [R]    COG0400 Predicted esterase
--|-||-------||-|-||-|||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG0407 Uroporphyrinogen-III decarboxylase
----------------||||||||------|||||||||||||||||-||-|-|||||||||||--  1    [I]    COG0416 Fatty acid/phospholipid biosynthesis enzyme
--|---||-----||-||||||||--|||||-----||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [D]    COG0424 Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation
|||||||||||||||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [E]    COG0436 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
|||-----|--|-||-|-||-||||--||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0439 Biotin carboxylase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0441 Threonyl-tRNA synthetase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0442 Prolyl-tRNA synthetase
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0443 Molecular chaperone
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [D]    COG0445 NAD/FAD-utilizing enzyme apparently involved in cell division
-----------------|||||||--||||||-|--||----|||||-|-||-------||-|---  1    [G]    COG0448 ADP-glucose pyrophosphorylase
||||||||-||||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [M]    COG0449 Glucosamine 6-phosphate synthetase, contains amidotransferase and phosphosugar isomerase domains
|||-|||||-|||||||||||||||--|||-||-||||----||||||||-||--|||||||||||  1    [O]    COG0450 Peroxiredoxin
|||||||||-||||||||||||||--|||||||||||||---|||||-||||||||||||||||-|  1    [K    R]    COG0454 Histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases
|||||||||||||||-||||||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [F]    COG0461 Orotate phosphoribosyltransferase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0465 ATP-dependent Zn proteases
--|----------||-||--||||||----|-----||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0466 ATP-dependent Lon protease, bacterial type
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0468 RecA/RadA recombinase
-|||||||--||||||-|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||--||||||--  1    [G]    COG0469 Pyruvate kinase
|||||||||||||||||||||||||-||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0470 ATPase involved in DNA replication
||-|--||-||--||-|-|--|||--|---|||||-||----|||||-||||||||||||||----  1    [P]    COG0471 Di- and tricarboxylate transporters
||----||-|||-||-||||||||||||||||||||||----|||||||||||||||||||||-||  1    [M]    COG0472 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||  1    [G    E    P    R]    COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily
||-|||--|||||||-|-||-|||--||||----|-||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG0479 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, Fe-S protein subunit
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0480 Translation elongation factors (GTPases)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0481 Membrane GTPase LepA
-------------||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0482 Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain
|-||||-------|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0484 DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain
-------------||-||||||||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0486 Predicted GTPase
-------------|||--||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0488 ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains
||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0492 Thioredoxin reductase
|-||||--|-|||||||||||||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L    R]    COG0494 NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0495 Leucyl-tRNA synthetase
||||----|||-||--||||-||||-----------------|||||-||||||||||||||||--  1    [R]    COG0496 Predicted acid phosphatase
|||------|---||-|||||--|--|||||---|-||----||||||||||||||||||-|||--  1    [H]    COG0502 Biotin synthase and related enzymes
||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||--||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0504 CTP synthase (UTP-ammonia lyase)
---|||||---||||-||||-|||---|||--|-||||-|--|||||-||--||||---|||||--  1    [E]    COG0509 Glycine cleavage system H protein (lipoate-binding)
|||---|||--|-||-|||||||||-||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0511 Biotin carboxyl carrier protein
|||||||||||||||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0517 FOG: CBS domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0518 GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain
|||||||||||||||-||||||-|-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [F]    COG0519 GMP synthase, PP-ATPase domain/subunit
|-||--||-|-||-|--||||||||||||||||||||||||||||||-|||||--|||||||||--  1    [E]    COG0520 Selenocysteine lyase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0522 Ribosomal protein S4 and related proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0525 Valyl-tRNA synthetase
|||||-|||||||||-||||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0527 Aspartokinases
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0528 Uridylate kinase
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0532 Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0533 Metal-dependent proteases with possible chaperone activity
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0536 Predicted GTPase
|||||||||-|||||||-||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F    G    R]    COG0537 Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases
-------------||-||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0539 Ribosomal protein S1
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0541 Signal recognition particle GTPase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0544 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)
-------------||---||-||||-|---------------||||||||||||||-------|--  1    [O]    COG0545 FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 1
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0550 Topoisomerase IA
|||||||||--------|--|-|||-----|||||||||-|||||||||||||||||||-------  1    [L]    COG0551 Zn-finger domain associated with topoisomerase type I
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0552 Signal recognition particle GTPase
|-||------------|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0556 Helicase subunit of the DNA excision repair complex
---|---------||||||||||||-|---||||||||||||||||||||||||||||||||||--  1    [K]    COG0557 Exoribonuclease R
|||||||||||-|||-----|--|--||||||----------|||||-||||||||||||||||--  1    [E]    COG0560 Phosphoserine phosphatase
|-||||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||-||-|||---||-|---  1    [R]    COG0561 Predicted hydrolases of the HAD superfamily
--||--|||----|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [F]    COG0563 Adenylate kinase and related kinases
--------|----||-|||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [J]    COG0566 rRNA methylases
-------------||------|||--||||----|-||----||||||||||||||---|||||||  1    [C]    COG0567 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, and related enzymes
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0568 DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0571 dsRNA-specific ribonuclease
---|---------||--|||-|-|||----|||||||||-|||||||-|-||--------------  1    [F]    COG0572 Uridine kinase
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [I]    COG0575 CDP-diglyceride synthetase
|-||||-------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0576 Molecular chaperone GrpE (heat shock protein)
||||----||||-----||||||||-|||-||||||||----|||||-||-|-|||--||||||--  1    [V]    COG0577 ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0587 DNA polymerase III, alpha subunit
--|----------||-----|-||||||||||||||------||||||--||||||----||||--  1    [G]    COG0588 Phosphoglycerate mutase 1
--|----------||||-||-|||--||||||-|||||----||||||||||||||---|||||||  1    [F    J]    COG0590 Cytosine/adenosine deaminases
|-|||||||--||||---|-|--|--|------||-||----|||||-||||-||||||||||-||  1    [E    R]    COG0591 Na+/proline symporter
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0592 DNA polymerase sliding clamp subunit (PCNA homolog)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||  1    [J]    COG0594 RNase P protein component
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M    U]    COG0597 Lipoprotein signal peptidase
-||-----||-------|||||||--|---|--||-||----||||---|||---|---|||||--  1    [P]    COG0600 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component
|-||||----|||||||-||-|||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [P]    COG0605 Superoxide dismutase
||||||||||||----|||||||||||---||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0608 Single-stranded DNA-specific exonuclease
|||||||||-|-|---|||||||||-||||-----|||----||||||||||||||||||||||||  1    [O    U]    COG0616 Periplasmic serine proteases (ClpP class)
----------------|-||-|||---|||-|--||||----|||-||-|||-|||||||||||||  1    [I]    COG0623 Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH)
-|--|||||||||||-||--||-|--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [E]    COG0624 Acetylornithine deacetylase/Succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0629 Single-stranded DNA-binding protein
-----|-------||-|-||-|||--||||||||||||||||-------|--|--||--|--|---  1    [T]    COG0631 Serine/threonine protein phosphatase
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0632 Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit
---|---------||||-||-|||--|---------------||||||||||-|||---|||||||  1    [C]    COG0633 Ferredoxin
||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [C]    COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K
--|-|||---||-||--|||-|||--|||||||-||||-|--|||||-||||||||---|||||--  1    [R]    COG0637 Predicted phosphatase/phosphohexomutase
|-||----|----||-||||||||-|||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [T]    COG0642 Signal transduction histidine kinase
||||||||--||||||||----||---||||---|||||||||||||||-----------------  1    [L]    COG0648 Endonuclease IV
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
----------------|||||||||||||-|||||||||||||||||-||||||||||||||||-|  1    [R]    COG0658 Predicted membrane metal-binding protein
--|----------||||-||--||--||||-|---|||----|||-|-||-|---|||-||-|---  1    [P]    COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily)
-------------||||||||||||-|||||||-||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [T]    COG0664 cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases
--|||||||-|||||-|-||-|||-|||||||||-|||----|||||-||||||||||||||||--  1    [E]    COG0665 Glycine/D-amino acid oxidases (deaminating)
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0681 Signal peptidase I
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0682 Prolipoprotein diacylglyceryltransferase
||||----||---||-----||||---||||-----||----|||||-|||||||||||||||-||  1    [I]    COG0688 Phosphatidylserine decarboxylase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0690 Preprotein translocase subunit SecE
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG0691 tmRNA-binding protein
-------------|||----||||-|||||-||||||||||||||||||||||||||||||-----  1    [L]    COG0692 Uracil DNA glycosylase
---|----|----||---||--||----------||||----|||||||||||---||||||||||  1    [O]    COG0694 Thioredoxin-like proteins and domains
--|----------||-||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [E]    COG0703 Shikimate kinase
-------------||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG0706 Preprotein translocase subunit YidC
--|------|-|----||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0707 UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase
||||||-|||||-||-|-----||-------||||||-----|||-|------||-----------  1    [E]    COG0710 3-dehydroquinate dehydratase
-||-----||---||--|||||||--|---|--||-||----||||--||||---|---|||||--  1    [P]    COG0715 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components
|||||||||||||---|-||--||--|||||------|----||||||-|||||||||||||||||  1    [F]    COG0717 Deoxycytidine deaminase
-----------------|||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [S]    COG0718 Uncharacterized protein conserved in bacteria
||||----||-||---||||||||||||||||||||||--||-------|---|||||||||||||  1    [J]    COG0721 Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit
--|--|-|-|---|||-|||||||---|||||||||||----|||||-||--|--|||-|||||--  1    [G]    COG0726 Predicted xylanase/chitin deacetylase
----------------|||||||||||||||-----------||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG0728 Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
-|||--|||-------|---|-|||-|------|||||----------|-||-||-|||-------  1    [R]    COG0733 Na+-dependent transporters of the SNF family
-------------||-||--|||||||||||||||||||||||||||||----|||||||||||||  1    [I]    COG0736 Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)
-----------------|||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0742 N6-adenine-specific methylase
----------------|||||||||-|||||----|||----|||||||||||||||||||--|--  1    [I]    COG0743 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase
----------------||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [T    K]    COG0745 Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain
-------------|--||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains
|||||||||||||---||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0750 Predicted membrane-associated Zn-dependent proteases 1
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0751 Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit
----------------|||||-||-------|||-|||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0752 Glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit
-------------||||---|-|||-||||||||-||-----||||||-|||||||||-|||||||  1    [F]    COG0756 dUTPase
----------------||||||||||-||-||||||||----|---|-|||||||||||||||||-  1    [S]    COG0759 Uncharacterized conserved protein
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1    [I    M]    COG0761 Penicillin tolerance protein
-----------------||||-||||||||||||||||----|||||-||||---||||||-||--  1    [S]    COG0762 Predicted integral membrane protein
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0763 Lipid A disaccharide synthetase
----------------||||||||------||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I]    COG0764 3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratases
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1    [E]    COG0765 ABC-type amino acid transport system, permease component
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0766 UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0769 UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase
|||------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0770 UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase
|--------|------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0771 UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0773 UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0774 UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase
----||----------||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0776 Bacterial nucleoid DNA-binding protein
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0777 Acetyl-CoA carboxylase beta subunit
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0781 Transcription termination factor
-----------------|---|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG0782 Transcription elongation factor
------------------||-|||--||||||---|||----|||||-||||||||||||||||--  1    [M]    COG0791 Cell wall-associated hydrolases (invasion-associated proteins)
----||----||----||||||||||----|---||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0793 Periplasmic protease
|||---|||||||---|---|-||------|---|||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG0794 Predicted sugar phosphate isomerase involved in capsule formation
----------------||||-|||||||||-|||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG0799 Uncharacterized homolog of plant Iojap protein
-------------||-||||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||-|  1    [H]    COG0801 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase
----------------||||||||||||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG0802 Predicted ATPase or kinase
----||--|----||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG0807 GTP cyclohydrolase II
|-|------|------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0811 Biopolymer transport proteins
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG0812 UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase
----------------||||-|||||||||------------|||||-||||-|||||||||||||  1    [M]    COG0815 Apolipoprotein N-acyltransferase
----------------||||||||--|||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG0816 Predicted endonuclease involved in recombination (possible Holliday junction resolvase in Mycoplasmas and B. subtilis)
-----------------||||||||-||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG0817 Holliday junction resolvasome, endonuclease subunit
----------------|||||||||-|||||-----||----||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG0821 Enzyme involved in the deoxyxylulose pathway of isoprenoid biosynthesis
--||----|----|||||-||-||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||  1    [C]    COG0822 NifU homolog involved in Fe-S cluster formation
--|-----|---------||--||------------------|||||-|||||--|||||||||||  1    [U]    COG0823 Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
----------------|-||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [I]    COG0825 Acetyl-CoA carboxylase alpha subunit
----------------|-||--||||----|||||||||-||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0828 Ribosomal protein S21
----------------|-||||||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [U]    COG0848 Biopolymer transport protein
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG0858 Ribosome-binding factor A
----------------|-|||||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||--  1    [M]    COG0860 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
-------------|||------||------------------|||||-||----------------  1    [O]    COG1025 Secreted/periplasmic Zn-dependent peptidases, insulinase-like
-------------||------|||||----|-----------------------------------  1    [R]    COG1026 Predicted Zn-dependent peptidases, insulinase-like
--|||||||-||||||||||||||--||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [I    Q    R]    COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
----------------|-----||-------||||||-||||------------------------  1    [L]    COG1039 Ribonuclease HIII
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1043 Acyl-[acyl carrier protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase
----------------|-|||-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1044 UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase
||-|||--|||||||-||||||||--||||||--||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [C]    COG1053 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit
------------------||-|||--|----||||||-----||||||||--|--|---|||||||  1    [R]    COG1054 Predicted sulfurtransferase
----|||||-|||----||||-||---|||----||||----||||--||---|||--||--|---  1    [P]    COG1055 Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases
----------------|||||||||-|||-|||-||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1066 Predicted ATP-dependent serine protease
--------------------|-||||-||-||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1074 ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit (contains helicase and exonuclease domains)
|---||--||------||-||-||||----|----|||----|||||-|||||--||||----|||  1    [D]    COG1077 Actin-like ATPase involved in cell morphogenesis
--------------------||||-||---||||||||-|||||||||||||||||------||--  1    [G]    COG1080 Phosphoenolpyruvate-protein kinase (PTS system EI component in bacteria)
-|----||-|--|---||--||||-------||||||-----||||||||||||||---||||---  1    [R]    COG1092 Predicted SAM-dependent methyltransferases
--------------------|-|||-|---|-|||-|-----|||||-||||--------------  1    [E]    COG1114 Branched-chain amino acid permeases
-||-||--||||-----|||||||--|---|--||-||----||||---||||--|---|||||--  1    [P]    COG1116 ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component
--|--|--------------|-||--------|-|--|||--|||||------------||||---  1    [E    P]    COG1124 ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component
--|-----|-|-|----|||||||--|---||||||||----|||||-|||--|||||||||||||  1    [E]    COG1126 ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component
--||--||--||-|||||||||||--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [V]    COG1132 ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
------------------||||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG1135 ABC-type metal ion transport system, ATPase component
||||----|||||---|||||||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [V]    COG1136 ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component
----------------||||||||||----------------|||||-||||||||||||||||||  1    [R]    COG1137 ABC-type (unclassified) transport system, ATPase component
----------------|||||||||-||||||---|||----||||||||||||||||||||||--  1    [H    I]    COG1154 Deoxyxylulose-5-phosphate synthase
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1155 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit A
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1156 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit B
----------------||--|||||||||||---||||----||||||||||||||||||||||||  1    [K]    COG1158 Transcription termination factor
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [R]    COG1160 Predicted GTPases
--||-------------|--||||||-----|||||||||||------|-------||||||||--  1    [E]    COG1164 Oligoendopeptidase F
--|-------------||||||||||||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1181 D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes
||||----||---||-----|-||-|-||||-----||-----------|--|||||||||||-||  1    [I]    COG1183 Phosphatidylserine synthase
-------------||-||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1185 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)
-------------||-|||||||||||||||||-||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1186 Protein chain release factor B
----------------||||||||||||||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1187 16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase and related pseudouridylate synthases
--|-------||-|||||||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||-----  1    [J]    COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II)
----------------||||--|||--||-|---||||----|||||-||-----||||-------  1    [K]    COG1191 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit
||-|-|||-|||----|-||-||||||||||----|||--|||||||-||--||||||||||||||  1    [D]    COG1192 ATPases involved in chromosome partitioning
|--|------|-|-|------||||-||||||||||||----||||||||||||||||||||||--  1    [L]    COG1194 A/G-specific DNA glycosylase
-----------------|||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L    K]    COG1197 Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)
----------------||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1198 Primosomal protein N' (replication factor Y) - superfamily II helicase
------|---------|||||||||-|||||--|||||--||||||||||||||||||||||||--  1    [I]    COG1211 4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erithritol synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1212 CMP-2-keto-3-deoxyoctulosonic acid synthetase
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1214 Inactive homolog of metal-dependent proteases, putative molecular chaperone
-------------||-|-||--||--||||------------|||||||||||-----||||||||  1    [P]    COG1218 3'-Phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase
-------------|--||||||||||||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [O]    COG1219 ATP-dependent protease Clp, ATPase subunit
--||--|-|-|--||-|----|||--||||----||||-------|---------|-------|--  1    [H]    COG1232 Protoporphyrinogen oxidase
||||||||||||||||-|||-|||||||||||||||||----|||-|----|---|------||--  1    [R]    COG1234 Metal-dependent hydrolases of the beta-lactamase superfamily III
||||||--|||||||-||||||||--||||-|||||||-|||||||||||||||||---|||||||  1    [C]    COG1249 Pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes
--||----|-|||---||||--||--||||------------------------------------  1    [S]    COG1259 Uncharacterized conserved protein
--|-----------|---||--||---||-------||----------||-|||||---|||||--  1    [S]    COG1262 Uncharacterized conserved protein
|-||--||--|-|---|||||||||||||-||||||||-----||||-||-----|------||--  1    [R]    COG1266 Predicted metal-dependent membrane protease
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1269 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
--||||--|-------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1    [C]    COG1271 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 1
----||||---|----------|||-||||-------------------------|----------  1    [C]    COG1274 Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)
---------|-------|--|-||-|----||||||||||||------|----------|||----  1    [S]    COG1284 Uncharacterized conserved protein
--||------------|-||--||--|||--|--||||----|||||-||||---|--||||||||  1    [C]    COG1294 Cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2
--|-------------|-||||||--||||||||||||-|--|||||-||||||||||||||||||  1    [S]    COG1295 Predicted membrane protein
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1    [N    U]    COG1298 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhA
-----------------|--||||------||||||||----------------------------  1    [S]    COG1302 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------|-|||||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1314 Preprotein translocase subunit SecG
-----------------|----||||----|-----||----||||||||-----||||---|---  1    [N    U]    COG1317 Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein
|||||||||||||----|---||||-||||||||||||----|||-|-----|---------|---  1    [K]    COG1321 Mn-dependent transcriptional regulator
----------------------||-------|||-----|--|||||-||||||||---|||||||  1    [S]    COG1322 Uncharacterized protein conserved in bacteria
|-|-|||||||-|--|||-|-|-|------------------|||||-----|--|--------||  1    [P]    COG1324 Uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations
-----------------||-||||--||||||||||||----|||||-||||||||---|||||--  1    [K]    COG1327 Predicted transcriptional regulator, consists of a Zn-ribbon and ATP-cone domains
----------------------||-|-||-------------|||||||||||||-----------  1    [L]    COG1330 Exonuclease V gamma subunit
|-||||--|-|||---|--|-|||---||-|-----|------------------------||---  1    [O]    COG1331 Highly conserved protein containing a thioredoxin domain
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1    [N    U]    COG1338 Flagellar biosynthesis pathway, component FliP
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG1347 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrD
---|||||--|||---||||--|||||||||-------------------------|||-----||  1    [F]    COG1351 Predicted alternative thymidylate synthase
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1    [N    U]    COG1377 Flagellar biosynthesis pathway, component FlhB
------------------|||||||-||||||||||||||--|||||-||||||||---|||||||  1    [L]    COG1381 Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)
|||||||||||-||||----||||||----------------------------------------  1    [C]    COG1390 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit E
|||---|||--|-----|---|||------|---|||-----------||||---|---||-|---  1    [P]    COG1392 Phosphate transport regulator (distant homolog of PhoU)
||||||||||||||||----||||||------||--------------------------------  1    [C]    COG1394 Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit D
|-|-------|-----|--|-|||--||||||---|||----|------------||||-|-|---  1    [R]    COG1408 Predicted phosphohydrolases
|-|---|||||-|||-|-||--||--||||||--|||-----|||||-||||---|---|||||--  1    [R]    COG1409 Predicted phosphohydrolases
-----------------||||-||--||||||||||||||||----------|--|||||||||--  1    [K]    COG1420 Transcriptional regulator of heat shock gene
-----------------|-|--||||-----|||||||----|||||-|||||--|--------||  1    [S]    COG1426 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----||--|-|-|---|----|||-------------|------------------|||-------  1    [R]    COG1427 Predicted periplasmic solute-binding protein
-----------------|---|-|--||||||||||||----|||||-|-||--------------  1    [K]    COG1438 Arginine repressor
-------------||-----|-||------------------|||||-||||||||----|-|---  1    [E]    COG1448 Aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||------||--  1    [N    U]    COG1459 Type II secretory pathway, component PulF
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG1464 ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen
----------------||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG1466 DNA polymerase III, delta subunit
||-|--|||-|||---|--|-|||||||||||||||||----|||||-||--||||||||||||||  1    [K]    COG1475 Predicted transcriptional regulators
--|-------------||--|||||-----||||-|------|||||-||||||||----||||--  1    [H]    COG1477 Membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis
||||----||------------||---|||--|---------------------------------  1    [S]    COG1478 Uncharacterized conserved protein
-----------------||||--||-----|----|||----------------------------  1    [R]    COG1480 Predicted membrane-associated HD superfamily hydrolase
---------------------|||------------||----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1495 Disulfide bond formation protein DsbB
----------------|-||||||-||||||---|-||----|||||-||||||||--||||||||  1    [S]    COG1496 Uncharacterized conserved protein
----------------|-----||||----|----|||----|||||-||--||||||||||||--  1    [K]    COG1508 DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma54 homolog
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1519 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
--|--------|-----||-||||--|||-|-||--||-|--|||||-||||---|---||-|---  1    [G]    COG1523 Type II secretory pathway, pullulanase PulA and related glycosidases
---|--||-||||---|||||-||--|||||----|-|----||||||||||||||---|||||||  1    [J]    COG1530 Ribonucleases G and E
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1    [N]    COG1536 Flagellar motor switch protein
-------------||---||||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [H]    COG1539 Dihydroneopterin aldolase
----------------||||||-|-|||||||||||||----|||||-|||||--|---|||||||  1    [J]    COG1544 Ribosome-associated protein Y (PSrp-1)
--------------------|-||--||||------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1560 Lauroyl/myristoyl acyltransferase
-----------------|-|||||--||||||||||||----|||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG1570 Exonuclease VII, large subunit
----------------|----|||||||-||-------------------------|||-------  1    [R]    COG1579 Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding
||||||--||||-||-|-||||||--|||||---||||----|||||-||-||||||||||||---  1    [H]    COG1587 Uroporphyrinogen-III synthase
---|||----|||--------|||--|-------||||----||||||||||-|||||||||||--  1    [I]    COG1607 Acyl-CoA hydrolase
--|-||||||||-|--||-|||||--||||-|--|-||----|||||-||-|||||--||||||--  1    [R]    COG1611 Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein
-|||--||||------|-||-|||||----||||||||-|||------------------------  1    [S]    COG1624 Uncharacterized conserved protein
----------|-----|-||||||-||||--|||--------|||||-||||---|----------  1    [G]    COG1640 4-alpha-glucanotransferase
---|----|-|-----|-||-|||--||||----|||-----|||||-||||||||||||||||||  1    [O]    COG1651 Protein-disulfide isomerase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG1663 Tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase
----------------------||||----|-----|--------|--||--|--||||----|--  1    [M]    COG1664 Integral membrane protein CcmA involved in cell shape determination
-------------------|-||||||||||||||||||---|||||-||||||||||||||||||  1    [D]    COG1674 DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related proteins
---------------------|||--||||------------|||||-||||||||---|||||||  1    [K]    COG1678 Putative transcriptional regulator
--------------------|-||||||||||||||||----|||||-||||||||---|||||||  1    [M]    COG1686 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase
--|---|||||||---|||||||||||||-||--||||----|||||-|||||------|||||-|  1    [R]    COG1694 Predicted pyrophosphatase
----------||-||---||-|||--|||||------|--------------|-------------  1    [T]    COG1716 FOG: FHA domain
-------------|||---|--||----------------------------------------||  1    [S]    COG1723 Uncharacterized conserved protein
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG1726 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrA
----------------|-----||||----|-----||----||||||||||||||--||||||||  1    [T]    COG1734 DnaK suppressor protein
----------------------||||----------------------------------------  1    [S]    COG1747 Uncharacterized N-terminal domain of the transcription elongation factor GreA
---------------------|||------|-----------------------------------  1    [R]    COG1768 Predicted phosphohydrolase
----------------|--||-||||----||-|||||----|||||-|||||--||||----|||  1    [M]    COG1792 Cell shape-determining protein
------------------||--||---------------------|--||||-||-------|---  1    [C]    COG1805 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrB
----------------||||-|||||||||----||||----||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG1825 Ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)
||||--||||-||---|--|--||------------------|||||----|-------||-|---  1    [G]    COG1830 DhnA-type fructose-1,6-bisphosphate aldolase and related enzymes
----------------||--|-||-|||||||||||||----||||||||||||||||||||||||  1    [U]    COG1862 Preprotein translocase subunit YajC
|||----|||--|------|--||----|-------------|||||-|--|-------|--||||  1    [S]    COG1872 Uncharacterized conserved protein
-----------------|----||--||||------||----------||--|--|----------  1    [T]    COG1875 Predicted ATPase related to phosphate starvation-inducible protein PhoH
|-|||||||--|-|--|-----||--|||||---|-|-|---|||-|-|--|||||||-||-|--|  1    [R]    COG1881 Phospholipid-binding protein
----------------||----||||----|----|||----||||||||-----|||||||||--  1    [N    U]    COG1886 Flagellar motor switch/type III secretory pathway protein
--------------------|||||||---||||||||||||||||||||||||||---|||||--  1    [G]    COG1925 Phosphotransferase system, HPr-related proteins
||||||||||------------||------------------------------------------  1    [S]    COG1945 Uncharacterized conserved protein
||||----|||||||-||||||||--||||||-||-||----||||||||||||||||||||||--  1    [H]    COG1985 Pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis
---|||--|-|-|||------|||---|||----|-||----|||||-||--||||||||||||||  1    [C]    COG2009 Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, cytochrome b subunit
--------------------||-||-|---||||||||----|||||-||||||||||||||||--  1    [P]    COG2011 ABC-type metal ion transport system, permease component
------------|--|-----|-|-|-||||---|||------------|---------||-|-||  1    [L]    COG2094 3-methyladenine DNA glycosylase
----||--|-|||---|----|||-------------|------------------|||-------  1    [R]    COG2107 Predicted periplasmic solute-binding protein
--|-------------------||------|-----||----------------------|-|-|-  1    [S]    COG2155 Uncharacterized conserved protein
----------------||||||||------||||||||----|||||-|||||--|--|---||--  1    [N    U]    COG2165 Type II secretory pathway, pseudopilin PulG
------------------||-|||---||-------------|||||-|||||------|||||--  1    [R]    COG2166 SufE protein probably involved in Fe-S center assembly
-----------------|||-|||---||-|---||||----------------------------  1    [T]    COG2172 Anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)
|-||----|-----|-||||-|||-||||||----|||----|||||-||--|--|--||||||--  1    [T]    COG2202 FOG: PAS/PAC domain
----------------|---|-||||-----------|----|||||-||-|||||||||||||||  1    [T]    COG2204 Response regulator containing CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains
-----------------||||-|||--||-|---||||----------||----------|-|---  1    [T    K]    COG2208 Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG2209 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrE
|-||||-||-|||||-|||||||||-|||||||||||||---|||||-||||-|||||||||||--  1    [P]    COG2217 Cation transport ATPase
--|-||----||-||-||||||||--||||----||||----|||||-||-|||||||||||||||  1    [H]    COG2226 Methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis
|----------------||||-|||||||-|---|-||||-----|--||--|||----|||||||  1    [P]    COG2239 Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
-----------------||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||||||  1    [L]    COG2255 Holliday junction resolvasome, helicase subunit
-|||--||-||||---||||||||--||||||||||||----|||||-||-|||||---|||||--  1    [R]    COG2262 GTPases
------||-----||-||||||||--|||-||||||||----|||||-||||||||--||||||--  1    [J]    COG2265 SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase
----------------------||-------||-|-|-----|||||-||||------|-----||  1    [G]    COG2271 Sugar phosphate permease
------||--|||-|------|||-----------|-|-----------|-----|---|||||--  1    [E]    COG2355 Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase homolog
----------------||||||||------||||||||----|||||-||||||||--|---||--  1    [N    U]    COG2804 Type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB
----------------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [L]    COG2812 DNA polymerase III, gamma/tau subunits
----------------||---|||||----------------|||||-||||-|||-------|||  1    [M]    COG2825 Outer membrane protein
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG2869 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrC
----------------------||---------------------|--||||-||-----------  1    [C]    COG2871 Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF
----||-|--|||----|||||||------|-|-||||---------------|------------  1    [E]    COG2876 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate (DAHP) synthase
----------------|---|-||------------------|||||-||||||||||||||||||  1    [M]    COG2877 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) 8-phosphate synthase
----------------|--||-||||-||-------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG2885 Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  1    [J]    COG2890 Methylase of polypeptide chain release factors
-------------------|--||------------------|||||||||||--|-------|--  1    [S]    COG2912 Uncharacterized conserved protein
---|---------------||-||-------------|-----------|--||||---||-|---  1    [S]    COG2928 Uncharacterized conserved protein
--|----------|||------||----------------------------|--|------|---  1    [R]    COG2940 Proteins containing SET domain
----------------|---|-||--|-----||--------------||-----|---||||-||  1    [R]    COG2984 ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component
-----------------------|------|---||||----|||||-|||||||----|||||||  1    [S]    COG3027 Uncharacterized protein conserved in bacteria
-----------------------|------------------------||-----|------||--  1    [E]    COG3186 Phenylalanine-4-hydroxylase
----------------------||------------||----||||||||-----|----------  1    [N]    COG3190 Flagellar biogenesis protein
----------------------||------------|-----|||-|-||---||-----------  1    [R]    COG3318 Predicted metal-binding protein related to the C-terminal domain of SecA
----------------------||------|---||||----------------------------  1    [E]    COG3869 Arginine kinase
----------------------||------|-----||----------------------------  1    [S]    COG3876 Uncharacterized protein conserved in bacteria
----------------------||------|---||||----------------------------  1    [S]    COG3880 Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs
----------------------||----------------------------|------|--|---  1    [S]    COG3952 Predicted membrane protein
----------------------||------------------|||||-||||||||--|----|--  1    [O    C]    COG4232 Thiol:disulfide interchange protein
----------------------||----------------------|------------|||||--  1    [O    C]    COG4233 Uncharacterized protein predicted to be involved in C-type cytochrome biogenesis
-------------|||------||-|--------|-------------------------------  1    [G]    COG4284 UDP-glucose pyrophosphorylase
-------------||-------||-----------------------------------------|  1    [S]    COG4285 Uncharacterized conserved protein
-------------|||------||-----------------------------------|------  1    [S]    COG4286 Uncharacterized conserved protein related to MYG1 family
--|||||||-|||---||--||||-||---||||||||-||||||||-||||---||||||||---  1    [E]    COG4608 ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component
----------------------||-------------------||||--|-----|------|---  1    [U]    COG4669 Type III secretory pathway, lipoprotein EscJ
-------------||-||||||||||----------------||||||||||||||||||||||||  1    [M]    COG4775 Outer membrane protein/protective antigen OMA87
----------------------||-------------------||||--|-----|------|---  1    [U]    COG4789 Type III secretory pathway, component EscV
----------------------||-------------------||||--|-----|------|---  1    [U]    COG4791 Type III secretory pathway, component EscT
----------------------||-------------------||||--|-----|------|---  1    [U]    COG4794 Type III secretory pathway, component EscS
----|------|----------||-------------------------|----------|----|  1    [H]    COG5424 Pyrroloquinoline quinone (Coenzyme PQQ) biosynthesis protein C
----------------------||-----------------------------------|||||--  1    [S]    COG5465 Uncharacterized conserved protein
||||---|||---||-|||||||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  0    [E]    COG0133 Tryptophan synthase beta chain
||||||-||||||||-||||-||---|---||-|||||----||||||||||||||||||||||--  0    [E]    COG0135 Phosphoribosylanthranilate isomerase
||||||-||||||||-||||-||---||||||-|||||----||||||||||||||||||||||--  0    [E]    COG0159 Tryptophan synthase alpha chain
----------|-------|||||-|-||||||||||||----|||||-|||||------|||||||  0    [L]    COG1195 Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)
|-||--|||--------||||||-|-|---||||||||---------------------||||-||  0    [R]    COG1268 Uncharacterized conserved protein
||--|||||||||||--|---||---|----|-----------------|------------||--  0    [S]    COG1814 Uncharacterized membrane protein
----------------|||||||-|-|||||---|||||---||||||||||||||||||||||--  0    [I]    COG1947 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol 2-phosphate synthase
----------------------|-------------------|||||-|-|||-------------  0    [K]    COG2973 Trp operon repressor

Top of page

---

Usablenet Assistive is a UsableNet product. Usablenet Assistive Main Page.